[發(fā)明專利]臨床樣品中的干擾素響應(yīng)(IRIS)無(wú)效
| 申請(qǐng)?zhí)枺?/td> | 200980141815.9 | 申請(qǐng)日: | 2009-09-16 |
| 公開(公告)號(hào): | CN102197143A | 公開(公告)日: | 2011-09-21 |
| 發(fā)明(設(shè)計(jì))人: | 愛(ài)德華·克羅茲;佩德羅·帕茲;沙林·維利奇科;山口健;T·C·瓦格納 | 申請(qǐng)(專利權(quán))人: | 拜耳醫(yī)藥保健有限公司 |
| 主分類號(hào): | C12Q1/68 | 分類號(hào): | C12Q1/68 |
| 代理公司: | 北京市柳沈律師事務(wù)所 11105 | 代理人: | 張文輝 |
| 地址: | 美國(guó)*** | 國(guó)省代碼: | 美國(guó);US |
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| 摘要: | |||
| 搜索關(guān)鍵詞: | 臨床 樣品 中的 干擾素 響應(yīng) iris | ||
1.一種可用于在受試者中評(píng)估多發(fā)性硬化(MS)的治療功效的陣列,其包含對(duì)一個(gè)或多個(gè)異常調(diào)節(jié)性基因和一個(gè)或多個(gè)反調(diào)節(jié)性基因特異性的多種探針,其中所述異常調(diào)節(jié)性和反調(diào)節(jié)性基因展現(xiàn)對(duì)引入的干擾素β-1B的響應(yīng),由此根據(jù)與所述治療前的基因表達(dá)相比時(shí)所述治療后的所述異常調(diào)節(jié)性或反調(diào)節(jié)性基因的基因表達(dá)變化來(lái)評(píng)估功效。
2.權(quán)利要求1的陣列,其中所述一個(gè)或多個(gè)異常調(diào)節(jié)性基因是通過(guò)缺口比率分析選擇的。
3.權(quán)利要求1-2中任一項(xiàng)的陣列,其中所述一個(gè)或多個(gè)異常調(diào)節(jié)性基因選自表3中所列的基因。
4.權(quán)利要求1-3中任一項(xiàng)的陣列,其中所述一個(gè)或多個(gè)反調(diào)節(jié)性基因選自表2中所列的基因。
5.權(quán)利要求1-4中任一項(xiàng)的陣列,其還包含從表1中所列的干擾素標(biāo)志物選擇的標(biāo)準(zhǔn)的干擾素標(biāo)志物。
6.權(quán)利要求1-5中任一項(xiàng)的陣列,其進(jìn)一步包含測(cè)定對(duì)照標(biāo)志物。
7.權(quán)利要求6的陣列,其中所述測(cè)定對(duì)照標(biāo)志物包括內(nèi)源基因和細(xì)胞譜系基因。
8.權(quán)利要求7的陣列,其中所述內(nèi)源基因選自下組:GAPDH和HPRT1。
9.權(quán)利要求7的陣列,其中所述細(xì)胞譜系基因選自下組:CD3e、CD14、CD19、ITGAX、NCAM、和CD16。
10.權(quán)利要求1-9中任一項(xiàng)的陣列,其中所述陣列是低密度微觀流體測(cè)定板。
11.一種使用權(quán)利要求1-10中任一項(xiàng)的陣列在受試者中評(píng)估多發(fā)性硬化的治療功效的方法。
12.一種用于評(píng)估多發(fā)性硬化的治療功效的方法,包括:
(a)測(cè)定一個(gè)或多個(gè)異常調(diào)節(jié)性基因和一個(gè)或多個(gè)反調(diào)節(jié)性基因的表達(dá)水平,其中所述異常調(diào)節(jié)性和反調(diào)節(jié)性基因在自用抗MS劑治療前的患者采集的第一生物學(xué)樣品中展現(xiàn)對(duì)引入的干擾素β-1B的響應(yīng);
(b)至少在自用所述抗MS劑的初始治療后的患者采集的第二生物學(xué)樣品中測(cè)定所述異常調(diào)節(jié)性基因和反調(diào)節(jié)性基因的表達(dá)水平;并
(c)比較所述異常調(diào)節(jié)性和反調(diào)節(jié)性基因在所述第二生物學(xué)樣品中的表達(dá)水平與所述異常調(diào)節(jié)性和反調(diào)節(jié)性基因在所述第一生物學(xué)樣品中的表達(dá)水平;
其中與所述第一生物學(xué)樣品中的所述異常調(diào)節(jié)性或反調(diào)節(jié)性基因的表達(dá)水平相比,所述第二生物學(xué)樣品中的所述異常調(diào)節(jié)性或反調(diào)節(jié)性基因的表達(dá)水平變化指明所述治療的功效。
13.權(quán)利要求12的方法,其中所述異常調(diào)節(jié)性和反調(diào)節(jié)性基因的表達(dá)水平變化創(chuàng)建與可測(cè)量的臨床響應(yīng)諸如MRI、復(fù)發(fā)率、疾病進(jìn)展、和失能得分(EDSS)相關(guān)聯(lián)的樣式,其中使用統(tǒng)計(jì)學(xué)方法來(lái)確定所述樣式。
14.權(quán)利要求12的方法,其中所述異常調(diào)節(jié)性基因選自表3中所列的異常調(diào)節(jié)性基因。
15.權(quán)利要求12的方法,其中所述反調(diào)節(jié)性基因選自表2中所列的反異常性基因。
16.權(quán)利要求12的方法,其中所述生物學(xué)樣品選自下組:血液、尿、骨髓、和活組織檢查樣品。
17.一種用于鑒定可用于治療多發(fā)性硬化的化合物的方法,包括:
(a)分析一個(gè)或多個(gè)異常調(diào)節(jié)性基因和一個(gè)或多個(gè)反調(diào)節(jié)性基因的表達(dá)水平,其中所述異常調(diào)節(jié)性和反調(diào)節(jié)性基因在用化合物處理前的細(xì)胞或組織樣品中展現(xiàn)對(duì)引入的干擾素β-1B的響應(yīng);
(b)分析所述異常調(diào)節(jié)性和反調(diào)節(jié)性基因在用所述化合物處理后的細(xì)胞或組織樣品中的表達(dá)水平;
其中所述異常調(diào)節(jié)性和反調(diào)節(jié)性基因的表達(dá)水平的變化指示藥物功效。
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