[發明專利]生信檢測任務分布式調度方法及裝置

在審

• 申請號: 202310096667.5
• 申請日: 2023-01-17
• 公開（公告）號: CN116010102A
• 公開（公告）日: 2023-04-25
• 發明（設計）人: 楊姣博;湛瑜;賀增泉;王今安;晉向前
• 申請（專利權）人: 深圳華大醫學檢驗實驗室
• 主分類號: G06F9/50
• 分類號: G06F9/50;G06F9/48
• 代理公司: 北京集佳知識產權代理有限公司 11227
• 代理人: 張茵

本申請公開了一種生信檢測任務分布式調度方法及裝置，該方法包括確定下機數據匹配的生信檢測任務；對生信檢測任務進行任務拆分，得到多個子任務；如此，本申請可以將復雜的生信檢測任務進行拆分，實現對生信檢測任務的簡化，使得生信檢測任務不再受限于高性能的服務器；獲取服務器注冊表；根據服務器注冊表，為每個子任務分配服務器，以完成生信檢測任務，可見，本申請可以將簡化的子任務分配至各個能夠完成子任務的服務器中，實現生信檢測任務的完成，能夠進一步利用服務器資源，避免資源的浪費。此外，利用各個服務器實現生信檢測任務的每個子任務，確保計算的準確性?？梢圆⑿刑幚矶鄠€生信檢測任務，加快處理速度。

技術領域

本申請涉及計算機技術領域，更具體地說，涉及一種生信檢測任務分布式調度方法及裝置。

背景技術

生信檢測任務主要是指利用生物檢測技術進行的生信分析流程，例如營養干預及用藥檢測、環境毒物檢測、蛋白質組學或代謝組學等。這些生物檢測任務需要使用專業的、專門的服務器進行運算處理。同時，生信檢測任務執行過程較為復雜，現有技術中是通過在本地配置高性能的服務器，或者在云端購買高性能的云服務器完成復雜的生信檢測任務。但在實際使用過程中，并不是每個任務都必須使用高性能的服務器，因而，這會造成大量的資源浪費以及內存空閑。

發明內容

有鑒于此，本申請提供了一種生信檢測任務分布式調度方法及裝置，用于降低資源浪費及內存的空閑成本。

為了實現上述目的，現提出的方案如下：

一種生信檢測任務分布式調度方法，包括：

確定下機數據匹配的生信檢測任務；

對所述生信檢測任務進行任務拆分，得到多個子任務；

獲取服務器注冊表；

根據所述服務器注冊表，為每個所述子任務分配服務器，以完成所述生信檢測任務。

可選的，所述確定下機數據匹配的生信檢測任務，包括：

獲取多個下機數據；

根據所述服務器注冊表中每個空閑狀態服務器的類型以及處理能力，確定各服務器類型間的處理能力比值；

根據所述處理能力比值，為各個服務器類型分配下機數據；

根據每個所述下機數據對應的服務器類型，確定所述下機數據對應的生信檢測任務。

可選的，所述根據每個所述下機數據對應的服務器類型，確定所述下機數據對應的生信檢測任務確定下機數據匹配的生信檢測任務，包括：

根據所述下機數據所包含的內容以及所述下機數據對應的服務器類型，確定與所述下機數據匹配的生信檢測任務，其中，下機數據所包含的內容包括物種信息、數據類型、測序深度、測序區域、測序方式、測序平臺、數據編號、基因數據名稱以及、接頭類型、參考序列、覆蓋度、讀長、測序類型、GC含量、序列編號以及序列版本號中的任意一種或任意多種。

可選的，所述生信檢測任務中包括多個處理環節；

對所述生信檢測任務進行任務拆分，得到多個子任務，包括：

確定所述生信檢測任務中每個所述處理環節所需的資源；

依據每個所述處理環節所需的資源以及每個處理環節之間的依賴性，對所述生信檢測任務進行任務拆分，得到多個子任務。

可選的，依據每個所述處理環節所需的資源以及每個處理環節之間的依賴性，對所述生信檢測任務進行任務拆分，得到多個子任務，包括：

依據每個所述處理環節所需的計算資源、線程數、內存占用量、存儲空間以及每個處理環節之間的依賴性，對所述生信檢測任務進行任務拆分，得到多個子任務。