[發明專利]物質的生物學、生物化學、生物物理或藥理學特性的預測方法無效
| 申請號: | 200710146073.1 | 申請日: | 2007-09-07 |
| 公開(公告)號: | CN101173918A | 公開(公告)日: | 2008-05-07 |
| 發明(設計)人: | 恩德雷·拉茨科 | 申請(專利權)人: | F·霍夫曼-拉·羅奇股份有限公司 |
| 主分類號: | G01N33/48 | 分類號: | G01N33/48;C12Q1/00 |
| 代理公司: | 北京集佳知識產權代理有限公司 | 代理人: | 劉曉東;顧晉偉 |
| 地址: | 瑞士*** | 國省代碼: | 瑞士;CH |
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| 摘要: | |||
| 搜索關鍵詞: | 物質 生物學 生物化學 生物 物理 藥理學 特性 預測 方法 | ||
1.一種用于預測物質的生物學、生物化學、生物物理或藥理學的特性的方法,包括如下步驟:
a)提供樣本數據;
b)通過編碼所述樣本數據對所述樣本數據定標度;
c)分類所述編碼的數據;和
d)提供基于分類結果的預測輸出。
2.如權利要求1所述的方法,還包括在步驟a)之后,將所提供的數據分區段的步驟a1)。
3.如權利要求1或2所述的方法,還包括在步驟a)或步驟a1)之后,歸一化所述數據的步驟。
4.如權利要求3所述的方法,其中所述數據是相對于單位整數的歸一化樣本,以將所述數據轉化成樣本譜。
5.如權利要求4所述的方法,其中所述樣本譜是核磁共振(NMR)譜。
6.如權利要求5所述的方法,其中所述NMR譜是NMR波譜數據的形式。
7.如權利要求6所述的方法,其中排列所述波譜數據以形成矩陣。
8.如權利要求7所述的方法,其中所述數據排列成矩陣,使得對于給定波譜的所有區段數值位于一行,而對于給定區段或波譜區域的所有數值位于一列。
9.如權利要求8所述的方法,還包括在一個或多個長度和順序與所述數據矩陣的列向量相同的輔助列向量中排列一個或多個樣本描述符的步驟。
10.如權利要求9所述的方法,其中所述一個或多個樣本描述符選自包括研究編號、動物編號、取樣時間、劑量組、毒性分類、毒理學變量的集合。
11.如權利要求7至10中任一項所述的方法,還包括替換所述矩陣中的缺失數據數值的步驟。
12.如權利要求11所述的方法,其中所述缺失的數據由參考數值的中值形成。
13.如權利要求12所述的方法,其中所述缺失的數據由相應取樣時間的相應對照組的中值形成。
14.如權利要求7至13中任一項所述的方法,其中所述編碼數據的步驟c)包括根據給定的規則替換所述矩陣的所有數值。
15.如權利要求14所述的方法,其中所述矩陣的數值用指示與參考區域偏離順序的順序數值來替換。
16.如權利要求15所述的方法,其中所述替換形成為n-級順序標度。
17.如權利要求16所述的方法,其中使用3-級順序標度,并且所述矩陣的數值根據所述數值是否低于、等于或高于由相應對照組的第x和第y分位數間距所限定的范圍而用0、1或2替換。
18.如權利要求17所述的方法,其中x為10,y為90。
19.如權利要求16所述的方法,其中使用二進制標度。
20.如前述權利要求中任一項所述的方法,其中步驟c)包括將單獨的編碼數據分成組。
21.如權利要求20所述的方法,其中所述組對應于特定化合物的特定劑量水平。
22.如權利要求20或21所述的方法,其中在步驟d)中,對至少一個組產生預測輸出。
23.如前述權利要求中任一項所述的方法,其中所述物質的生物學特性是其毒性。
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