[發明專利]一種檢測核酸點突變的方法

無效

• 申請號: 200810208117.3
• 申請日: 2008-12-29
• 公開（公告）號: CN101768628A
• 公開（公告）日: 2010-07-07
• 發明（設計）人: 姚見兒;白艷軍;談暢;李久彤
• 申請（專利權）人: 上海透景生命科技有限公司
• 主分類號: C12Q1/68
• 分類號: C12Q1/68;C12N15/11
• 代理公司: 上海專利商標事務所有限公司 31100
• 代理人: 徐迅

1.一種用于檢測核酸點突變的探針，其特征在于，所述探針的結構如式I所示：

Z-L-B????(式I)

式中，

B表示探針與靶核酸結合的核酸結合區；

Z表示可有可無的固相載體；

L是連接臂；當Z不存在時，L是用于將B連接于Z的連接臂；當Z存在時，L是已經將B與Z相連的連接臂；

并且，所述的探針與靶核酸結合的結合區B具有式II所示的5’-3’結構：

S1-P1-S2-P2-S3????(式II)

式中，

P1和P2分別是一個堿基，其中的一個是針對突變位點的堿基，該堿基與野生型序列互補但與突變型序列不互補，或者該堿基與野生型序列不互補但與突變型序列互補；而另一個是輔助性的不匹配堿基，該堿基既與野生型序列不互補，也與突變型序列不互補；

S1是與野生型序列和突變型序列互補的結合區5’端核苷酸序列，其長度為X1個堿基；

S2是與野生型序列和突變型序列互補的結合區中部核苷酸序列，其長度為X2個堿基；

S3是與野生型序列和突變型序列互補的結合區3’端核苷酸序列，其長度為X3個堿基；

其中，X1、X2和X3的長度差的絕對值同時滿足以下條件：

|X1-X2|≤4；

|X3-X2|≤4；

|X1-X3|≤4；

并且|X1-X2|+|X3-X2|+|X1-X3|≤8。

2.如權利要求1所述的探針，其特征在于，|X1-X2|+|X3-X2|+|X1-X3|≤6，更佳地|X1-X2|+|X3-X2|+|X1-X3|≤4，最佳地|X1-X2|+|X3-X2|+|X1-X3|＝0。

3.如權利要求1所述的探針，其特征在于，X1、X2和X3的長度差的絕對值同時滿足以下條件：

|X1-X2|≤3；

|X3-X2|≤3；

|X1-X3|≤3。

4.如權利要求1所述的探針，其特征在于，X1、X2和X3的長度差的絕對值同時滿足以下條件：

|X1-X2|≤2；

|X3-X2|≤2；

|X1-X3|≤2。

5.如權利要求1所述的探針，其特征在于，所述的探針與靶核酸結合的結合區B的長度為15-25個堿基，更佳地為16-22個堿基。

6.如權利要求1所述的探針，其特征在于，所述的連接臂的長度為8-30個堿基。

7.如權利要求1所述的探針，其特征在于，所述的固相載體是熒光編碼微球、膜條或玻片。

8.一種檢測核酸樣品是否存在點突變的檢測方法，其特征在于，包括步驟：

將權利要求1所述的探針與待檢測核酸樣品進行雜交，并檢測是否形成“待檢測核酸-探針”雜交復合物，其中未形成所述的雜交復合物就表示樣品存在所述的點突變，而形成所述的雜交復合物就表示樣品存在所述的點突變。

9.如權利要求8所述的方法，其特征在于，該方法還包括將檢測結果與陽性對照和陰性對照進行比較。

10.一種用于核酸點突變的試劑盒，其特征在于，包括：容器以及位于容器中的權利要求1所述的探針。