[發明專利]染色體核苷酸序列圖示作圖法無效
| 申請號： | 200910197851.9 | 申請日： | 2009-10-29 |
| 公開（公告）號： | CN102054131A | 公開（公告）日： | 2011-05-11 |
| 發明（設計）人： | 鄭大立 | 申請（專利權）人： | 鄭大立 |
| 主分類號： | G06F19/26 | 分類號： | G06F19/26 |
| 代理公司： | 暫無信息 | 代理人： | 暫無信息 |
| 地址： | 200060 上海市*** | 國省代碼： | 上海;31 |
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| 摘要： | |||
| 搜索關鍵詞： | 染色體 核苷酸 序列 圖示 作圖 | ||
【權利要求書】：
1.一種顯示染色體核苷酸序列的方式，
區別于常規染色體核苷酸字符序列的顯示方式，染色體核苷酸序列圖示法是將字符序列進行數值轉換，成為數值序列，進而根據該數值序列來制作二維或三維染色體序列圖的顯示方式。
2.如權利要求1所述顯示方式，其特征在于二維平面點線圖示染色體核苷酸序列，和三維立體點線圖示染色體核苷酸序列。
3.如權利要求1所述顯示方式，其特征在于運用數學模型來轉換染色體核苷酸字符序列成為數值序列。
4.如權利要求1所述顯示方式，其特征在于，通過數學模型計算轉換，得到染色體核苷酸數值序列，以此來制作二維或三維染色體序列點線圖。
5.一種數學模型，
Vi＝bn*Vi-1+an*f(xi)
Vi：核苷酸序列中第i個核苷酸的數值；
an：核苷酸類型系數值，作用是擴大或縮小該類核苷酸作用值；
bn：核苷酸序列中第i-1個數值的修正系數，以反映臨近核苷酸對第i個核苷酸數值的影響；
f(xi)：第i個核苷酸數值賦值函數。
xi代表序列中第i核苷酸類型，如A、G、C、T
如最簡表述該函數，可以假設：f(Ai)＝1，f(Gi)＝1，f(Ci)＝-1，f(Ti)＝-1。?
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G06 計算；推算；計數
G06F 電數字數據處理
G06F19-00 專門適用于特定應用的數字計算或數據處理的設備或方法
G06F19-10 .生物信息學，即計算分子生物學中的遺傳或蛋白質相關的數據處理方法或系統
G06F19-12 ..用于系統生物學的建模或仿真，例如：概率模型或動態模型，遺傳基因管理網絡，蛋白質交互作用網絡或新陳代謝作用網絡
G06F19-14 ..用于發展或進化的，例如：進化的保存區域決定或進化樹結構
G06F19-16 ..用于分子結構的，例如：結構排序，結構或功能關系，蛋白質折疊，結構域拓撲，用結構數據的藥靶，涉及二維或三維結構的
G06F19-18 ..用于功能性基因組學或蛋白質組學的，例如：基因型–表型關聯，不均衡連接，種群遺傳學，結合位置鑒定，變異發生，基因型或染色體組的注釋，蛋白質相互作用或蛋白質核酸的相互作用
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