[發明專利]族性化學結構標引系統和標引方法

有效

• 申請號: 200710303862.1
• 申請日: 2007-12-26
• 公開（公告）號: CN101196963A
• 公開（公告）日: 2008-06-11
• 發明（設計）人: 徐峻;劉延淮;王新毅
• 申請（專利權）人: 北京時代楷模科技有限公司
• 主分類號: G06F19/00
• 分類號: G06F19/00
• 代理公司: 暫無信息
• 代理人: 暫無信息

技術領域

本發明涉及一種化學結構尤其是族性化學結構的標引系統和標引方法，特別涉及在建立化學結構尤其是族性化學結構數據庫時的標引系統和標引方法。

背景技術

1924年，美國的Eugene?Markush先生申請的一篇染料專利，被授予了美國專利。Markush先生首先使用族性化學結構表達方法來代表具有相同母體結構但取代基可變化的一組化合物，用以擴大其申報專利的保護范圍。此后，在化學領域的專利文獻中常會看到包含有用Rn表示特性的族性化學結構，這種結構被后人統稱為Markush結構。Markush結構的出現使得化學專利尤其是藥物專利的成果保護上了一個新臺階。早在上世紀50年代，眾多科學家就開始對在計算機上處理Markush結構展開了大量研究，但由于此類結構具有可變結構屬性，結構表述本身具有歧義性，這給計算機處理帶來非常高的難度，因此真正實現商業化應用的成果很少。直到目前，世界上也只有屈指可數的幾家公司，例如英國德溫特公司(Derwent)、法國DARC公司和美國化學文摘社(CAS)等擁有對Markush結構進行計算機檢索的實用技術，而且其技術處在嚴格保密之中。世界著名化學信息處理公司MDL近年推出的ISIS系列產品，具有結構輸入功能，但該系列產品是為了確定結構的輸入而設計的，并不適合表達復雜的族性化學結構邏輯體系，標引人員用其勉強標引族性化學結構，發生輸入出錯率高，難以糾錯，兼容性差和培訓困難等問題，且從數據庫讀回復雜的族性化學結構時，圖像扭曲、失真嚴重，幾乎無法對錯誤的標引結果進行修改。

Markush結構的標引的基本原理是：(1)首先分析專利例如藥物專利、化學專利中的化學結構及其語言描述；(2)從中提取最主要的化學結構片段作為整個Markush結構的骨架結構；(3)在骨架結構上用RGroup原子來代表一類可變基團，其中RGroup原子稱為Rn原子，是由字母R與數字1到32組成的32個特殊的原子符號之一，例如R1、R2、R19；(4)為每一種RGroup定義取代基團，同樣取代基團上可以繼續連接RGroup原子；(5)在每一個取代基團上設置連接點，以標示出與骨架結構的連接位置；(6)定義RLogic，其中RLogic是由一個或多個對RGroup進行限定的描述字符串組成的一組符號；(7)把繪制的分子結構以連接表的形式保存在存儲設備中。

為了解決上述難點，實現Markush結構的順利標引和檢索，需要提供一種適合于復雜Markush結構的，能夠自動糾錯的Markush標引系統和標引方法，以適應日趨復雜的Markush結構的專利文獻與科技文獻的采集、管理、檢索與輸出，提高標引輸入的結構適應性、標引的正確性、標引效率以及檢索的準確性。

發明內容

本發明旨在提供一種可對復雜的族性化學結構進行繪圖和對標引結果進行計算機存儲、檢索處理，且操作方便、準確、易于糾錯的族性化學結構標引系統和標引方法。

為了達到上述目的，本發明提供一種族性化學結構標引系統，該標引系統通過包括輸入設備、顯示裝置、主存儲器、存儲設備、處理器和繪圖工具完成Markush結構數據的輸入、存儲、處理和輸出。

其中輸入設備用于以圖形形式輸入Markush結構信息。

其中顯示裝置用于顯示圖形用戶界面及輸入結構原始信息和轉換后信息的可視化輸出。

其中主存儲器用于存儲執行中的計算機程序，以及繪制Markush結構時的實時數據，數據以二進制序列化形式存于主存儲器中。

其中存儲設備用于存儲計算機程序文件，以連接表形式保存的Markush結構的mol文件和windows位圖(微軟公司定義的一種圖形文件格式)圖形文件，以及各種配置文件、臨時文件及歷史文件。

其中處理器是系統中主要的數據處理設備，用于分析輸入設備輸入的Markush結構數據，并根據操作指令對Markush結構數據進行添加、刪除、修改與轉換等處理。

其中繪圖工具包括一標引操作主模塊，一結構格式處理主模塊，一分子結構顯示主模塊。