[發(fā)明專利]檢測DNA點突變的方法(SNP分析)和相關的裝置有效
| 申請?zhí)枺?/td> | 200480021969.1 | 申請日: | 2004-05-28 |
| 公開(公告)號: | CN101094923A | 公開(公告)日: | 2007-12-26 |
| 發(fā)明(設計)人: | 沃爾特·岡布雷赫特;彼得·波里卡;曼弗雷德·斯坦?jié)蔂?/a> | 申請(專利權)人: | 西門子公司 |
| 主分類號: | C12Q1/68 | 分類號: | C12Q1/68;C12P19/34 |
| 代理公司: | 北京市柳沈律師事務所 | 代理人: | 巫肖南;封新琴 |
| 地址: | 德國*** | 國省代碼: | 德國;DE |
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| 摘要: | |||
| 搜索關鍵詞: | 檢測 dna 突變 方法 snp 分析 相關 裝置 | ||
1.一種用于檢測DNA點突變(SNP分析)的方法,其中利用待測目標DNA與在DNA芯片上位置特異性固定的捕手DNA的結合(雜交),其中進行限定的時間過程,具有以下步驟:
a)以已調整的流速將洗滌溶液導引到DNA芯片上,
b)按規(guī)定改變雜交位置上的溫度,
c)溫度依賴性地熔解捕手/目標DNA雜交體并通過流動的洗滌溶液將捕手/目標DNA雜交體從雜交位置上移開,
d)在預定時間間隔內將流速調整為零,
e)在當前溫度下位置特異性地檢測已結合的目標DNA,而對結合的目標DNA的位置特異性檢測通過“未被洗掉的”洗滌溶液進行,
f)根據(jù)預定程序評估信號。
2.根據(jù)權利要求1的方法,其特征在于,多次重復步驟a)到e)。
3.根據(jù)權利要求1或2的方法,其特征在于,溫度變化在于持續(xù)不斷的升高。
4.根據(jù)權利要求3的方法,其特征在于,持續(xù)不斷的溫度升高作為時間的函數(shù)是線性的。
5.根據(jù)權利要求4的方法,其特征在于,持續(xù)不斷的溫度升高以帶有保持時間的斜面作為時間的函數(shù)進行。
6.根據(jù)權利要求5的方法,其特征在于,在保持時間中在DNA芯片上的液流被停止。
7.根據(jù)上述任何一項權利要求的方法,其特征在于,對已結合的目標DNA的檢測是以無標記(無標記物)的形式進行的。
8.根據(jù)權利要求9的方法,其特征在于,無標記檢測以光學形式進行。
9.根據(jù)權利要求8的方法,其特征在于,光學檢測利用DNA雙鏈熔解期間UV吸收的內在變化。
10.根據(jù)權利要求7的方法,其特征在于,無標記檢測以電學方式進行。
11.根據(jù)權利要求7的方法,其特征在于,無標記檢測借助內在的鳥嘌呤氧化進行。
12.根據(jù)權利要求10的方法,其特征在于,利用電化學阻抗方法進行無標記檢測。
13.根據(jù)權利要求7的方法,其特征在于,以重量測量的方式進行無標記檢測。
14.根據(jù)權利要求1到5的任何一個的方法,其特征在于,在利用標記(標記物)的情況下進行已結合的目標DNA的檢測。
15.根據(jù)權利要求14的方法,其特征在于,借助光學標記進行檢測。
16.根據(jù)權利要求14的方法,其特征在于,借助磁性標記進行檢測。
17.根據(jù)權利要求16的方法,其特征在于,借助酶標記進行檢測。
18.根據(jù)權利要求17的方法,其特征在于,所述洗滌溶液含有酶底物。
19.根據(jù)權利要求18的方法,其特征在于,所述酶在所使用的溫度范圍是穩(wěn)定的(有活性的)。
20.根據(jù)權利要求16到19的方法,其特征在于,所述酶標記催化的反應是光學可檢測的。
21.根據(jù)權利要求16到19的方法,其特征在于,所述酶標記催化的反應是電化學可檢測的。
22.根據(jù)權利要求21的方法,其特征在于,在電化學檢測方法中涉及利用氧化還原循環(huán)進行加強的電流測量。
23.根據(jù)權利要求16到19的方法,其特征在于,檢測和評估底物或產(chǎn)物濃度的改變。
24.根據(jù)上述任何一項權利要求的方法,其特征在于,傳感器信號(檢測信號)的評估和顯示作為溫度的函數(shù)進行。
25.根據(jù)權利要求24的方法,其特征在于,在確定的溫度上進行熔解曲線的標準化。
26.根據(jù)上述任何一項權利要求的方法,其特征在于,所述評估是計算機控制的。
27.根據(jù)權利要求26的方法,其特征在于,所述評估是根據(jù)軟件進行的。
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