[發明專利]鑒定蒙古羊與非蒙古羊的SNP位點組合及其應用在審
| 申請號: | 202310311344.3 | 申請日: | 2023-03-28 |
| 公開(公告)號: | CN116426649A | 公開(公告)日: | 2023-07-14 |
| 發明(設計)人: | 佟彬;傅博 | 申請(專利權)人: | 內蒙古大學;內蒙古科基芯生物科技有限責任公司 |
| 主分類號: | C12Q1/6888 | 分類號: | C12Q1/6888;C12Q1/6858;C12N15/11 |
| 代理公司: | 北京細軟智谷知識產權代理有限責任公司 11471 | 代理人: | 秦瓊 |
| 地址: | 010000 內蒙古自*** | 國省代碼: | 內蒙古;15 |
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| 摘要: | |||
| 搜索關鍵詞: | 鑒定 蒙古 snp 組合 及其 應用 | ||
本發明涉及動物品種鑒定技術領域,尤其涉及一種鑒定蒙古羊與非蒙古羊SNP位點組合及其應用。本發明的鑒定蒙古羊與非蒙古羊的13個SNP位點組合,包括:Chr1_173513588、Chr3_121675363、Chr4_76823333、Chr4_113093619、Chr6_106334764、Chr7_89308288、Chr10_29752387、Chr14_14157542、Chr14_57000150、Chr16_55975168、Chr21_33513100、Chr23_23278786或Chr23_60100530。本發明首次提出了用于鑒定蒙古羊及非蒙古羊13個差異位點,首次提出了用于鑒定蒙古羊及非蒙古羊參考群數據模型,本發明為今后蒙古羊與非蒙古羊的鑒定、保種、以及遺傳育種提供了有力的技術支持。
技術領域
本發明涉及動物品種鑒定技術領域,尤其涉及一種鑒定蒙古羊與非蒙古羊SNP位點組合及其應用。
背景技術
蒙古羊(Mongolia?sheep)(Ovis?aries)是我國三大粗毛羊品種之一,主要分布在內蒙古、東北、華北和西北等地,蒙古羊是包括蘇尼特羊、烏珠穆沁羊、呼倫貝爾羊、灘羊、巴音布魯克羊、小尾寒羊、多浪羊和湖羊等中國短尾、肥尾羊品種的共同祖先。蒙古羊具有生活力強、適于游牧、耐寒、耐旱等特點,并有較好的產肉、脂性能,是我國寶貴的綿羊遺傳資源。在內蒙古自治區,蒙古羊主要分為蘇尼特羊、烏珠穆沁羊和呼倫貝爾羊三大群體,總存欄約2000萬只。近年來,內蒙古牧區以蒙古羊為主的羊肉作為一種天然綠色食品受到國內市場的廣泛認可。然而,最近出現的蒙古羊和其他羊類品種的雜交后代,以及大量區外的育肥羊進入內蒙古自治區屠宰加工產業鏈,冒充“內蒙羊”返銷內地市場的情況,嚴重破壞了內蒙古自治區“草原綠色生態”羊肉制品的金字招牌。為穩定蒙古羊品質,重樹蒙古羊品牌形象,將蒙古羊打造成為全國乃至全球馳名品牌,我們通過對蒙古羊與非蒙古羊的鑒定,為今后蒙古羊的鑒定保種以及遺傳育種奠定基礎。
近年來隨著分子生物學的發展,基因檢測技術在生物物種鑒定中也取得了長足的進展。基因檢測技術以其幾乎可以對所有的生物類材料進行鑒定而被廣泛應用于動植物物種鑒定。基因檢測技術鑒定動植物物種是物種識別中發展最快、準確率最高的技術手段。
全基因組重測序是對基因組序列已知的個體進行全基因組范圍的測序,隨著測序成本降低和已知基因組序列的物種增多,重測序已經成為動植物育種研究中最為有效的方法之一。Sequenom?SNP分型技術通過引物延伸反應原理進行,將靈敏的PCR擴增和可靠的MALDI-TOF質譜技術相結合,實現基因分型檢測,此技術特別適合對全基因組研究發現的結果進行驗證。
發明內容
本發明的目的在于提供一種用于鑒定蒙古羊與非蒙古羊的SNP位點組合。
本發明的目的在于檢測待測羊基因組中的SNP位點組合的基因型的物質的用途。
根據本發明具體實施方式的鑒定蒙古羊與非蒙古羊的SNP位點組合,其包括:Chr1_173513588、Chr3_121675363、Chr4_76823333、Chr4_113093619、Chr6_106334764、Chr7_89308288、Chr10_29752387、Chr14_14157542、Chr14_57000150、Chr16_55975168、Chr21_33513100、Chr23_23278786和/或Chr23_60100530。
本發明的提供的上述SNP位點中任意一個SNP位點即可用于鑒定蒙古羊與非蒙古羊,或者,將上述SNP位點進行組合后進行鑒定蒙古羊與非蒙古羊,例如,組合任意兩個SNP位點,組合任意三個或多個SNP位點,均可用于蒙古羊與非蒙古羊的鑒定。
其中,本發明的優選方式為將上述13個SNP組合一起,共同用于鑒定蒙古羊與非蒙古羊。
本發明提供了檢測待測羊基因組中的如下SNP位點組合的基因型的物質在鑒定待測羊是否為蒙古羊或非蒙古羊中的應用;所述SNP位點組合包括13個位點,各位點的位置及多態性如下:
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