[發明專利]基于菘藍全基因組開發的SSR引物組及其應用

在審

• 申請號: 202310569029.0
• 申請日: 2023-05-19
• 公開（公告）號: CN116463453A
• 公開（公告）日: 2023-07-21
• 發明（設計）人: 隋春;孫天琦;周蕾
• 申請（專利權）人: 中國醫學科學院藥用植物研究所
• 主分類號: C12Q1/6895
• 分類號: C12Q1/6895;C12N15/11
• 代理公司: 北京紀凱知識產權代理有限公司 11245
• 代理人: 關暢

1.菘藍的SSR分子標記引物組合物，其特征在于，所述組合物包括8對引物中的至少1對，所述8對引物名稱為SSRSL01、SSRSL02、SSRSL03、SSRSL04、SSRSL05、SSRSL06、SSRSL07和SSRSL08，所述8對引物的核苷酸序列如SEQ?ID?No.1-SEQ?IDNo.16所示。

2.試劑盒，其特征在于，所述試劑盒包含權利要求1所述的SSR分子標記引物組合物。

3.DNA芯片，其特征在于，所述DNA芯片包含權利要求1所述的SSR分子標記引物組合物。

4.權利要求1所述SSR分子標記引物組合物在下述任一種應用：

A1)在菘藍遺傳多樣性分析中的應用；

A2)在菘藍品種多樣性分析中的應用；

A3)在菘藍親緣關系分析中的應用；

A4)在菘藍品種鑒定中的應用；

A5)在構建菘藍遺傳圖譜或DNA指紋圖譜中的應用；

A6)在菘藍種質資源改良中的應用；

A7)在菘藍基因定位或功能基因挖掘中的應用；

A8)在菘藍分子標記輔助育種中的應用。

5.權利要求2所述試劑盒在下述任一種應用：

A1)在菘藍遺傳多樣性分析中的應用；

A2)在菘藍品種多樣性分析中的應用；

A3)在菘藍親緣關系分析中的應用；

A4)在菘藍品種鑒定中的應用；

A5)在構建菘藍遺傳圖譜或DNA指紋圖譜中的應用；

A6)在菘藍種質資源改良中的應用；

A7)在菘藍基因定位或功能基因挖掘中的應用；

A8)在菘藍分子標記輔助育種中的應用。

6.權利要求3所述DNA芯片在下述任一種應用：

A1)在菘藍遺傳多樣性分析中的應用；

A2)在菘藍品種多樣性分析中的應用；

A3)在菘藍親緣關系分析中的應用；

A4)在菘藍品種鑒定中的應用；

A5)在構建菘藍遺傳圖譜或DNA指紋圖譜中的應用；

A6)在菘藍種質資源改良中的應用；

A7)在菘藍基因定位或功能基因挖掘中的應用；

A8)在菘藍分子標記輔助育種中的應用。

7.一種利用權利要求1所述SSR分子標記引物組合物進行菘藍遺傳多樣性分析或親緣關系分析的方法，其特征在于，所述方法包括：以待測菘藍基因組DNA為模板，利用權利要求1所述的SSR分子標記引物組合物進行PCR擴增，得到PCR擴增產物，對所述PCR擴增產物進行電泳檢測，根據電泳檢測結果進行菘藍遺傳多樣性分析或親緣關系分析。

8.根據權利要求7所述的方法，其特征在于，PCR擴增的程序為：96℃預變性5min；96℃變性10s，65℃退火30s，72℃延伸45s，共35個循環；最后72℃末端延伸10min。