[發(fā)明專利]太平洋牡蠣EST微衛(wèi)星標(biāo)記的篩選方法

有效

• 申請(qǐng)?zhí)枺?/td>: 200710027648.8
• 申請(qǐng)日: 2007-04-23
• 公開(kāi)（公告）號(hào): CN101058831A
• 公開(kāi)（公告）日: 2007-10-24
• 發(fā)明（設(shè)計(jì)）人: 喻子牛;王艷紅
• 申請(qǐng)（專利權(quán)）人: 中國(guó)科學(xué)院南海海洋研究所
• 主分類號(hào): C12Q1/68
• 分類號(hào): C12Q1/68;C12N15/11
• 代理公司: 廣州科粵專利代理有限責(zé)任公司
• 代理人: 賴漢光

1.一種太平洋牡蠣EST微衛(wèi)星標(biāo)記的篩選方法，首先利用GeneBank公布的太平洋牡蠣的ESTs的序列，利用微衛(wèi)星檢索軟件SSRhunter進(jìn)行微衛(wèi)星位點(diǎn)的查找，對(duì)于2-6個(gè)堿基重復(fù)單元重復(fù)次數(shù)大于5的微衛(wèi)星片斷進(jìn)行篩選分離，從而得到含有微衛(wèi)星重復(fù)的ESTs序列；然后在微衛(wèi)星重復(fù)序列兩端的側(cè)翼序列設(shè)計(jì)引物，并進(jìn)一步檢測(cè)優(yōu)化引物成為微衛(wèi)星標(biāo)記；最后對(duì)微衛(wèi)星標(biāo)記的重復(fù)性、穩(wěn)定性和多態(tài)性進(jìn)行綜合評(píng)價(jià)，得到微衛(wèi)星標(biāo)記；其特征在于所篩選到的微衛(wèi)星標(biāo)記的特異引物分別為

Cg-e001：F：TTAACAAGAAAGAAAACGAAGAAA，R：TGTATGGACGCCCGCAGAA；

Cg-e018：F：AACAACAACATGGAAACACCT，R：TCAACAAAGAAACACATCCTG。