[發明專利]用于檢測血清淀粉狀蛋白A1(SAA1)的基因型的核苷酸引物組和核苷酸探針

無效

• 申請號: 200810091278.9
• 申請日: 2008-04-28
• 公開（公告）號: CN101294222A
• 公開（公告）日: 2008-10-29
• 發明（設計）人: 中村奈緒子;伊藤桂子;高橋匡慶;橋本幸二;源間信弘
• 申請（專利權）人: 株式會社東芝
• 主分類號: C12Q1/68
• 分類號: C12Q1/68;C12N15/11
• 代理公司: 北京市中咨律師事務所
• 代理人: 黃革生;林柏楠

1.用于LAMP擴增的核苷酸引物組，其用于檢測SAA1基因單核苷 酸多態性C-13T的基因型，其特征在于

當靶核苷酸從5’端依次具有F3區、F2區和F1區及從3’端依次具有 B3c區、B2c區和B1c區時，并且

當存在這樣的核苷酸引物時，其中所述的核苷酸引物包括具有在3’端 側與F2區序列相同的序列和在5’端側與F1區互補的序列的FIP引物、具 有與F3區序列相同的序列的F3引物、具有在3’端側與B2c區互補的序列 和在5’端側與B1c區序列相同的序列的BIP引物、以及具有與B3c區互補 的序列的B3引物，

引物組包含：

選自表2中所示引物組1-7中的FIP引物和BIP引物；

與自靶核酸的F2區5’端起60個堿基范圍內的區域結合的F3引物； 和

與自靶核酸的B2c區3’端起60個堿基范圍內的區域結合的B3引物。

2.根據權利要求1所述的核苷酸引物組，其特征在于FIP和BIP引物 選自表2中所示的引物組1、2、3、4和6。

3.根據權利要求1所述的核苷酸引物組，其特征在于FIP和BIP引物 是表2中所示引物組2的引物。

4.檢測SAA1基因單核苷酸多態性C-13T的基因型的方法，其特征在 于包括步驟：

通過使用根據權利要求1所述的核苷酸引物組擴增靶核酸而獲得擴增 產物；和

測定并比較在擴增產物中含有的野生型擴增產物和變異型擴增產物的 量。

5.根據權利要求4所述的方法，其特征在于

通過固定在支持物(1，11)上的核苷酸探針與擴增產物的雜交及隨后確 定與核苷酸探針結合的擴增產物的量來測定擴增產物，并且

核苷酸探針包括與野生型擴增產物互補的野生型核苷酸探針和與變異 型擴增產物互補的變異型核苷酸探針。

6.根據權利要求5所述的方法，其特征在于野生型核苷酸探針具有 Tm值63-77℃，變異型核苷酸探針具有Tm值63-74℃，并且單核苷酸多 態性C-13T位點位于自分別的核苷酸探針的末端起3個或多個堿基的內 側。

7.根據權利要求6所述的方法，其特征在于野生型核苷酸探針具有 Tm值70-74℃并且變異型核苷酸探針具有Tm值68-74℃。

8.根據權利要求5所述的方法，其特征在于野生型核苷酸探針具有 SEQ?ID?No.28、29或30的序列或與其互補的序列，并且變異型核苷酸探 針具有SEQ?ID?No.33、34或35的序列或與其互補的序列。

9.根據權利要求8所述的方法，其特征在于野生型核苷酸探針具有 SEQ?ID?No.28的序列或與其互補的序列，并且變異型核苷酸探針具有SEQ ID?No.33的序列或與其互補的序列。