[發(fā)明專利]食源性致病菌分子檢測(cè)標(biāo)記的建立方法

無效

• 申請(qǐng)?zhí)枺?/td>: 200810032391.X
• 申請(qǐng)日: 2008-01-08
• 公開（公告）號(hào): CN101343662A
• 公開（公告）日: 2009-01-14
• 發(fā)明（設(shè)計(jì)）人: 劉戰(zhàn)民;尹京苑
• 申請(qǐng)（專利權(quán)）人: 上海大學(xué)
• 主分類號(hào): C12Q1/68
• 分類號(hào): C12Q1/68;C12Q1/04
• 代理公司: 上海上大專利事務(wù)所（普通合伙）
• 代理人: 何文欣

1、一種食源性致病菌分子檢測(cè)標(biāo)記的建立方法，其特征在于該方法的具體步驟為：

a.收集一種食源性致病菌的所有基因組序列；

b.選取步驟a中獲得的基因組序列中的任一基因組切分成長(zhǎng)度為500～1000bp的片段，將每個(gè)切分片段與其余的基因組序列進(jìn)行比對(duì)，保留相似性達(dá)到98％以上的切分片段，得到保守序列片段；

c.將步驟b獲得的保守序列片段中的任一片段與其他微生物基因組序列進(jìn)行比對(duì)，剔除保守序列片段中與其他微生物基因組序列相同的片段，則保留下來的序列片段即為該食源性致病菌的特異性標(biāo)記群；

d.將步驟c獲得的特異性標(biāo)記群中的數(shù)據(jù)信息進(jìn)行篩選，得到食源性致病菌分子檢測(cè)標(biāo)記。

2、根據(jù)權(quán)利要求1所述的食源性致病菌分子檢測(cè)標(biāo)記的建立方法，其特征在于所述的食源性致病菌是指經(jīng)食品引起人類患病的細(xì)菌、真菌、病毒或類病毒。

3、根據(jù)權(quán)利要求1或2所述的食源性致病菌分子檢測(cè)標(biāo)記的建立方法，其特征在于所述的食源性致病菌為：金黃色葡萄球菌、單核增生李斯特、沙門氏桿菌、副溶血弧菌、耐熱核酸酶基因、表皮剝脫毒素基因、中毒性休克綜合癥毒素基因、耐甲氧西林基因、16S-23SrRNA或腸出血性大腸埃希氏菌的hly、slt、eae基因。

4、根據(jù)權(quán)利要求1所述的食源性致病菌分子檢測(cè)標(biāo)記的建立方法，其特征在于所述的食源性致病菌的所有基因組序列是從DDBJ、EMBL、NCBI以及TIGR的數(shù)據(jù)庫(kù)中獲得。

5、根據(jù)權(quán)利要求1所述的食源性致病菌分子檢測(cè)標(biāo)記的建立方法，其特征在于基因組序列進(jìn)行比對(duì)采用的比對(duì)軟件為BLAST。