[發明專利]一種與豬達115公斤體重日齡相關的SNP分子標記及應用

在審

• 申請號: 202310211614.3
• 申請日: 2023-03-07
• 公開（公告）號: CN116287305A
• 公開（公告）日: 2023-06-23
• 發明（設計）人: 李結;黃如渠;路鵬云;葉勇;李紹云;關翔;吳業明;王文洲;楊杰
• 申請（專利權）人: 廣東廣墾畜牧集團股份有限公司;廣東廣墾畜牧工程研究院有限公司
• 主分類號: C12Q1/6888
• 分類號: C12Q1/6888;C12N15/11
• 代理公司: 北京中普鴻儒知識產權代理有限公司 11822
• 代理人: 曲芳兵

本發明公開了一種與豬達115公斤體重日齡相關的分子標記，該分子標記為位于國際豬基因組Sscrofa11.1版本第1號染色體第160284793bp位點處的GA突變或位于如SEQ?ID?NO：1所示的第131位點的M表示的GA突變，該分子標記與豬達115公斤體重日齡性狀顯著相關，通過使用該分子標記可以建立高效準確的分子標記輔助育種技術，將其應用于降種豬達115公斤體重日齡的遺傳改良中，從而提高豬群體的生長速度，提高企業經濟利潤，增加核心競爭力。通過優選該SNP分子標記的優勢等位基因，能夠逐代增加優勢等位基因頻率，降低核心群種豬達115公斤體重日齡，加快種豬相關生長性狀的改良進展從而有效提高種豬育種的經濟效益。

技術領域

本發明涉及動物遺傳育種領域，特別涉及一種與豬達115公斤體重日齡相關的SNP分子標記及應用。

背景技術

豬達115公斤體重日齡和豬的生長性能直接相關。豬的生長速度越慢，意味著豬達到115公斤上市體重的日齡越大，從而增加飼養成本并降低豬場經濟效益。因此，研究豬的達115公斤體重日齡，具有重要的育種研究意義和現實意義。

相較于基于表型選擇的傳統選育方式，利用分子標記進行全基因組關聯分析(Genome-wide?Association?Study，GWAS)的檢測方法更加高效、快速、低成本。GWAS通過檢測豬全基因組中的單核苷酸多肽位點，利用全基因組關聯分析方法，挖掘與豬達115公斤體重日齡性狀相關的遺傳變異標記。最終，利用挖掘出的分子標記，進行分子標記輔助選擇和基因組選擇技術，提高豬的生長速度，提升豬生長性狀改良的遺傳進展。

發明內容

本發明的目的是提供一種與豬達115公斤體重日齡相關的SNP分子標記及應用，以解決上述問題。

根據本發明的第一個方面，提供了一種與豬達115公斤體重日齡相關的SNP分子標記，該SNP分子標記位于國際豬基因組Sscrofa11.1版本第1號染色體第160284793bp位點處的GA堿基突變。該分子標記與豬達115公斤體重日齡性狀顯著相關，通過使用該分子標記可以建立高效準確的分子標記輔助育種技術，將其應用于降低種豬達115公斤體重日齡的遺傳改良中，從而提高豬群體的生長性能，提高企業經濟利潤，增加核心競爭力。通過優選該SNP分子標記的優勢等位基因，能夠逐代增加優勢等位基因頻率，降低核心群種豬的達115公斤體重日齡，加快種豬相關生長性狀的改良進展從而有效提高種豬育種的經濟效益。

在某些實施方式中，該SNP分子標記上下游基因序列如SEQ?ID?NO：1所示，所述SNP分子標記位于該SEQ?ID?NO：1所示的第131位點的M表示的GA堿基突變。

根據本發明的第二個方面，提供了一種SNP分子標記在培育低達115公斤體重日齡豬品種上的應用。該分子標記為位于國際豬基因組Sscrofa11.1版本第1號染色體第160284793bp位點處的GA突變或位于如SEQ?ID?NO：1所示的第131位點的M表示的GA突變。通過對后備種豬的基因型進行篩選，并選留GG或AG的種豬個體進行擴繁，以逐代提高后代豬群體中等位基因G的頻率，從而培育出低達115公斤體重日齡的豬品種。由此，可以降低種豬達115公斤體重日齡，從而提高后代豬群體的生長性能，提高企業經濟利潤，增加核心競爭力。

在某些實施方式中，該應用包括如下步驟：

1)檢測后備種豬中第1號染色體第160284793bp位點處的GA突變或位于如SEQ?IDNO：1所示的第131位點的M表示的GA突變；

2)選留步驟1)中分子標記基因型為GG或AG的種豬個體，淘汰AA基因型個體；

3)以步驟2)中篩選出的個體作為種豬，進行繁育，在后代中繼續選留步驟1)中分子標記基因型為GG或AG的種豬個體，淘汰AA基因型個體；以逐代提高后代豬群體中等位基因G的頻率，從而培育出低達115公斤體重日齡的豬品種。