[發(fā)明專利]可維持從核苷酸模板酶促合成雙鏈核苷酸的非天然聚合酶底物及其使用的方法

無效

• 申請?zhí)枺?/td>: 200980125926.0
• 申請日: 2009-01-16
• 公開（公告）號: CN102124018A
• 公開（公告）日: 2011-07-13
• 發(fā)明（設計）人: S·M·門琴;B·羅森布盧姆;P·肯尼;S·I·罕;馬兆春;J·陳;林英聯(lián);黃波立
• 申請（專利權）人: 生命科技公司
• 主分類號: C07H19/073
• 分類號: C07H19/073;C07H21/04;C12Q1/68;C07H19/173
• 代理公司: 中國專利代理(香港)有限公司 72001
• 代理人: 孔青;郭文潔

1.一種由以下式(I)代表的化合物：

其中：

B是選自腺嘌呤、鳥嘌呤、胞嘧啶、尿嘧啶、胸腺嘧啶或他們各自的類似物的堿基；

L₁是在堿基B和F間形成鍵的基團；

F是在L₁和L₂間形成鍵的雜原子；

L₂就它與F的鍵合而言是化學上不穩(wěn)定基團，且與R₂成鍵；

L₃就它與F的鍵合而言是化學上不穩(wěn)定基團，且與R₂成鍵；

R₂是包含報道分子的基團；

R₁是抑制向延伸中的寡核苷酸3’末端摻入核苷三磷酸的模板定向聚合酶摻入反應速率的基團，這種抑制發(fā)生在L₂-R₂從先前摻入事件裂解之前；

L₂-R₂防止向已摻入式(I)化合物的延伸中的寡核苷酸3’末端經(jīng)模板定向聚合酶摻入反應摻入式(I)的化合物；

l是整數(shù)，及

m＝3l-1。

2.權利要求1的化合物，其中R₁是選自以下基團的中性形式的有機取代基：取代或未取代的烷基、取代或未取代的芳族基、取代或未取代的雜環(huán)、取代或未取代的芳族雜環(huán)、或其陰離子或陽離子形式。

3.權利要求2的化合物，其中化學上不穩(wěn)定基團L₂的裂解留下連接于堿基的具有末端基團F的連接子殘基部分。

4.權利要求3的化合物，其中末端基團F不是氨基。

5.權利要求3的化合物，其中末端基團F是羥基。

6.權利要求1的化合物，其中1是2或3。

7.權利要求1的化合物，其中該化合物具有下式(II)代表的結構：

8.權利要求1的化合物，其中L₂包含選自以下的化學上不穩(wěn)定基團：-C(O)-S-；-C(O)O-；-CH-(SCH₃)-Ph-和[RO]₂P(O)S-；其中Ph是取代的苯基或取代的芳環(huán)；而其中R₁是選自以下基團的中性形式的有機取代基：取代或未取代的烷基、取代或未取代的芳族基、取代或未取代的雜環(huán)、取代或未取代的芳族雜環(huán)、或其陰離子或陽離子形式。

9.權利要求2的化合物，其中L₁在堿基與雜原子F之間形成永久鍵合，而L₂在雜原子F和R₂之間形成短暫鍵合。

10.權利要求9的化合物，其中雜原子是O、S或N。

11.權利要求9的化合物，其中L₁包含下式代表的部分：

12.權利要求9的化合物，其中L₁包含下式代表的部分：

13.權利要求9的化合物，其中L₂-R₂包含下式代表的部分：

14.權利要求1的化合物，其中該化合物具有以下式(VI)代表的結構：

其中“染料”代表報道分子。

15.權利要求1的化合物，其中化學上不穩(wěn)定基團L₂經(jīng)Ag⁺活化從而裂解F-L₂。

16.權利要求1的化合物，其中L₂包含選自以下的部分：

17.權利要求1的化合物，其中L₂包含下式的部分：