[發明專利]硫鏈絲菌素的生物合成基因簇無效
| 申請號: | 200810202416.6 | 申請日: | 2008-11-07 |
| 公開(公告)號: | CN101445803A | 公開(公告)日: | 2009-06-03 |
| 發明(設計)人: | 劉文;廖日晶;虞沂;段煉;雷春;丁瑩 | 申請(專利權)人: | 中國科學院上海有機化學研究所 |
| 主分類號: | C12N15/54 | 分類號: | C12N15/54;C12N15/55;C12N15/52;C12N15/53;C12N15/31;C07K14/195 |
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| 摘要: | |||
| 搜索關鍵詞: | 硫鏈絲 菌素 生物 合成 基因 | ||
1.一種抗革蘭氏陽性菌活性的抗生素—硫鏈絲菌素的生物合成基因簇,其特征在于編碼硫鏈絲菌素生物合成所涉及的22個基因,具體為:
1)1個氨基轉移酶基因,即tsrA:
tsrA位于基因簇核苷酸序列第3774-2686個堿基處,長度為1089個堿基對,氨基轉移酶,362個氨基酸;
2)脂肪酶基因,即tsrB:
tsrB位于基因簇核苷酸序列第4626-3796個堿基處,長度為831個堿基對,編碼脂肪酶,276個氨基酸;
3)天門冬酰胺合成酶基因,即:tsrC
tsrC位于基因簇核苷酸序列第6541-4685個堿基處,長度為1857個堿基對,編碼天門冬酰胺合成酶,618個氨基酸;
4)酯環化酶基因,即基因tsrD:
tsrD位于基因簇核苷酸序列第個7088-6681堿基處,長度為408個堿基對,編碼酯環化酶,135個氨基酸;
5)?;?CoA脫氫酶基因,即tsrE:
tsrE位于基因簇核苷酸序列第8449-7163個堿基處,長度為1287個堿基對,編碼?;?CoA脫氫酶,428個氨基酸;
6)甲基轉移酶基因,即tsrF:
tsrF位于基因簇核苷酸序列第9529-8594個堿基處,長度為936個堿基對,編碼甲基基轉移酶,311個氨基酸;
7)與thiostrepton側鏈生物合成相關但具體功能未知的基因,即:tsrG:
tsrG位于基因簇核苷酸序列第10241-9600個堿基處,長度為642個堿基對,編碼一個未知功能蛋白,213個氨基酸;
8)前體肽基因,即tsrH:
tsrH位于基因簇核苷酸序列第10570-10746個堿基處,長度為177個堿基對,編碼Thiostrepton前體肽,58個氨基酸;
9)水解酶基因,即tsrI:
tsrI位于基因簇核苷酸序列第11461-12054個堿基處,長度為594個堿基對,編碼水解酶,197個氨基酸;
10)脫水酶基因,即tsrJ:
tsrJ位于基因簇核苷酸序列第12047-14848個堿基處,長度為2802個堿基對,編碼脫水酶,933個氨基酸;
11)脫水酶基因,即tsrK:
tsrK位于基因簇核苷酸序列第14845-15885個堿基處,長度為1041個堿基對,編碼脫水酶,346個氨基酸;
12)與thiostrepton大環合成相關具體功能未知基因,即tsrL:
tsrL位于基因簇核苷酸序列第15872-16978個堿基處,長度為1107個堿基對,編碼一個具體功能未知的蛋白,368個氨基酸;
13)NADH依賴的氧化酶基因,即tsrM:
tsrM位于基因簇核苷酸序列第16975-18744個堿基處,長度為1770個堿基對,編碼NADH依賴的氧化酶,589個氨基酸;
14)與thiostrepton大環合成相關具體功能未知基因,即tsrN:
tsrN位于基因簇核苷酸序列第18741-20579個堿基處,長度為1839個堿基對,編碼一個具體功能未知的蛋白,612個氨基酸;
15)與thiostrepton大環合成相關具體功能未知基因,即tsrO:
tsrO位于基因簇核苷酸序列第20576-22621個堿基處,長度為2046個堿基對,編碼一個具體功能未知的蛋白,681個氨基酸;
16)細胞色素P450氧化酶基因,即tsrP:
tsrN位于基因簇核苷酸序列第22599-24023個堿基處,長度為1425個堿基對,編碼細胞色素P450氧化酶,474個氨基酸;
17)?;?CoA合成酶,即tsrQ:
tsrQ位于基因簇核苷酸序列第23999-25312個堿基處,長度為1314個堿基對,編碼酰基-CoA合成酶,437個氨基酸;
18)細胞色素P450氧化酶基因,即tsrR:
tsrR位于基因簇核苷酸序列第25422-26612個堿基處,長度為1191個堿基對,編碼細胞色素氧化酶,396個氨基酸;
19)脫水酶基因,即tsrS:
tsrS位于基因簇核苷酸序列第26603-29413個堿基處,長度為2811個堿基對,編碼脫水酶,936個氨基酸;
20)鐵硫簇氧化還原酶基因,即tsrT:
tsrT位于基因簇核苷酸序列第29430-31229個堿基處,長度為1800個堿基對,編碼一個具體功能未知的蛋白,599個氨基酸;
21)短鏈脫氫酶基因,即tsrU:
tsrU位于基因簇核苷酸序列第31226-32044個堿基處,長度為819個堿基對,編碼一個具體功能未知的蛋白,272個氨基酸;
22)與thiostrepton大環合成相關具體功能未知基因,即tsrV:
tsrV位于基因簇核苷酸序列第32391-33113個堿基處,長度為744個堿基對,編碼一個具體功能未知的蛋白,247個氨基酸。
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