[發(fā)明專利]硫鏈絲菌素的生物合成基因簇無(wú)效
| 申請(qǐng)?zhí)枺?/td> | 200810202416.6 | 申請(qǐng)日: | 2008-11-07 |
| 公開(kāi)(公告)號(hào): | CN101445803A | 公開(kāi)(公告)日: | 2009-06-03 |
| 發(fā)明(設(shè)計(jì))人: | 劉文;廖日晶;虞沂;段煉;雷春;丁瑩 | 申請(qǐng)(專利權(quán))人: | 中國(guó)科學(xué)院上海有機(jī)化學(xué)研究所 |
| 主分類號(hào): | C12N15/54 | 分類號(hào): | C12N15/54;C12N15/55;C12N15/52;C12N15/53;C12N15/31;C07K14/195 |
| 代理公司: | 上海新天專利代理有限公司 | 代理人: | 鄔震中 |
| 地址: | 200032*** | 國(guó)省代碼: | 上海;31 |
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| 摘要: | |||
| 搜索關(guān)鍵詞: | 硫鏈絲 菌素 生物 合成 基因 | ||
1.一種抗革蘭氏陽(yáng)性菌活性的抗生素—硫鏈絲菌素的生物合成基因簇,其特征在于編碼硫鏈絲菌素生物合成所涉及的22個(gè)基因,具體為:
1)1個(gè)氨基轉(zhuǎn)移酶基因,即tsrA:
tsrA位于基因簇核苷酸序列第3774-2686個(gè)堿基處,長(zhǎng)度為1089個(gè)堿基對(duì),氨基轉(zhuǎn)移酶,362個(gè)氨基酸;
2)脂肪酶基因,即tsrB:
tsrB位于基因簇核苷酸序列第4626-3796個(gè)堿基處,長(zhǎng)度為831個(gè)堿基對(duì),編碼脂肪酶,276個(gè)氨基酸;
3)天門冬酰胺合成酶基因,即:tsrC
tsrC位于基因簇核苷酸序列第6541-4685個(gè)堿基處,長(zhǎng)度為1857個(gè)堿基對(duì),編碼天門冬酰胺合成酶,618個(gè)氨基酸;
4)酯環(huán)化酶基因,即基因tsrD:
tsrD位于基因簇核苷酸序列第個(gè)7088-6681堿基處,長(zhǎng)度為408個(gè)堿基對(duì),編碼酯環(huán)化酶,135個(gè)氨基酸;
5)酰基-CoA脫氫酶基因,即tsrE:
tsrE位于基因簇核苷酸序列第8449-7163個(gè)堿基處,長(zhǎng)度為1287個(gè)堿基對(duì),編碼酰基-CoA脫氫酶,428個(gè)氨基酸;
6)甲基轉(zhuǎn)移酶基因,即tsrF:
tsrF位于基因簇核苷酸序列第9529-8594個(gè)堿基處,長(zhǎng)度為936個(gè)堿基對(duì),編碼甲基基轉(zhuǎn)移酶,311個(gè)氨基酸;
7)與thiostrepton側(cè)鏈生物合成相關(guān)但具體功能未知的基因,即:tsrG:
tsrG位于基因簇核苷酸序列第10241-9600個(gè)堿基處,長(zhǎng)度為642個(gè)堿基對(duì),編碼一個(gè)未知功能蛋白,213個(gè)氨基酸;
8)前體肽基因,即tsrH:
tsrH位于基因簇核苷酸序列第10570-10746個(gè)堿基處,長(zhǎng)度為177個(gè)堿基對(duì),編碼Thiostrepton前體肽,58個(gè)氨基酸;
9)水解酶基因,即tsrI:
tsrI位于基因簇核苷酸序列第11461-12054個(gè)堿基處,長(zhǎng)度為594個(gè)堿基對(duì),編碼水解酶,197個(gè)氨基酸;
10)脫水酶基因,即tsrJ:
tsrJ位于基因簇核苷酸序列第12047-14848個(gè)堿基處,長(zhǎng)度為2802個(gè)堿基對(duì),編碼脫水酶,933個(gè)氨基酸;
11)脫水酶基因,即tsrK:
tsrK位于基因簇核苷酸序列第14845-15885個(gè)堿基處,長(zhǎng)度為1041個(gè)堿基對(duì),編碼脫水酶,346個(gè)氨基酸;
12)與thiostrepton大環(huán)合成相關(guān)具體功能未知基因,即tsrL:
tsrL位于基因簇核苷酸序列第15872-16978個(gè)堿基處,長(zhǎng)度為1107個(gè)堿基對(duì),編碼一個(gè)具體功能未知的蛋白,368個(gè)氨基酸;
13)NADH依賴的氧化酶基因,即tsrM:
tsrM位于基因簇核苷酸序列第16975-18744個(gè)堿基處,長(zhǎng)度為1770個(gè)堿基對(duì),編碼NADH依賴的氧化酶,589個(gè)氨基酸;
14)與thiostrepton大環(huán)合成相關(guān)具體功能未知基因,即tsrN:
tsrN位于基因簇核苷酸序列第18741-20579個(gè)堿基處,長(zhǎng)度為1839個(gè)堿基對(duì),編碼一個(gè)具體功能未知的蛋白,612個(gè)氨基酸;
15)與thiostrepton大環(huán)合成相關(guān)具體功能未知基因,即tsrO:
tsrO位于基因簇核苷酸序列第20576-22621個(gè)堿基處,長(zhǎng)度為2046個(gè)堿基對(duì),編碼一個(gè)具體功能未知的蛋白,681個(gè)氨基酸;
16)細(xì)胞色素P450氧化酶基因,即tsrP:
tsrN位于基因簇核苷酸序列第22599-24023個(gè)堿基處,長(zhǎng)度為1425個(gè)堿基對(duì),編碼細(xì)胞色素P450氧化酶,474個(gè)氨基酸;
17)酰基-CoA合成酶,即tsrQ:
tsrQ位于基因簇核苷酸序列第23999-25312個(gè)堿基處,長(zhǎng)度為1314個(gè)堿基對(duì),編碼酰基-CoA合成酶,437個(gè)氨基酸;
18)細(xì)胞色素P450氧化酶基因,即tsrR:
tsrR位于基因簇核苷酸序列第25422-26612個(gè)堿基處,長(zhǎng)度為1191個(gè)堿基對(duì),編碼細(xì)胞色素氧化酶,396個(gè)氨基酸;
19)脫水酶基因,即tsrS:
tsrS位于基因簇核苷酸序列第26603-29413個(gè)堿基處,長(zhǎng)度為2811個(gè)堿基對(duì),編碼脫水酶,936個(gè)氨基酸;
20)鐵硫簇氧化還原酶基因,即tsrT:
tsrT位于基因簇核苷酸序列第29430-31229個(gè)堿基處,長(zhǎng)度為1800個(gè)堿基對(duì),編碼一個(gè)具體功能未知的蛋白,599個(gè)氨基酸;
21)短鏈脫氫酶基因,即tsrU:
tsrU位于基因簇核苷酸序列第31226-32044個(gè)堿基處,長(zhǎng)度為819個(gè)堿基對(duì),編碼一個(gè)具體功能未知的蛋白,272個(gè)氨基酸;
22)與thiostrepton大環(huán)合成相關(guān)具體功能未知基因,即tsrV:
tsrV位于基因簇核苷酸序列第32391-33113個(gè)堿基處,長(zhǎng)度為744個(gè)堿基對(duì),編碼一個(gè)具體功能未知的蛋白,247個(gè)氨基酸。
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