[發(fā)明專利]族性化學(xué)結(jié)構(gòu)標(biāo)引系統(tǒng)和標(biāo)引方法

有效

• 申請(qǐng)?zhí)枺?/td>: 200710303862.1
• 申請(qǐng)日: 2007-12-26
• 公開（公告）號(hào): CN101196963A
• 公開（公告）日: 2008-06-11
• 發(fā)明（設(shè)計(jì)）人: 徐峻;劉延淮;王新毅
• 申請(qǐng)（專利權(quán)）人: 北京時(shí)代楷模科技有限公司
• 主分類號(hào): G06F19/00
• 分類號(hào): G06F19/00
• 代理公司: 暫無(wú)信息
• 代理人: 暫無(wú)信息

1.一種族性化學(xué)結(jié)構(gòu)標(biāo)引系統(tǒng)，包括輸入設(shè)備、顯示裝置、主存儲(chǔ)器、存儲(chǔ)設(shè)備、處理器和繪圖工具，用于完成Markush結(jié)構(gòu)數(shù)據(jù)的輸入、存儲(chǔ)、處理和輸出，其特征在于：

繪圖工具包括一標(biāo)引操作主模塊，一結(jié)構(gòu)格式處理主模塊，一分子結(jié)構(gòu)顯示主模塊；

標(biāo)引操作主模塊用于管理系統(tǒng)的用戶界面接口，接收用戶由用戶界面輸入的各種繪圖操作指令，并將用戶繪制的分子骨架結(jié)構(gòu)及取代基結(jié)構(gòu)形成族性結(jié)構(gòu)；

結(jié)構(gòu)格式處理主模塊用于實(shí)時(shí)的對(duì)用戶輸入的分子結(jié)構(gòu)數(shù)據(jù)進(jìn)行分析，并將分析結(jié)果轉(zhuǎn)換為計(jì)算機(jī)可識(shí)別的族性結(jié)構(gòu)的mol文件和windows位圖(微軟公司定義的一種圖形文件格式)的圖形文件，同時(shí)把所述圖形文件保存到內(nèi)存中；

分子結(jié)構(gòu)顯示主模塊用于對(duì)圖面上的分子結(jié)構(gòu)數(shù)據(jù)進(jìn)行結(jié)構(gòu)處理，并通過(guò)用戶界面接口顯示結(jié)構(gòu)信息；

用戶由標(biāo)引操作主模塊完成Markush結(jié)構(gòu)數(shù)據(jù)的輸入，而結(jié)構(gòu)格式處理主模塊對(duì)用戶輸入的Markush結(jié)構(gòu)數(shù)據(jù)進(jìn)行存儲(chǔ)和格式轉(zhuǎn)換，并通過(guò)分子結(jié)構(gòu)顯示模塊顯示經(jīng)過(guò)處理的、用戶可識(shí)別的結(jié)構(gòu)信息。

2.如權(quán)利要求1所述的一種族性化學(xué)結(jié)構(gòu)標(biāo)引系統(tǒng)，其特征在于：標(biāo)引操作主模塊包含一圖形用戶接口管理子模塊，一族性結(jié)構(gòu)標(biāo)引子模塊，一模板管理子模塊，一配置管理子模塊；其中圖形用戶接口管理子模塊用于管理繪圖工具與用戶的交互界面，接收用戶的操作指令；其中族性化學(xué)結(jié)構(gòu)標(biāo)引子模塊用于繪制分子骨架結(jié)構(gòu)和取代基結(jié)構(gòu)，形成族性結(jié)構(gòu)，并對(duì)輸入的數(shù)據(jù)進(jìn)行實(shí)時(shí)分析，將分析結(jié)果轉(zhuǎn)換為結(jié)構(gòu)顯示狀態(tài)，同時(shí)把圖形數(shù)據(jù)轉(zhuǎn)換為結(jié)構(gòu)數(shù)據(jù)保存到內(nèi)存中；模板管理子模塊用于管理分子結(jié)構(gòu)模板，通過(guò)模板管理操作窗口，把當(dāng)前繪制的分子結(jié)構(gòu)或存儲(chǔ)器中的分子結(jié)構(gòu)mol文件添加到指定的模板中，添加后用戶可以直接在模板列表中調(diào)用分子結(jié)構(gòu)模板；配置管理子模塊用于管理用戶對(duì)系統(tǒng)進(jìn)行自定義設(shè)置的數(shù)據(jù)和文件，包括用戶對(duì)輸出SDF文件的自定義信息，以及常用原子列表的自定義信息。

