[發(fā)明專利]利用單核苷酸多態(tài)性分析輔助確定中國漢族患者華發(fā)林使用劑量的方法和生物芯片

無效

• 申請?zhí)枺?/td>: 200810084249.X
• 申請日: 2008-03-27
• 公開（公告）號: CN101545005A
• 公開（公告）日: 2009-09-30
• 發(fā)明（設(shè)計(jì)）人: 王廷亮;李紅蕾;吳汪黔生;戴書文
• 申請（專利權(quán)）人: 李文正納米研究院
• 主分類號: C12Q1/68
• 分類號: C12Q1/68
• 代理公司: 中國專利代理(香港)有限公司
• 代理人: 程 淼;劉 玥

1.一種獲取對確定中國漢族患者華發(fā)林使用劑量有用的分?jǐn)?shù)的方法，包括以下步驟：

(1)獲取來自該患者的核酸樣品；

(2)針對選自下組的一個或多個單核苷酸多態(tài)性位點(diǎn)對所述核酸樣品進(jìn)行檢測：VKORC1基因的rs9934438位點(diǎn)、CYP2C9基因的rs1057910位點(diǎn)和rs9332127位點(diǎn)、EPHX1基因的rs4653436位點(diǎn)；

(3)確定所述單核苷酸多態(tài)性位點(diǎn)的基因型；

(4)對所述單核苷酸多態(tài)性位點(diǎn)的基因型進(jìn)行評分；

其中步驟(4)中獲得的分?jǐn)?shù)對于確定該患者的華發(fā)林使用劑量有幫助。

2.權(quán)利要求1的方法，其中，所述分?jǐn)?shù)與所述單核苷酸多態(tài)性位點(diǎn)的基因型的關(guān)系為：

對于VKORC1基因的rs9934438位點(diǎn)的分?jǐn)?shù)：CC>TC>TT；

對于CYP2C9基因的rs1057910位點(diǎn)的分?jǐn)?shù)：AA>AC>CC；

對于CYP2C9基因的rs9332127位點(diǎn)的分?jǐn)?shù)：GG>GC>CC；

對于EPHX1基因的rs4653436位點(diǎn)的分?jǐn)?shù)：AA>AG>GG。

3.權(quán)利要求2的方法，其中，所述分?jǐn)?shù)與所述單核苷酸多態(tài)性位點(diǎn)的基因型的關(guān)系為：

對于VKORC1基因的rs9934438位點(diǎn)：TT＝0，TC＝1，CC＝2；

對于CYP2C9基因的rs1057910位點(diǎn)：AA＝0，AC＝-1，CC＝-2；

對于CYP2C9基因的rs9332127位點(diǎn)：GG＝0，GC＝-1，CC＝-2；

對于EPHX1基因的rs4653436位點(diǎn)：GG＝0，AG＝1，AA＝2。

4.權(quán)利要求1的方法，其中，步驟(2)中所述的檢測采用PCR進(jìn)行。

5.權(quán)利要求4的方法，其中，所述PCR采用選自下組的引物對或其互補(bǔ)引物對進(jìn)行：

對于VKORC1基因的rs9934438位點(diǎn)，SEQ?ID?NO：2和3；

對于CYP2C9基因的rs1057910位點(diǎn)，SEQ?ID?NO：5和6；

對于CYP2C9基因的rs9332127位點(diǎn)，SEQ?ID?NO：8和9；

對于EPHX1基因的rs4653436位點(diǎn)，SEQ?ID?NO：11和12。

6.權(quán)利要求1的方法，其中，步驟(2)中還包括檢測與所述單核苷酸多態(tài)性位點(diǎn)中的一個或多個同屬一個單倍體型或呈現(xiàn)連鎖不平衡的遺傳標(biāo)記位點(diǎn)。

7.權(quán)利要求6的方法，其中，所述遺傳標(biāo)記位點(diǎn)包括與VKORC1基因的rs9934438位點(diǎn)有關(guān)聯(lián)的rs9923231、rs2359612及rs7294位點(diǎn)。

8.權(quán)利要求1的方法，其中，步驟(2)中所述的檢測通過限制性內(nèi)切酶消化或者通過DNA測序進(jìn)行。