[發明專利]一種α-葡萄糖苷酶基因的克隆與表達無效
| 申請號: | 200810244467.5 | 申請日: | 2008-12-05 |
| 公開(公告)號: | CN101434943A | 公開(公告)日: | 2009-05-20 |
| 發明(設計)人: | 陳堅;吳敬;童星 | 申請(專利權)人: | 江南大學 |
| 主分類號: | C12N9/26 | 分類號: | C12N9/26;C12N15/56;C12N15/81;C12N1/19;C12R1/84 |
| 代理公司: | 無錫市大為專利商標事務所 | 代理人: | 時旭丹;劉品超 |
| 地址: | 214122江蘇省無錫市蠡湖大道*** | 國省代碼: | 江蘇;32 |
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| 摘要: | |||
| 搜索關鍵詞: | 一種 葡萄 糖苷酶 基因 克隆 表達 | ||
1.一種α-葡萄糖苷酶基因的表達方法,其特征是由黑曲霉WX-07總DNA獲得aglu的cDNA?SEQ?ID?NO:1,aglu基因以質粒pPIC9K為表達載體,以畢赤酵母KM71為表達宿主,實現aglu基因的可溶性表達;
(1)黑曲霉WX-07總DNA的提取:
黑曲霉WX-07菌株在YPD液體培養基中培養2天,菌絲體過濾,再用無菌水沖洗三次,用無菌濾紙吸干水分,將菌絲體轉入研缽內,加液氮研磨得菌粉,將菌粉放入事先稱重的50mL離心管中,稱量1g菌粉,將由8.1816gNaCl、2g十二烷基磺酸鈉、10mL?500mmoL/L?EDTA、5mL?1mol/L?Tris-HCl緩沖液加水定容到100mL組成的抽提緩沖液在65℃水浴中預熱,按3mL/g菌粉加入抽提緩沖液,用封口膜封住,65℃放置1h,得菌液;吸取1.5mL菌液于滅菌的1.5mL離心管中,平行2管,10000r/min離心5min,吸上清0.75mL至新的1.5mL離心管中,加入0.75mL由50mL?10%CTAB、5.844gNaCl、10mL500mmol/LEDTA、25mL?1mol/L?Tris-HCl定容到100mL的5×CTAB溶液,然后再每管分成兩管,每管取0.6mL,分別加入0.6mL的酚/氯仿/異戊醇體積比25∶24∶1混合溶液,混勻,10000r/min離心10min;上清液吸入另一批新的離心管中,棄下層油相及中層蛋白;在這批離心管中分別加入等體積、0.4mL氯仿/異戊醇體積比24∶1混合溶液,顛倒混勻,10000r/min離心10min,吸取上清,重復以上步驟,直至無蛋白;加入等體積0.3mL異丙醇至上清液中,充分混勻,-20℃過夜,第二天,10000r/min,棄上清;用現配的70%的乙醇洗沉淀2次,倒掉乙醇,用無水乙醇洗沉淀1次,倒掉乙醇,室溫干燥20-30min;加50μL無菌水溶解沉淀,-20℃凍存;
(2)α-葡萄糖苷酶編碼基因的克隆:
以黑曲霉WX-07總DNA為模板,由于aglu基因是有四個外顯子和三個內含子,所以通過PCR和over-lap?PCR擴增出aglu基因,以下列八個核苷酸序列作為引物,下劃線為酶切位點Not?I:
引物1:5’-ATTAATGCGGCCGCGTCCACCACTGCCCCTTCG-3’
引物2:5’-CCGTAGAGGTTTTGGTCAATAGGTGTTC-3’
引物3:5’-ACCTATTGACCAAAACCTCTACGGCCA-3’
引物4:5’-TCAATATCGGTCCAGATATATTCCAAC-3’
引物5:5’-GAATATATCTGGACCGATATTGACTACATGCACG-3’
引物6:5’-CGTAGCGTAGGCATCAGAGGCATTTTC-3’
引物7:5’-GCCTCTGATGCCTACGCTACGTATGACA-3’
引物8:5’-AGCACTAGCGGCCGCCCATTCCAATACCCAGTTTTCC-3’?
第一輪PCR:
以黑曲霉WX-07總DNA為模板,分別以P1、P2;P3、P4;P5、P6;P7、P8為上下游引物,擴增出exon?1,exon?2,exon?3,exon?4;
PCR反應在50μL體系中進行:5×PCR緩沖液10μL,2.5mmol/L?dNTPs?4μL,10μmol/L上下游引物各1μL,模板DNA?1μL,Taq酶0.5μL,加雙蒸水至總體系50μL;
PCR反應條件為:在94℃變性4min后開始循環,然后94℃變性1min,55℃退火1min,72℃分別延伸1min、1min、1min和3min,共35個循環后,再于72℃延伸10min,擴增得到PCR片段,分別割膠回收,回收片斷與pMD18-Tsimple載體連接,連接產物轉化大腸桿菌JM109,轉化產物涂布含100mg/L氨芐青霉素的LB平板,經37℃培養過夜,挑選菌落,接入LB液體培養基,8~10h后提取質粒,將此質粒進行序列測定;
第二輪PCR:
以exon?2和exon?3為模板,以P3、P6為上下游引物,擴增得到exon?2-3;
PCR反應在50μL體系中進行:5×PCR緩沖液10μL,2.5mmol/L?dNTPs?4μL,10μmol/L上下游引物各1μL,exon?2和exon?3各1μL,Taq酶0.5μL,加雙蒸水至總體系50μL;
PCR反應條件為:在94℃變性4min后開始循環,然后94℃變性1min,55℃退火1min,72℃延伸1min,共35個循環后,再于72℃延伸10min,擴增得到PCR片段,分別割膠回收,回收片斷與pMD18-T?simple載體連接,連接產物轉化大腸桿菌JM109,轉化產物涂布含100mg/L氨芐青霉素的LB平板,經37℃培養過夜,挑選菌落,接入LB液體培養基,8~10h后提取質粒,將此質粒進行序列測定;
第三輪PCR:
以exon?2-3和exon?4為模板,以P3、P8為上下游引物,擴增得到exon?2-3-4;
PCR反應在50μL體系中進行:5×PCR緩沖液10μL,2.5mmol/L?dNTPs?4μL,10μmol/L上下游引物各1μL,exon?2-3和exon?4各1μL,Taq酶0.5μL,加雙蒸水至總體系50μL;
PCR反應條件為:在94℃變性4min后開始循環,然后94℃變性1min,55℃退火1min,72℃延伸3min,共35個循環后,再于72℃延伸10min,擴增得到PCR片段,分別割膠回收,回收片斷與pMD18-T?simple載體連接,連接產物轉化大腸桿菌JM109,轉化產物涂布含100mg/L氨芐青霉素的LB平板,經37℃培養過夜,挑選菌落,接入LB液體培養基,8~10h后提取質粒,將此質粒進行序列測定;
第四輪PCR:?
