[發明專利]SNPs組合鑒定TAP等位基因的方法

無效

• 申請號: 200810035190.5
• 申請日: 2008-03-26
• 公開（公告）號: CN101250587A
• 公開（公告）日: 2008-08-27
• 發明（設計）人: 馮明亮
• 申請（專利權）人: 上海市血液中心
• 主分類號: C12Q1/68
• 分類號: C12Q1/68
• 代理公司: 上海光華專利事務所
• 代理人: 許亦琳;余明偉

1.一種SNPs組合鑒定TAP等位基因的方法，包括下列步驟：檢測待測樣本TAP基因上TAP1的第599、762、997、1910、1943和1983位點堿基的SNP分型獲得TAP1的SNP分型組合，或者檢測待測TAP基因上TAP2的第1308、1693和1951位點堿基的SNP分型獲得TAP2的SNP分型組合，根據TAP1或TAP2的SNP分型組合對應的等位基因分型，確定TAP1或TAP2的等位基因分型。

2.如權利要求1所述SNPs組合鑒定TAP等位基因的方法，其特征在于，所述TAP1的SNP分型組合對應的等位基因分型按下表所示：

3.如權利要求1所述SNPs組合鑒定TAP等位基因的方法，其特征在于，所述TAP2的SNP分型組合對應的等位基因分型按下表所示：

4.如權利要求1或2或3所述SNPs組合鑒定TAP等位基因的方法，其特征在于，采用TaqMan?PCR檢測SNP分型。

5.如權利要求4所述SNPs組合鑒定TAP等位基因的方法，其特征在于，采用Taq?Man?PCR檢測SNP分型時，檢測TAP1等位基因時所使用的引物及探針的對應關系如下：

位點：p599?

引物序列：

F-GCTGAGCCATCTTGTAGAATCCA

R-GACTTAATATTTGTGCGTGACCTCTCT

MGB探針序列：

FAM-GGCCATCTCCCTTGGAGAAAGA

VIC-TGGCCATCTCCCCTGGAGAAAGA；

位點：p762

引物序列：

F-CCAAACACCTCTCCCTGCAA

R-TTCGTGGGTGACGGGATCT

MGB探針序列：

FAM-TGCACGTGGCCCATGGTGTT

VIC-CTGTGCACGTGACCCATGGTGTT；

位點：p997

引物序列：

F-TGCGAGGCCTATGTCTCTTG

R-TCTTGGGCAGAAGGAAAAGCA

MGB探針序列：

FAM-TCACCCTGATCACCCT

VIC-TCACCCTGGTCACCCT；

位點：p1910

引物序列：

F-TTCTCATCTTGGCCCTTTGCT

R-GGCCAACGCCACTGC

MGB探針序列：

FAM-CAGCCTCGTCTACCT

VIC-CAGCCTCGCCTACCT；

位點：p1943?

引物序列：

F-TTCTCATCTTGGCCCTTTG

R-GGCATCATCCAGGATAAGTACACA

MGB探針序列：

FAM-CTGCCTGTTGCTGAC

VIC-CTGCCTGTCGCTGAC；

位點：p1983

引物序列：

F-CGTTGGCCCGAGCATTG

R-GCACTGGTGGCATCATCCA

MGB探針序列：

FAM-CCGGAAACCATGTGTAC

VIC-CCGGAAACCGTGTGTAC；

檢測TAP2等位基因時所使用的引物及探針的對應關系如下所列：

位點：p1308

引物序列：

F-TTGGCTGTCGGTCCATGTA

R-CGGCTCTCCCATTCCTGTT

MGB探針序列：

FAM-TCTGCAGCTCCCACATTGCTGAG

VIC-TGCAGCTCCCACGTTGCTGAG；

位點：p1693

引物序列：

F-GTTCTCCGGTTCTGTGAGGAA

R-GCCGCCATCACCTTATCATCTT

MGB探針序列：

FAM-CCCATAAGTAATGTTG

VIC-CCATAAGCAATGTTG；?

位點：p1951

引物序列：

F-TGCAGCCTGTGAGCAATCA

R-TGGTGTCCATCTCATTCCTGTCT

MGB探針序列：

FAM-CTGTGCGATCCCCACAGGAATTC

VIC-CGATCCCCACGGGAATTCCA。?