[發明專利]鉑類藥物療效相關基因mRNA表達檢測液相芯片和檢測方法

有效

• 申請號: 200910193800.9
• 申請日: 2009-11-10
• 公開（公告）號: CN101698886A
• 公開（公告）日: 2010-04-28
• 發明（設計）人: 許嘉森;郭元杰;羅彩英;吳詩揚;楊惠夷
• 申請（專利權）人: 廣州益善生物技術有限公司
• 主分類號: C12Q1/68
• 分類號: C12Q1/68;G01N21/64
• 代理公司: 廣州華進聯合專利商標代理有限公司 44224
• 代理人: 萬志香;曾旻輝

1.一種鉑類藥物療效相關基因mRNA表達水平檢測液相芯片，其特征是，主要包括有：

(1)與胺基修飾的支持探針偶聯的微球，每條支持探針主要包括5’端的間隔臂序列和3’端能與支持延伸探針互補配對的特異性序列P1，所述支持探針選自SEQ.NO.1-SEQ.NO.5，每個目標基因選用一種微球，每種微球具有不同的熒光編碼；

(2)連接支持探針與目標基因mRNA的支持延伸探針，每條支持延伸探針主要包括5’端能與對應的目標基因mRNA結合的特異性序列P2、間隔臂序列、3’端能與對應的支持探針的特異性序列P1互補配對的P3序列，所述支持延伸探針的特異性序列P2包括有：針對ERCC1基因的選自SEQ.NO.6-SEQ.NO.10中的2條或2條以上、和/或針對BRCA1基因的選自SEQ.NO.11-SEQ.NO.16中的2條或2條以上；以及針對B2M基因的選自SEQ.NO.17-SEQ.NO.21中的2條或2條以上，針對TFRC基因的選自SEQ.NO.22-SEQ.NO.26中的2條或2條以上，和針對TBP基因的選自SEQ.NO.27-SEQ.NO.31中的2條或2條以上；

(3)擴增延伸探針，每條擴增延伸探針包括5’端能與目標基因mRNA結合的特異性序列P4、間隔臂序列、3’端序列P5，3’端還修飾有生物素；所述擴增延伸探針的特異性序列P4包括有：針對ERCC1基因的選自SEQ.NO.32-SEQ.NO.41中的5條或5條以上、和/或針對BRCA1基因的選自SEQ.NO.42-SEQ.NO.53中的5條或5條以上；以及針對B2M基因的選自SEQ.NO.54-SEQ.NO.63中的5條或5條以上，針對TFRC基因的選自SEQ.NO.64-SEQ.NO.73中的5條或5條以上，和針對TBP基因的選自SEQ.NO.74-SEQ.NO.83中的5條或5條以上；所述P5為不存在發夾結構，探針內部和探針間不形成二聚體、不存在錯配、與P1、P2、P3、P4和總mRNA之間均不存在非特異性結合的序列。

2.根據權利要求1所述的鉑類藥物療效相關基因mRNA表達水平檢測液相芯片，其特征是，還包括有填充序列，包括：針對ERCC1基因的SEQ.NO.84、針對BRCA1基因的選自SEQ.NO.85-SEQ.NO.86中的一條或多條、針對B2M基因的選自SEQ.NO87-SEQ.NO.94中的一條或多條、和/或針對TFRC基因的選自SEQ.NO.95-SEQ.NO.98中的一條或多條。

3.根據權利要求1或2所述的鉑類藥物療效相關基因mRNA表達水平檢測液相芯片，其特征是，所述間隔臂序列為5-10個T。?

4.根據權利要求1所述的鉑類藥物療效相關基因mRNA表達水平檢測液相芯片，其特征是，所述P5的組成為CCTATGCCTCCCGTGTCTA。