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[發(fā)明專利]硫鏈絲菌素的生物合成基因簇無(wú)效

專利信息
申請(qǐng)?zhí)枺?/td> 200810202416.6 申請(qǐng)日: 2008-11-07
公開(kāi)(公告)號(hào): CN101445803A 公開(kāi)(公告)日: 2009-06-03
發(fā)明(設(shè)計(jì))人: 劉文;廖日晶;虞沂;段煉;雷春;丁瑩 申請(qǐng)(專利權(quán))人: 中國(guó)科學(xué)院上海有機(jī)化學(xué)研究所
主分類號(hào): C12N15/54 分類號(hào): C12N15/54;C12N15/55;C12N15/52;C12N15/53;C12N15/31;C07K14/195
代理公司: 上海新天專利代理有限公司 代理人: 鄔震中
地址: 200032*** 國(guó)省代碼: 上海;31
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摘要:
搜索關(guān)鍵詞: 硫鏈絲 菌素 生物 合成 基因
【權(quán)利要求書】:

1.一種抗革蘭氏陽(yáng)性菌活性的抗生素—硫鏈絲菌素的生物合成基因簇,其特征在于編碼硫鏈絲菌素生物合成所涉及的22個(gè)基因,具體為:

1)1個(gè)氨基轉(zhuǎn)移酶基因,即tsrA:

tsrA位于基因簇核苷酸序列第3774-2686個(gè)堿基處,長(zhǎng)度為1089個(gè)堿基對(duì),氨基轉(zhuǎn)移酶,362個(gè)氨基酸;

2)脂肪酶基因,即tsrB:

tsrB位于基因簇核苷酸序列第4626-3796個(gè)堿基處,長(zhǎng)度為831個(gè)堿基對(duì),編碼脂肪酶,276個(gè)氨基酸;

3)天門冬酰胺合成酶基因,即:tsrC

tsrC位于基因簇核苷酸序列第6541-4685個(gè)堿基處,長(zhǎng)度為1857個(gè)堿基對(duì),編碼天門冬酰胺合成酶,618個(gè)氨基酸;

4)酯環(huán)化酶基因,即基因tsrD:

tsrD位于基因簇核苷酸序列第個(gè)7088-6681堿基處,長(zhǎng)度為408個(gè)堿基對(duì),編碼酯環(huán)化酶,135個(gè)氨基酸;

5)酰基-CoA脫氫酶基因,即tsrE:

tsrE位于基因簇核苷酸序列第8449-7163個(gè)堿基處,長(zhǎng)度為1287個(gè)堿基對(duì),編碼酰基-CoA脫氫酶,428個(gè)氨基酸;

6)甲基轉(zhuǎn)移酶基因,即tsrF:

tsrF位于基因簇核苷酸序列第9529-8594個(gè)堿基處,長(zhǎng)度為936個(gè)堿基對(duì),編碼甲基基轉(zhuǎn)移酶,311個(gè)氨基酸;

7)與thiostrepton側(cè)鏈生物合成相關(guān)但具體功能未知的基因,即:tsrG:

tsrG位于基因簇核苷酸序列第10241-9600個(gè)堿基處,長(zhǎng)度為642個(gè)堿基對(duì),編碼一個(gè)未知功能蛋白,213個(gè)氨基酸;

8)前體肽基因,即tsrH:

tsrH位于基因簇核苷酸序列第10570-10746個(gè)堿基處,長(zhǎng)度為177個(gè)堿基對(duì),編碼Thiostrepton前體肽,58個(gè)氨基酸;

9)水解酶基因,即tsrI:

tsrI位于基因簇核苷酸序列第11461-12054個(gè)堿基處,長(zhǎng)度為594個(gè)堿基對(duì),編碼水解酶,197個(gè)氨基酸;

10)脫水酶基因,即tsrJ:

tsrJ位于基因簇核苷酸序列第12047-14848個(gè)堿基處,長(zhǎng)度為2802個(gè)堿基對(duì),編碼脫水酶,933個(gè)氨基酸;

11)脫水酶基因,即tsrK:

tsrK位于基因簇核苷酸序列第14845-15885個(gè)堿基處,長(zhǎng)度為1041個(gè)堿基對(duì),編碼脫水酶,346個(gè)氨基酸;

12)與thiostrepton大環(huán)合成相關(guān)具體功能未知基因,即tsrL:

tsrL位于基因簇核苷酸序列第15872-16978個(gè)堿基處,長(zhǎng)度為1107個(gè)堿基對(duì),編碼一個(gè)具體功能未知的蛋白,368個(gè)氨基酸;

13)NADH依賴的氧化酶基因,即tsrM:

tsrM位于基因簇核苷酸序列第16975-18744個(gè)堿基處,長(zhǎng)度為1770個(gè)堿基對(duì),編碼NADH依賴的氧化酶,589個(gè)氨基酸;

14)與thiostrepton大環(huán)合成相關(guān)具體功能未知基因,即tsrN:

tsrN位于基因簇核苷酸序列第18741-20579個(gè)堿基處,長(zhǎng)度為1839個(gè)堿基對(duì),編碼一個(gè)具體功能未知的蛋白,612個(gè)氨基酸;

15)與thiostrepton大環(huán)合成相關(guān)具體功能未知基因,即tsrO:

tsrO位于基因簇核苷酸序列第20576-22621個(gè)堿基處,長(zhǎng)度為2046個(gè)堿基對(duì),編碼一個(gè)具體功能未知的蛋白,681個(gè)氨基酸;

16)細(xì)胞色素P450氧化酶基因,即tsrP:

tsrN位于基因簇核苷酸序列第22599-24023個(gè)堿基處,長(zhǎng)度為1425個(gè)堿基對(duì),編碼細(xì)胞色素P450氧化酶,474個(gè)氨基酸;

17)酰基-CoA合成酶,即tsrQ:

tsrQ位于基因簇核苷酸序列第23999-25312個(gè)堿基處,長(zhǎng)度為1314個(gè)堿基對(duì),編碼酰基-CoA合成酶,437個(gè)氨基酸;

18)細(xì)胞色素P450氧化酶基因,即tsrR:

tsrR位于基因簇核苷酸序列第25422-26612個(gè)堿基處,長(zhǎng)度為1191個(gè)堿基對(duì),編碼細(xì)胞色素氧化酶,396個(gè)氨基酸;

19)脫水酶基因,即tsrS:

tsrS位于基因簇核苷酸序列第26603-29413個(gè)堿基處,長(zhǎng)度為2811個(gè)堿基對(duì),編碼脫水酶,936個(gè)氨基酸;

20)鐵硫簇氧化還原酶基因,即tsrT:

tsrT位于基因簇核苷酸序列第29430-31229個(gè)堿基處,長(zhǎng)度為1800個(gè)堿基對(duì),編碼一個(gè)具體功能未知的蛋白,599個(gè)氨基酸;

21)短鏈脫氫酶基因,即tsrU:

tsrU位于基因簇核苷酸序列第31226-32044個(gè)堿基處,長(zhǎng)度為819個(gè)堿基對(duì),編碼一個(gè)具體功能未知的蛋白,272個(gè)氨基酸;

22)與thiostrepton大環(huán)合成相關(guān)具體功能未知基因,即tsrV:

tsrV位于基因簇核苷酸序列第32391-33113個(gè)堿基處,長(zhǎng)度為744個(gè)堿基對(duì),編碼一個(gè)具體功能未知的蛋白,247個(gè)氨基酸。

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