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[發(fā)明專利]用于富集、除去和檢測革蘭氏陽性細(xì)菌的方法和手段有效

專利信息
申請?zhí)枺?/td> 200780051424.9 申請日: 2007-12-21
公開(公告)號(hào): CN101636415A 公開(公告)日: 2010-01-27
發(fā)明(設(shè)計(jì))人: 馬丁納·貝辛格;斯蒂芬·米勒;安賈·菲利普;邁克爾·許茨 申請(專利權(quán))人: 拜奧默里克斯公司
主分類號(hào): C07K19/00 分類號(hào): C07K19/00;C12N15/62;C12N9/88;C07K14/315;G01N33/569
代理公司: 北京市柳沈律師事務(wù)所 代理人: 張文輝
地址: 法國埃*** 國省代碼: 法國;FR
權(quán)利要求書: 查看更多 說明書: 查看更多
摘要:
搜索關(guān)鍵詞: 用于 富集 除去 檢測 革蘭氏 陽性 細(xì)菌 方法 手段
【權(quán)利要求書】:

1.由下述組成的多肽:

i)內(nèi)溶素或另一種細(xì)胞壁溶解酶的無酶促活性的細(xì)胞壁結(jié)合結(jié)構(gòu)域,其中所述無酶促活性的細(xì)胞壁結(jié)合結(jié)構(gòu)域選自:SEQ?ID?NO:19、21、23-33,和

ii)JS標(biāo)簽,其選自SEQ?ID?NO:1-18,其中所述JS標(biāo)簽位于i)中所述的序列的C-或N-末端,并且任選地

iii)接頭,其選自由SEQ?ID?NO:34-38組成的組的序列,其中接頭位于i)中所述的序列和ii)所描述的序列之間,和/或

iv)間隔區(qū)序列,其選自GFP、GST或MBP組成的組,其中所述間隔區(qū)位于i)中所述的序列和ii)所描述的序列之間,

其中除i)中所述細(xì)胞壁結(jié)合結(jié)構(gòu)域之外,所述多肽不包含內(nèi)溶素或另一種細(xì)胞壁溶解酶的別的結(jié)構(gòu)域,并且其中多肽能夠結(jié)合革蘭氏陽性細(xì)菌,但在SEQ?ID?NO:19的情況中多粘芽孢桿菌(B.polymyxa)和球形芽孢桿菌(B.sphaericus)除外,和通過蛋白生物素連接酶而被體內(nèi)生物素化。

2.根據(jù)權(quán)利要求1的多肽,其中所述多肽是生物素化的。

3.根據(jù)上述權(quán)利要求任一項(xiàng)的多肽,其顯示由下組序列組成的序列:

i)選自SEQ?ID?NO:8的序列,

ii)選自SEQ?ID?NO:19的序列,

iii)選自SEQ?ID?NO:35的序列,和任選地

iv)作為間隔區(qū)的GFP、GST或MBP序列。

4.根據(jù)權(quán)利要求3的多肽,其為所示SEQ?ID?NO:42-43的序列之一。

5.編碼根據(jù)權(quán)利要求1至4任一項(xiàng)的多肽的核酸。

6.根據(jù)權(quán)利要求5的核酸,其中編碼SEQ?ID?NO:1-18的序列的N端序列以選自SEQ?ID?NO:54-56的序列開始。

7.編碼根據(jù)權(quán)利要求1至4中任一項(xiàng)的多肽的載體。

8.表達(dá)根據(jù)權(quán)利要求5或6的核酸或依照權(quán)利要求7的載體的細(xì)胞。

9.根據(jù)權(quán)利要求1至4任一項(xiàng)的多肽之一用于結(jié)合、富集、從樣品中除去、捕獲和/或檢測細(xì)菌的用途,其中所述用途不是疾病的診斷或治療方法。

10.用于富集、除去、捕獲和/或檢測來自樣品的細(xì)菌的方法,其中所述方?法不是疾病的診斷或治療方法,其包括以下步驟:

a)使樣品與生物素化的依照權(quán)利要求1至4任一項(xiàng)的多肽接觸和/或一起溫育,

b)使步驟a)中獲得的所述多肽-細(xì)菌復(fù)合物與提供生物素結(jié)合物質(zhì)的載體接觸和/或一起溫育,

c)將步驟b)中獲得的所述載體-多肽-細(xì)菌復(fù)合物與所述樣品分開,

d)任選地,自所述載體-多肽-細(xì)菌復(fù)合物清洗非特異性附著的樣品成分,

e)任選地,將所述載體與所述多肽-細(xì)菌-復(fù)合物分開,并

f)任選地,檢測所述細(xì)菌。

11.根據(jù)權(quán)利要求10的方法,其中所述生物素結(jié)合物質(zhì)包含親合素或鏈霉抗生物素蛋白。

12.根據(jù)權(quán)利要求11的方法,其中所述方法經(jīng)由磁性、層析或分批方法來實(shí)施。

13.根據(jù)權(quán)利要求10至12任一項(xiàng)的方法,其中步驟f)中的所述檢測經(jīng)由選擇性生長條件、基于核酸的方法;細(xì)菌細(xì)胞壁及其成分的檢測,細(xì)菌成分的檢測經(jīng)由偶聯(lián)有標(biāo)志物的別的特異性細(xì)胞壁結(jié)合結(jié)構(gòu)域,和/或經(jīng)由微生物學(xué)、形態(tài)學(xué)和/或生化檢測方法的組合來實(shí)施。

14.根據(jù)權(quán)利要求13的方法,其中所述基于核酸的方法選自下組:PCR、RT-PCR、PCR-RFLP、rep-PCR指紋法、NASBA、DNA雜交方法、多基因座序列分型(MLST)和rRNA比較。

15.根據(jù)權(quán)利要求13的方法,其中所述細(xì)菌細(xì)胞壁及其成分的檢測分別經(jīng)由內(nèi)溶素、抗體的細(xì)胞結(jié)合結(jié)構(gòu)域或經(jīng)由FTIR來實(shí)施。

16.根據(jù)權(quán)利要求13的方法,其中所述細(xì)菌成分的檢測經(jīng)由ELISA、酶活性、多位點(diǎn)酶電泳(MEE)或生物發(fā)光測定法來實(shí)施。

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