[發明專利]一種貼壁細胞計數方法有效
| 申請號: | 202310926803.9 | 申請日: | 2023-07-27 |
| 公開(公告)號: | CN116664556B | 公開(公告)日: | 2023-10-10 |
| 發明(設計)人: | 史相杰;劉家宏;劉河山;楊程 | 申請(專利權)人: | 南京九川科學技術有限公司 |
| 主分類號: | G06T7/00 | 分類號: | G06T7/00;G06T7/62;G06T7/13;G06T7/12 |
| 代理公司: | 北京鑫瑞森知識產權代理有限公司 11961 | 代理人: | 王鐘楠 |
| 地址: | 210000 江*** | 國省代碼: | 江蘇;32 |
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| 摘要: | |||
| 搜索關鍵詞: | 一種 細胞 計數 方法 | ||
1.一種貼壁細胞計數方法,其特征在于,包括:
采集待計數區域的細胞圖片;
根據所述細胞圖片計算細胞像素匯合度;
判斷第一預設閾值是否大于所述細胞像素匯合度,若是,則將所述細胞圖片劃確定為高匯合度圖片,若否,則將所述細胞圖片確定為低匯合度圖片;
根據所述低匯合度圖片中的細胞輪廓面積進行細胞計數,得到計算結果;或
根據所述高匯合度圖片的細胞面積進行細胞計數,得到計算結果。
2.根據權利要求1所述的貼壁細胞計數方法,其特征在于,根據所述低匯合度圖片中的細胞輪廓面積進行細胞計數,得到計算結果,包括:
采集所述低匯合度圖片中的所有的細胞輪廓,并計算所述細胞輪廓面積;
根據第二預設閾值與所述細胞輪廓面積將所述低匯合度圖片劃分為小面積細胞區域和大面積細胞區域;
根據所述大面積細胞區域的面積和單個細胞的面積對細胞進行計數,得到第一數量;
計算所述小面積細胞區域的細胞圖上非零像素點到最近的零像素點之間的距離,并生成距離圖;
將距離圖進行自適應的閾值分割,得到二值圖,并根據所述二值圖對細胞進行計數,得到第二數量;
將所述第一數量和所述第二數量進行相加,得到所述計算結果。
3.根據權利要求2所述的貼壁細胞計數方法,其特征在于,根據所述大面積細胞區域的面積和單個細胞的面積對細胞進行計數,得到第一數量,包括:
將所有的大面積細胞區域的面積進行相加,得到大面積細胞區域的面積之和;
將大面積細胞區域的面積之和除以單個細胞的面積,得到所述第一數量。
4.根據權利要求3所述的貼壁細胞計數方法,其特征在于,所述單個細胞的面積是基于大量細胞面積統計得到的數據。
5.根據權利要求2所述的貼壁細胞計數方法,其特征在于,將距離圖進行自適應的閾值分割,得到二值圖,并根據所述二值圖對細胞進行計數,得到第二數量,包括:
根據每張所述距離圖上的最大距離的0.1倍到1這十個數值來選取分割閾值,遍歷這十個數值,根據這十個數值對應得到的二值圖中輪廓數來選取具體的閾值,選取輪廓數最大所對應的閾值;
使用輪廓數最大所對應的閾值對所述距離圖進行二值化處理,得到一張二值圖,此二值圖是前景區域也就是確定的細胞區域,然后將原始圖與二值化之后的圖進行相減得到可能存在細胞粘連的部分,并將所述可能存在細胞粘連的部分定義為未知區域;
將所述未知區域打標簽,以得到標簽圖;不同的細胞被打上了不同的標簽;打標簽的過程中無細胞區域的標簽被標記為0,將標簽圖統一加上1,這樣無細胞的區域就被標記為1;
根據所述未知區域將標簽圖中同樣位置的標簽置為0;
根據標簽圖找到原圖上的極小值點,并在原圖上的極小值點周圍4鄰域或者8鄰域范圍內尋找領域中像素的最小值,當鄰域中找到一個最小值接著在當前領域的下一個領域找最小值,依次迭代下去,在每個被打標簽的極小值區域周圍均得到一個包含最小值的隊列,并且對每個隊列進行區分,將每個隊列的交集的位置的像素值置為-1,將數組中為-1的地方對應到原圖上,并將原圖為-1的位置置為0,最后將原圖進行腐蝕,以將粘連細胞分開;
對分開的細胞進行計數,得到所述第二數量。
6.根據權利要求1所述的貼壁細胞計數方法,其特征在于,根據所述高匯合度圖片的細胞面積進行細胞計數,得到計算結果,包括:
將所有細胞區域面積相加得到細胞面積總和,然后將細胞面積總和除于單個細胞面積,得到大面積細胞團中的細胞數量,并作為所述計算結果。
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