以exon?1和exon?2-3-4為模板,以P1、P8為上下游引物,擴增得到exon1-2-3-4;
PCR反應在50μL體系中進行:5×PCR緩沖液10μL,2.5mmol/L?dNTPs?4μL,10μmol/L上下游引物各1μL,exon?1和exon?2-3-4各1μL,Taq酶0.5μL,加雙蒸水至總體系50μL;
PCR反應條件為:在94℃變性4min后開始循環,然后94℃變性1min,55℃退火1min,72℃延伸4min,共35個循環后,再于72℃延伸10min,擴增得到全基因exon?1-2-3-4片段2880bp,割膠回收,回收片斷與pMD18-T?simple載體連接,連接產物轉化大腸桿菌JM109,轉化產物涂布含100mg/L氨芐青霉素的LB平板,經37℃培養過夜,挑選菌落,接入LB液體培養基,8~10h后提取質粒,命名為aglu/pMD18-T?simple,將此質粒進行序列測定;
(3)aglu基因在表達載體上的構建:
用于構建表達載體的質粒是pPIC?9K,帶有α-Factor信號肽,將pPIC?9K質粒和擴增的aglu基因進行Not?I酶切,酶切產物割膠回收后,再用T4連接酶16℃連接過夜,連接產物轉化E.coli?JM109感受態細胞,經37℃培養過夜,挑選轉化子于含100mg/L氨芐青霉素的LB平板進行液體培養,然后抽提質粒,得到富集的aglu/pPIC?9K質粒;
(4)畢赤酵母菌KM71轉化和篩選重組菌:
將表達載體aglu/pPIC?9K?17μL,10×H?buffer?2μL,Bgl?II?1μL,37℃酶切1.5h后回收含有目的基因的條帶,溶于20μL無菌水中,得到線性化的DNA;
在80μL畢赤酵母KM71感受態細胞中加入2μL線性化的DNA,混勻,轉入1mm預冷的電轉杯中,將電轉化儀調至畢赤酵母檔,電激,轉化物中加入1mL1mol/L的山梨醇,30℃溫育1h,取200μL的山梨醇重懸液涂布MD平板,30℃培養72小時;挑取回復突變菌株接種于YPD/G418平板上,30℃培養48h至長出單菌落,為獲得多拷貝的aglu基因的菌株,G418濃度篩選梯度依次為0.5mg/mL、1mg/mL、2mg/mL、4mg/mL;
pPIC?9K空質粒同上處理,所得轉化菌作為陰性對照;
(5)重組畢赤酵母KM?71/aglu/pPIC?9K的PCR鑒定:
選取含4mg/mL?G418的YPD/G418上單菌落,以引物1,引物8作為引物,用前述的PCR方法,檢驗是否能夠擴增得到全長exon?1-2-3-4片段;重組畢赤酵母KM?71/pPIC9K的PCR鑒定作為對照;鑒定后獲得正確的重組畢赤酵母KM71/aglu/pPIC?9K用于后續實驗;
(6)重組畢赤酵母的培養:
將鑒定正確的單菌落KM?71/aglu/pPIC?9K接種至10mL?YPD培養基,30℃培養24h,1mL培養液接入50mL?BMGY,30℃培養24h,至OD為4.0,離?心收集菌體,用25mL?BMMY培養基重懸培養,甲醇誘導表達,分別于24h、48h、72h和96h取樣,每次取樣200μL,離心收集上清,并補加250μL甲醇至終濃度1%;陰性對照重組畢赤酵母KM?71/pPIC9K培養方法同上;
(7)重組α-葡萄糖苷酶的檢測:
SDS-PAGE檢測表達產物在98kDa和33kDa有條帶,收集畢赤酵母發酵培養的上清液,硫酸銨沉淀,透析,制成粗酶液,測定酶活方法如下:用pH?5的醋酸鈉緩沖液配制10%的麥芽糖溶液10mL,加50μL粗制的濃縮酶液,60℃反應24h,然后煮沸2min,微孔過濾,HPLC檢測產物,與市售的低聚異麥芽糖產品IMO-900比較各成分組成;液相檢測顯示有轉糖苷產物異麥芽糖、潘糖生成。?
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