[發明專利]單鏈引物-啟動子-選擇子構建體的IVT的應用無效
| 申請號: | 200680041636.4 | 申請日: | 2006-09-21 |
| 公開(公告)號: | CN101589154A | 公開(公告)日: | 2009-11-25 |
| 發明(設計)人: | 邁克爾·休;娜塔莉亞·科澤瓦 | 申請(專利權)人: | 佰爾瑞溶液有限公司 |
| 主分類號: | C12P19/34 | 分類號: | C12P19/34 |
| 代理公司: | 北京安信方達知識產權代理有限公司 | 代理人: | 楊淑媛;鄭 霞 |
| 地址: | 美國新*** | 國省代碼: | 美國;US |
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| 摘要: | |||
| 搜索關鍵詞: | 引物 啟動子 選擇 構建 ivt 應用 | ||
1.一種用于檢測樣品中靶標子序列的存在或相對量的引物-啟動子- 選擇子構建體,其包括以下三個子序列:
與所述靶標子序列互補的引物子序列,其5’末端與啟動子子序列3’ 末端相鄰,所述啟動子子序列能夠引導選擇子子序列的轉錄,所述選擇子 子序列3’末端與所述啟動子子序列的5’末端相鄰,其中所述選擇子子序列 和其互補序列被設計為不與所述樣品中預期存在的任何子序列退火。
2.如權利要求1的構建體,其中所述啟動子不引導所述引物子序列 的轉錄。
3.如權利要求1的構建體,其中所述啟動子為T7或T3或SP6啟動 子子序列。
4.如權利要求1的構建體,其中所述引物子序列能與模板退火和延 伸。
5.如權利要求1的構建體,其包括可識別的標簽。
6.如權利要求1的構建體,其中所述選擇子子序列作為體外轉錄的 模板。
7.一種試劑盒,其包括:多種不同類型的引物-啟動子-選擇子構建體 和一組寡核苷酸,
其中所述構建體各自用于檢測樣品中不同靶標子序列的存在或相對 量,所述構建體各自包括以下三個子序列:與所述靶標子序列互補的引物 子序列,其5’末端與啟動子子序列3’末端相鄰,所述啟動子子序列能夠引 導選擇子子序列的轉錄,所述選擇子子序列3’末端與所述啟動子子序列的 5’末端相鄰;
其中具有不同序列的所述寡核苷酸展示在不同編碼的微顆粒上,并且 其中所述寡核苷酸能夠與所述選擇子子序列的轉錄產物退火。
8.如權利要求7的試劑盒,其中所述不同類型的構建體各自的引物 子序列和選擇子子序列不同。
9.如權利要求8的試劑盒,其中每個類型的構建體有不同的引物子 序列和相同的選擇子子序列。
10.如權利要求7的試劑盒,其還包括能夠摻入所述轉錄產物的經標 記的NTP。
11.如權利要求10的試劑盒,其中所述NTP是光學標記的。
12.如權利要求7的試劑盒,其中所述啟動子為T7或T3或SP6啟動 子子序列(模板鏈)。
13.如權利要求12的試劑盒,其還包括能夠與所述T7、T3或SP6啟 動子子序列形成雙鏈體的非模板T7、T3或SP6啟動子子序列。
14.如權利要求7的試劑盒,其還包括一組不同編碼的微顆粒,所述 微顆粒適合結合不同類型的與所述轉錄產物互補的寡核苷酸。
15.如權利要求7的試劑盒,其還包括一組經標記的ddNTP或dNTP, 所述經標記的ddNTP或dNTP被設計用于在所述引物子序列延伸時摻入延 伸產物。
16.如權利要求7的試劑盒,其還包括半抗原標記的ddNTP或dNTP。
17.如權利要求16的試劑盒,其還包括磁性顆粒。
18.如權利要求7的試劑盒,其還包括能夠與所述樣品中子序列退火 的寡核苷酸,該寡核苷酸定位至引物的靶向子序列的3’端或定位至所述引 物。
19.如權利要求18的試劑盒,其中所述寡核苷酸是經標記的。
20.如權利要求18的試劑盒,其中所述寡核苷酸包括所述啟動子子 序列。
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