[發明專利]基于線粒體DNA G5351A單核苷酸多態性檢測高原肺水腫易感性的試劑盒無效
| 申請號: | 200710092815.7 | 申請日: | 2007-10-01 |
| 公開(公告)號: | CN101470095A | 公開(公告)日: | 2009-07-01 |
| 發明(設計)人: | 高鈺琪;羅勇軍;高文祥;黃慶愿;陳建;劉福玉;譚小玲;周其全 | 申請(專利權)人: | 中國人民解放軍第三軍醫大學 |
| 主分類號: | G01N27/447 | 分類號: | G01N27/447;G01N21/64;G01N21/00;C12Q1/68 |
| 代理公司: | 重慶華科專利事務所 | 代理人: | 徐先祿 |
| 地址: | 400038重*** | 國省代碼: | 重慶;85 |
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| 摘要: | |||
| 搜索關鍵詞: | 基于 線粒體 dna g5351a 核苷酸 多態性 檢測 高原 肺水腫 感性 試劑盒 | ||
技術領域
本發明涉及一種疾病檢測用的試劑盒,具體涉及基于線粒體DNA?G5351A單核苷酸多態性檢測高原肺水腫易感性的試劑盒。?
背景技術
我國是世界上高原面積最大、海拔最高、居住人口最多的國家,海拔3000m以上的高原、高山地區占國土總面積的1/6,主要分布在西藏、青海和新疆一帶。上述地區是國家實施西部大開發戰略的重要戰場,隨著青藏鐵路的開通、高原地區國民經濟的發展和旅游事業的興旺,進入高原的人群必將成倍增長。但是,平原人進入高原后將面臨因高原缺氧導致的急性高原病的威脅,特別是由于急性重癥高原病——HAPE(high?altitude?pulmonary?edema,HAPE)的發病率和病死率高,后果嚴重,更使人們對于進入高原地區心存恐懼,不敢涉足。它是一種由于高原低氧環境引起的肺水腫,起病急,進展快,如果搶救不及時,可在較短的時間內發展至呼吸衰竭,甚至死亡,是嚴重威脅進入高原人群健康和生命的急性重癥高原病。近年的調查表明,在進入拉薩的漢族人群中,高原肺水腫的發病率高達0.4%-2%。HAPE發病的種族特異性以及家族和個體易感傾向提示,環境因素和遺傳因素均可以影響HAPE的發生,而機體對環境因素的易感性也受遺傳因素的影響。近年來,遺傳因素在HAPE發病機制中的作用逐漸受到重視【張雪峰,高原施工人群急性重型高原病患病率調查,《高原醫學雜志》,2005;? 15(3):7-8;陳有,高原肺水腫發病機制研究進展,《高原醫學雜志》,2005,15(2):62-64;高鈺琪,高原肺水腫的發病機制及防治,《人民軍醫》,2005;482(2):108-111】。?
由于線粒體于能量代謝密切相關,是氧傳送鏈的生理終點站,是細胞氧耗的主要位點,是一個細胞氧易感性和適應的自然選擇者,因此關于線粒體適應的研究逐漸成為熱點【高文祥,低氧大鼠腦線粒體體外轉錄活性的研究,《中國應用生理學雜志》,2001;17:323-326?】。HAPE是一種低氧習服不良的急性高原病,因而線粒體在HAPE的發生中發生著重要的作用【Moudgil?R,Hypoxicpulmonary?vasoconstriction,《J?Appl?Physiol》,2005;98:390-403】。單核苷酸多態性(SNP),是廣泛分布于人類全基因組中穩定的多態位點,代表了不同個體之間最大的遺傳差異。隨著人類基因組計劃的進展,人們愈來愈相信基因組中的這類多態性有助于解釋個體的表型差異、不同群體和個體對疾病,特別是對復雜疾病的易感性、以及對各種藥物的耐受性和對環境因子的反應。?
LDR(連接酶檢測反應)是一種經濟、快速的檢測SNP常用的方法,其檢測原理是利用高溫連接酶實現對基因多態性位點的識別,高溫連接酶一旦檢測到DNA與互補的兩條寡聚核苷酸接頭對應處存在著基因點突變類型的堿基錯配,則連接反應就不能進行。測序分型原理如下:?
(1)本技術方案先通過PCR(聚合酶鏈反應)獲得含有待檢測突變位點的基因片斷,然后進行LDR,最后通過測序儀電泳讀取檢測結果;?
(2)檢測結果表明,左邊位點,即突變位點一為A/C雜合子,右邊位點,即突變位點二為T純合子(見圖1)。?
LDR與傳統的SNP分型手段相比,LDR技術有多項優勢:?
(1)準確度高:與PCR等技術的假陰性假陽性相比,LDR技術可以比較準確的對SNP進行分型;?
(2)操作簡單:和目前的PCR技術相似,LDR反應操作簡單,對技術人員沒有特殊的專業要求;?
(3)成本低:使用LDR檢測系統只需現有的PCR儀等分子實驗室儀器即可,無需再投入大量的資金購置設備;?
(4)通用性強:成熟的LDR檢測系統適用于各種SNP位點的分型;?
(5)高通量:LDR檢測系統可同時對多達上百個SNP位點進行分型,檢測效率高,滿足復雜疾病及藥物基因組學的診斷需求。?
發明內容
本發明的目的是提供一種基于線粒體DNA?G5351A單核苷酸多態性檢測高原肺水腫易感性的試劑盒,能用于高原肺水腫(簡稱HAPE)易感者的篩選,指導HAPE的預防。?
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