3.如權(quán)利要求1所述的一種族性化學(xué)結(jié)構(gòu)標(biāo)引系統(tǒng)，其特征在于：結(jié)構(gòu)格式處理主模塊包括一結(jié)構(gòu)圖形轉(zhuǎn)換子模塊，一分子排列子模塊，一分子旋轉(zhuǎn)、放縮功能子模塊；其中結(jié)構(gòu)圖形轉(zhuǎn)換子模塊用于提供一導(dǎo)出功能，可以把當(dāng)前繪制的分子結(jié)構(gòu)轉(zhuǎn)換成windows位圖圖形數(shù)據(jù)；分子排列子模塊用于提供縱向排列、橫向排列功能；分子旋轉(zhuǎn)、放縮功能子模塊用于改變分子結(jié)構(gòu)的顯示尺寸和方向。

4.如權(quán)利要求1所述的一種族性化學(xué)結(jié)構(gòu)標(biāo)引系統(tǒng)，其特征在于：分子結(jié)構(gòu)顯示主模塊還包括一錯(cuò)誤顯示子模塊，一RGroup瀏覽子模塊，一RGroup邏輯樹子模塊，一分子結(jié)構(gòu)預(yù)覽子模塊；錯(cuò)誤顯示子模塊對(duì)出現(xiàn)錯(cuò)誤的分子結(jié)構(gòu)或原子進(jìn)行提示出錯(cuò)處理，其能夠識(shí)別并做出相應(yīng)處理的錯(cuò)誤情況包括但不限于以下幾種：

I)當(dāng)繪制的化學(xué)結(jié)構(gòu)中出現(xiàn)了價(jià)鍵錯(cuò)誤的原子，則系統(tǒng)用與該原子化學(xué)結(jié)構(gòu)圖顏色相異的色圈圈中該原子；

II)當(dāng)用戶要把未設(shè)置取代點(diǎn)的分子添加到取代分子列表中時(shí)系統(tǒng)彈出對(duì)話框提示錯(cuò)誤設(shè)置；

III)當(dāng)用戶要把含有游離分子結(jié)構(gòu)，即包含已設(shè)置了連接點(diǎn)但未被添加到任何RGroup的取代基團(tuán)的族性結(jié)構(gòu)分子保存到文件中時(shí)，系統(tǒng)會(huì)提示發(fā)現(xiàn)非法游離取代基團(tuán)；

IV)如果當(dāng)前未定義Rn原子，此時(shí)往RGroup中添加取代基時(shí)系統(tǒng)提示未找到對(duì)應(yīng)的RGroup定義；

V)如果族性分子結(jié)構(gòu)中至少一個(gè)RGroup不含有任何分子結(jié)構(gòu)，則在保存時(shí)會(huì)提示發(fā)現(xiàn)空RGroup。

5.如權(quán)利要求1所述的一種族性化學(xué)結(jié)構(gòu)標(biāo)引系統(tǒng)，其特征在于：族性化學(xué)結(jié)構(gòu)標(biāo)引系統(tǒng)主界面分割的區(qū)域中同時(shí)包含繪圖區(qū)和瀏覽區(qū)，可分別擴(kuò)大與縮小所述繪圖區(qū)和瀏覽區(qū)尺寸。

6.如權(quán)利要求2所述的一種族性化學(xué)結(jié)構(gòu)標(biāo)引系統(tǒng)，其特征在于：族性結(jié)構(gòu)標(biāo)引子模塊包含一確定結(jié)構(gòu)標(biāo)引子子模塊，一Rn原子定義子子模塊，連接點(diǎn)定義子子模塊，一RGroup定義子子模塊，一RLogic定義子子模塊；其中確定結(jié)構(gòu)標(biāo)引子子模塊用于繪制確定的、無(wú)可變基團(tuán)的分子結(jié)構(gòu)；其中Rn原子定義子子模塊用于在分子結(jié)構(gòu)中定義一個(gè)能夠代表一類取代基的特殊原子；其中連接點(diǎn)定義子子模塊用于為取代基團(tuán)定義取代基與骨架結(jié)構(gòu)的連接位置；Rgroup定義子子模塊用于對(duì)取代基團(tuán)進(jìn)行分組設(shè)置；Rlogic定義子子模塊用于對(duì)RGroup進(jìn)行范圍限定。