[發明專利]一種絲狀真菌通用CRISPR/Cas9編輯系統及其構建方法在審
| 申請號: | 202310403822.3 | 申請日: | 2023-04-17 |
| 公開(公告)號: | CN116555316A | 公開(公告)日: | 2023-08-08 |
| 發明(設計)人: | 黃和;施天穹;郭琪;張馳;徐晴 | 申請(專利權)人: | 南京師范大學 |
| 主分類號: | C12N15/80 | 分類號: | C12N15/80;C12N15/66;C12R1/685;C12R1/68;C12R1/645 |
| 代理公司: | 西安杜諾匠心專利代理事務所(普通合伙) 61272 | 代理人: | 蘇雪雪 |
| 地址: | 210046 *** | 國省代碼: | 江蘇;32 |
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| 摘要: | |||
| 搜索關鍵詞: | 一種 絲狀 真菌 通用 crispr cas9 編輯 系統 及其 構建 方法 | ||
1.一種絲狀真菌通用CRISPR/Cas9編輯系統的構建方法,其特征在于,包括如下步驟:
獲取絲狀真菌H2B定位信號和5sRNA啟動子的核苷酸序列;
將絲狀真菌H2B作為模板設計引物FFH2B-F和FFH2B-R,并PCR擴增出帶有同源臂的FFH2B表達框之后,利用內切酶SpeI將模板質粒pUC-Cas9-HPH酶切成線性片段,并將線性片段與所述帶有同源臂的FFH2B表達框進行克隆和測序驗證,獲得重組質粒pUC-Cas9-HPH-FFH2B,其中,所述模板質粒pUC-Cas9-HPH的核苷酸序列為SEQ?ID?NO.5所示;
將絲狀真菌N20表達框作為模板設計引物FFN20-F和FFN20-R,并擴增出帶有同源臂的FFN20表達框之后,利用內切酶KpnI將模板質粒pUCneo酶切成線性片段,并將線性片段與所述帶有同源臂的FFN20表達框進行克隆和測序驗證,獲得重組質粒pUCneo-FfN20;
將所述重組質粒pUC-Cas9-HPH-FFH2B與所述重組質粒pUCneo-FFN20同時轉化到絲狀真菌感受態細胞中,即可根據靶標基因進行編輯。
2.根據權利要求1所述的構建方法,其特征在于,根據NCBI獲取所述絲狀真菌H2B定位信號和所述5sRNA啟動子的核苷酸序列。
3.根據權利要求1所述的構建方法,其特征在于,所述絲狀真菌包括藤倉赤霉菌、煙曲霉、黑曲霉。
4.根據權利要求3所述的構建方法,其特征在于,所述絲狀真菌選為藤倉赤霉菌時,相匹配的引物FfH2B-F的核苷酸序列為SEQ?ID?NO.3所示;相匹配的引物FfH2B-R的核苷酸序列為SEQ?ID?NO.4所示。
5.根據權利要求4所述的構建方法,其特征在于,相匹配的引物FfN20-F的核苷酸序列為SEQ?ID?NO.7所示;相匹配的引物FfN20-R的核苷酸序列為SEQ?IDNO.8所示。
6.根據權利要求3所述的構建方法,其特征在于,所述絲狀真菌選為黑曲霉時,相匹配的引物AnH2B-F的核苷酸序列為SEQ?ID?NO.13所示;所述引物AnH2B-R的核苷酸序列為SEQID?NO.14所示。
7.根據權利要求6所述的構建方法,其特征在于,相匹配的引物AnN20-F的核苷酸序列為SEQ?ID?NO.16所示;相匹配的引物AnN20-R的核苷酸序列為SEQ?ID?NO.17所示。
8.根據權利要求3所述的構建方法,其特征在于,所述絲狀真菌選為煙曲霉時,相匹配的引物AfH2B-F的核苷酸序列為SEQ?ID?NO.21所示;相匹配的引物AfH2B-R的核苷酸序列為SEQ?ID?NO.22所示。
9.根據權利要求8所述的構建方法,其特征在于,相匹配的引物AfN20-F的核苷酸序列為SEQ?ID?NO.24所示;相匹配的引物AfN20-R的核苷酸序列為SEQ?ID?NO.25所示。
10.一種根據權利要求1-9所述方法構建的絲狀真菌通用CRISPR/Cas9編輯系統。
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