[發(fā)明專利]輔助探針及其利用方法有效
| 申請(qǐng)?zhí)枺?/td> | 200680006207.3 | 申請(qǐng)日: | 2006-02-27 |
| 公開(公告)號(hào): | CN101128582A | 公開(公告)日: | 2008-02-20 |
| 發(fā)明(設(shè)計(jì))人: | 藤川利彥;薄井貢 | 申請(qǐng)(專利權(quán))人: | 衛(wèi)材R&D管理有限公司 |
| 主分類號(hào): | C12N15/09 | 分類號(hào): | C12N15/09;C12Q1/68;G01N33/566 |
| 代理公司: | 中科專利商標(biāo)代理有限責(zé)任公司 | 代理人: | 李貴亮 |
| 地址: | 日本國*** | 國省代碼: | 日本;JP |
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| 摘要: | |||
| 搜索關(guān)鍵詞: | 輔助 探針 及其 利用 方法 | ||
1.一種目標(biāo)基因的檢測(cè)方法,其是使用包含如下所述的兩個(gè)探針的一對(duì)第一及第二探針、以及具有多個(gè)與所述第一探針相同的核酸區(qū)域和可以與目標(biāo)基因雜交的目標(biāo)區(qū)域的輔助探針,形成信號(hào)探針聚合物,來檢測(cè)目標(biāo)基因的方法,其中的兩個(gè)探針為:
從5’端部開始依次設(shè)置有核酸區(qū)域X、核酸區(qū)域Y及核酸區(qū)域Z,具有下述化學(xué)式(1)的結(jié)構(gòu),包含3處核酸區(qū)域的第一探針;
[化1]
從5’端部開始依次設(shè)置核酸區(qū)域X’、核酸區(qū)域Y’及核酸區(qū)域Z’,具有下述化學(xué)式(2)的結(jié)構(gòu),包含3處核酸區(qū)域的第二探針;
[化2]
在所述化學(xué)式(1)及(2)中,核酸區(qū)域X與核酸區(qū)域X’、核酸區(qū)域Y與核酸區(qū)域Y’、核酸區(qū)域Z與核酸區(qū)域Z’分別為可以雜交的互補(bǔ)區(qū)域;
在所述的檢測(cè)方法中,所述輔助探針具有從5’端部開始依次設(shè)置有所述核酸區(qū)域X、所述核酸區(qū)域Y、所述核酸區(qū)域X及所述目標(biāo)區(qū)域的結(jié)構(gòu),或從5’端部開始依次設(shè)置有所述目標(biāo)區(qū)域、所述核酸區(qū)域Z、所述核酸區(qū)域Y及所述核酸區(qū)域Z的結(jié)構(gòu)。
2.根據(jù)權(quán)利要求1所述的目標(biāo)基因的檢測(cè)方法,其特征在于,
所述輔助探針在所述目標(biāo)區(qū)域與所述核酸區(qū)域X或所述核酸區(qū)域Z之間,還具有不與目標(biāo)基因以及所述第一及第二探針雜交的間隔區(qū)域。
3.根據(jù)權(quán)利要求1或2所述的目標(biāo)基因的檢測(cè)方法,其特征在于,
所述輔助探針,從5’端部開始依次含有包含所述核酸區(qū)域X、所述核酸區(qū)域Y及所述核酸區(qū)域X的XYX區(qū)域,包含所述核酸區(qū)域Y及所述核酸區(qū)域X的YX區(qū)域,所述目標(biāo)區(qū)域;或者從5’端部開始依次含有所述目標(biāo)區(qū)域,包含所述核酸區(qū)域Z及所述核酸區(qū)域Y的ZY區(qū)域,包含所述核酸區(qū)域Z、所述核酸區(qū)域Y及所述核酸區(qū)域Z的ZYZ區(qū)域。
4.根據(jù)權(quán)利要求3所述的目標(biāo)基因的檢測(cè)方法,其特征在于,
在所述XYX區(qū)域與所述YX區(qū)域之間、或所述ZY區(qū)域與所述ZYZ區(qū)域之間,還含有不與目標(biāo)基因以及所述第一及第二探針雜交的間隔區(qū)域。
5.根據(jù)權(quán)利要求1~4中任意一項(xiàng)所述的目標(biāo)基因的檢測(cè)方法,其特征在于,
包含使所述輔助探針以所述目標(biāo)基因?yàn)槟0暹M(jìn)行連接的反應(yīng)工序。
6.根據(jù)權(quán)利要求1~4中任意一項(xiàng)所述的目標(biāo)基因的檢測(cè)方法,其特征在于,
所述輔助探針在3’末端的目標(biāo)區(qū)域具有多聚dT或引物序列,包含將所述輔助探針作為引物、以目標(biāo)RNA為模板進(jìn)行逆轉(zhuǎn)錄的反應(yīng)工序。
7.根據(jù)權(quán)利要求1~6中任意一項(xiàng)所述的目標(biāo)基因的檢測(cè)方法,其特征在于,
通過使用只有所述目標(biāo)區(qū)域不同的多個(gè)輔助探針,同時(shí)檢測(cè)多個(gè)目標(biāo)基因。
8.一種信號(hào)探針聚合物的形成方法,其是使用包含如下所述的兩個(gè)探針的一對(duì)第一及第二探針、以及具有多個(gè)與所述第一探針相同的核酸區(qū)域和可以與目標(biāo)基因雜交的目標(biāo)區(qū)域的輔助探針,使所述一對(duì)第一及第二探針的多對(duì)、所述輔助探針和所述目標(biāo)基因發(fā)生反應(yīng),形成信號(hào)探針聚合物的方法,其中的兩個(gè)探針為:
從5’端部開始依次設(shè)置有核酸區(qū)域X、核酸區(qū)域Y及核酸區(qū)域Z,具有下述化學(xué)式(1)的結(jié)構(gòu),包含3處核酸區(qū)域的第一探針;
[化3]
從5’端部開始依次設(shè)置有核酸區(qū)域X’、核酸區(qū)域Y’及核酸區(qū)域Z’,具有下述化學(xué)式(2)的結(jié)構(gòu),包含3處核酸區(qū)域的第二探針;
[化4]
在所述化學(xué)式(1)及(2)中,核酸區(qū)域X與核酸區(qū)域X’、核酸區(qū)域Y與核酸區(qū)域Y’、核酸區(qū)域Z與核酸區(qū)域Z’分別為可以雜交的互補(bǔ)區(qū)域;
在所述的檢測(cè)方法中,所述輔助探針具有從5’端部開始依次設(shè)置有所述核酸區(qū)域X、所述核酸區(qū)域Y、所述核酸區(qū)域X及所述目標(biāo)區(qū)域的結(jié)構(gòu),或從5’端部開始依次設(shè)置有所述目標(biāo)區(qū)域、所述核酸區(qū)域Z、所述核酸區(qū)域Y及所述核酸區(qū)域Z的結(jié)構(gòu)。
9.一種輔助探針,其特征在于,
在權(quán)利要求1~8中任意一項(xiàng)所述的方法中使用,具有從5’端部開始依次設(shè)置具有所述核酸區(qū)域X、所述核酸區(qū)域Y及所述核酸區(qū)域X的XYX區(qū)域和所述目標(biāo)區(qū)域的結(jié)構(gòu)。
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