[發(fā)明專(zhuān)利]一種與棉花纖維長(zhǎng)度QTL緊密連鎖的KASP分子標(biāo)記和應(yīng)用

在審

• 申請(qǐng)?zhí)枺?/td>: 202310247574.8
• 申請(qǐng)日: 2023-03-15
• 公開(kāi)（公告）號(hào): CN116144827A
• 公開(kāi)（公告）日: 2023-05-23
• 發(fā)明（設(shè)計(jì)）人: 杜雄明;趙盈睿;何守樸;陳保軍;潘兆娥;賈銀華;龐保印;王靜靜
• 申請(qǐng)（專(zhuān)利權(quán)）人: 中國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué)院棉花研究所
• 主分類(lèi)號(hào): C12Q1/6895
• 分類(lèi)號(hào): C12Q1/6895;C12Q1/6858;C12N15/11
• 代理公司: 北京東方盛凡知識(shí)產(chǎn)權(quán)代理有限公司 11562
• 代理人: 高天星

1.一種與棉花纖維長(zhǎng)度QTL緊密連鎖的KASP分子標(biāo)記組合，其特征在于，包括以下(1)-(3)中至少一項(xiàng)所述的KASP分子標(biāo)記組合：

(1)與棉花纖維長(zhǎng)度QTL中FL5區(qū)間緊密連鎖的KASP分子標(biāo)記KASP-G41、KASP-G42、KASP-G43和KASP-G44；

(2)與棉花纖維長(zhǎng)度QTL中FL3區(qū)間緊密連鎖的KASP分子標(biāo)記KASP-G21、KASP-G22、KASP-G23和KASP-G24；

(3)與棉花纖維長(zhǎng)度QTL中FL2區(qū)間緊密連鎖的KASP分子標(biāo)記KASP-G31、KASP-G32、KASP-G33和KASP-G34；

所述KASP-G41的SNP位點(diǎn)的物理位置為A07染色體的88,396,617bp，為C/T突變；

所述KASP-G42的SNP位點(diǎn)的物理位置為A07染色體的88,437,416bp，為A/G突變；

所述KASP-G43的SNP位點(diǎn)的物理位置為A07染色體的88,459,489bp，為C/T突變；

所述KASP-G44的SNP位點(diǎn)的物理位置為A07染色體的88,469,638bp，為C/T突變；

所述KASP-G21的SNP位點(diǎn)的物理位置為A09染色體的61,894,952bp，為C/G突變；

所述KASP-G22的SNP位點(diǎn)的物理位置為A09染色體的61,890,951bp，為C/G突變；

所述KASP-G23的SNP位點(diǎn)的物理位置為A09染色體的61,976,868bp，為C/T突變；

所述KASP-G24的SNP位點(diǎn)的物理位置為A09染色體的62,027,231bp，為C/G突變；

所述KASP-G31的SNP位點(diǎn)的物理位置為D11染色體的24,669,170bp，為G/T突變；

所述KASP-G32的SNP位點(diǎn)的物理位置為D11染色體的24,671,829bp，為C/G突變；

所述KASP-G33的SNP位點(diǎn)的物理位置為D11染色體的24,676,672bp，為C/T突變；

所述KASP-G34的SNP位點(diǎn)的物理位置為D11染色體的24,567,513bp，為A/G突變。

2.一種與棉花纖維長(zhǎng)度QTL中FL5區(qū)間緊密連鎖的KASP引物對(duì)組合，其特征在于，所述KASP引物對(duì)組合包括如下表所示引物：

3.一種與棉花纖維長(zhǎng)度QTL中FL3區(qū)間緊密連鎖的KASP引物對(duì)組合，其特征在于，所述KASP引物對(duì)組合包括如下表所示引物：

4.一種與棉花纖維長(zhǎng)度QTL中FL2區(qū)間緊密連鎖的KASP引物對(duì)組合，其特征在于，所述KASP引物對(duì)組合包括如下表所示引物：

5.一種利用單個(gè)棉花纖維長(zhǎng)度QTL分子標(biāo)記鑒定棉花纖維長(zhǎng)度性狀的方法，其特征在于，包括以下步驟，

S1.利用如權(quán)利要求2-4任一項(xiàng)所述的KASP引物對(duì)組合對(duì)待測(cè)棉花材料進(jìn)行KASP分子標(biāo)記基因型分型檢測(cè)；

S2.當(dāng)能夠讀取到以下(1)-(3)任一項(xiàng)所述的擴(kuò)增信號(hào)時(shí)，將所述待測(cè)棉花材料鑒定為棉花長(zhǎng)纖維性狀植株：

(1)當(dāng)采用如權(quán)利要求2所述的KASP引物對(duì)組合時(shí)，所述KASP-G41、所述KASP-G42、所述KASP-G43和所述KASP-G44均檢測(cè)到引物類(lèi)型為X的擴(kuò)增信號(hào)；

(2)當(dāng)采用如權(quán)利要求3所述的KASP引物對(duì)組合時(shí)，所述KASP-G21、所述KASP-G22、所述KASP-G23和所述KASP-G24均檢測(cè)到引物類(lèi)型為Y的擴(kuò)增信號(hào)；

(3)當(dāng)采用如權(quán)利要求4所述的KASP引物對(duì)組合時(shí)，所述KASP-G31、所述KASP-G32、所述KASP-G33和所述KASP-G34均檢測(cè)到引物類(lèi)型為X的擴(kuò)增信號(hào)。