[發明專利]一種用于婦科惡性腫瘤早期篩選的基因芯片及其檢測方法

無效

• 申請號: 200710168652.6
• 申請日: 2007-12-07
• 公開（公告）號: CN101230390A
• 公開（公告）日: 2008-07-30
• 發明（設計）人: 陳勇;譚秋萍;朱文婷;張曉雷;王恒松;韓鳳梅
• 申請（專利權）人: 湖北大學
• 主分類號: C12Q1/68
• 分類號: C12Q1/68
• 代理公司: 武漢金堂專利事務所
• 代理人: 丁齊旭

1.一種用于婦科惡性腫瘤早期篩查的寡核苷酸基因芯片的制備，其特征在于制備步驟為：

1)列出在常見婦科惡性腫瘤患者的血液中癌癥基因表達功能明確且可檢測出的特征基因為：

乳腺癌：LTA(NM_000595)；VEGFA(M27281)；ICAM1(NM_000201)；

????????PRL(NM_000948)；IGF1(NM_000618)；BCL2(NM_000657)；

????????ERBB2(NM_004448)；CXCL12(NM_000609)；

????????HMGA2(NM_003483)；FAS(NM_000043)；TNF(NM_000594)；

????????SYK(NM_003177)；ACP5(NM_001611)；KLK2(NM_005551)；

????????EGFR(NM_005228)；IGFBP3(NM_000598)；

卵巢癌：RASSF1(NM_007182)；CD44(X55150)；

子宮癌：TNF(NM_000594)；PRL(NM_000948)；MDM2(NM_002392)；

????????MMP9(NM_004994)；IL-10(NM_000572)；

(2)根據基因序列號，利用數據庫NCBI，確定上述特征基因的完整序列；

(3)找出與上述常見婦科惡性腫瘤特征基因互補的基因，制備出長約20-50個堿基序列的核酸分子的寡核苷酸片段；

(4)然后進行DNA鏈的化學交聯，通常是官能團修飾的寡核苷酸樣品轉移到經化學處理的活化載體上，使寡核苷酸末端與載體發生專一性共價偶聯；

(5)然后沖洗未反應的寡核苷酸探針后，制備出表達有常見婦科惡性腫瘤特征基因的寡核苷酸基因芯片。

2.一種用于婦科惡性腫瘤早期篩查的檢測方法，其特征在于其主要步驟是：

(1)提取出待測病人血液中的樣品基因；

(2)將樣品基因與表達有常見婦科惡性腫瘤特征基因的寡核苷酸基因芯片上的寡核苷酸基因序列進行雜交；

(3)將芯片雜交結果進行信號檢測，將芯片置入芯片掃描儀中，通過掃描可得到顯色結果，分別為：表達量增加為紅色，表達量降低為綠色，表達量不變為黃色；根據檢測雜交信號的顯色情況，可判斷特征基因表達的上下調(即數量的增減)情況；

(4)判讀結果，通常患有常見婦科惡性腫瘤的相關特征基因表達的上下調情況如下：

乳腺癌：表達上調的特征基因：LTA(NM_000595)；VEGFA(M27281)；

????????PRL(NM_000948)；IGF1(NM_000618)；BCL2(NM_000657)；

????????CXCL12(NM_000609)；ERBB2(NM_004448)；HMGA2(NM_003483)；

????????TNF(NM_000594)；SYK(NM_003177)；ACP5(NM_001611)；

????????KLK2(NM_005551)；EGFR(NM_005228)；IGFBP3(NM_000598)；

????????表達下調的特征基因：ICAM1(NM_000201)；FAS(NM_000043)；

卵巢癌：表達上調的特征基因：CD44(X55150)；

????????表達下調的特征基因：RASSF1(NM_007182)；

子宮癌：表達上調的特征基因：TNF(NM_000594)；PRL(NM_000948)；MDM2(NM_002392)；MMP9(NM_004994)；IL-10(NM_000572)；

將實際測得值與上列對照值比較，若出現表達上調的特征基因上調了，或表達下調的特征基因下調了，則可判斷出該病人患有乳腺癌，或卵巢癌，或子宮癌.反之，如果特征基因都未上調或下調，則不患有癌癥。