[發明專利]與小麥抗條銹病基因QYr.sicau.-2BL連鎖的SNP分子標記及應用

有效

• 申請號: 202310069615.9
• 申請日: 2023-02-07
• 公開（公告）號: CN116200528B
• 公開（公告）日: 2023-09-29
• 發明（設計）人: 黃林;李雨琴;胡燕靈;馮麗華;劉登才;伍碧華;張連全;賀靖舒;張堇蕤
• 申請（專利權）人: 四川農業大學
• 主分類號: C12Q1/6895
• 分類號: C12Q1/6895;C12Q1/6858;C12N15/11;A01H1/04
• 代理公司: 北京盛詢知識產權代理有限公司 11901
• 代理人: 相凡

本發明公開了與小麥抗條銹病基因QYr.sicau.?2BL連鎖的SNP分子標記及應用，屬于分子育種技術領域。所述SNP分子標記利用如SEQ?ID?NO.1～3所示特異性引物組擴增得到；所述SNP分子標記與小麥抗條銹病QTL?QYr.sicau.?2BL共定位于小麥2B染色體長臂上，多態性為T/C。該分子標記能準確跟蹤所述小麥抗條銹病基因QYr.sicau?2BL，預測小麥的抗條銹病特性，進而方便進行分子設計育種。本發明還提供鑒定小麥抗條銹病的方法，能夠加強抗條銹病預測的準確性，便于快速篩選出抗條銹病的小麥品種或品系，大大加快小麥高產量品種的選育進程。

技術領域

本發明涉及分子育種技術領域，特別是涉及與小麥抗條銹病基因QYr.sicau.-2BL連鎖的SNP分子標記及應用。

背景技術

小麥是世界主要糧食作物，其安全生產對保障全球糧食安全具有重要意義。由條形柄銹菌小麥?；?Puccinia?striiformis?Westend.f.sp.tritici?Erikss.,Pst)引起的小麥條銹病是世界性重要病害。條銹病具有發生頻率高、流行范圍廣、危害程度大等特點。條銹菌為活體寄生菌，主要侵染小麥葉片，亦也可侵染莖稈、穗部、葉鞘和穎殼等部位，從小麥細胞吸收營養，破壞葉組織，降低光合作用，最終造成小麥減產甚至絕收。發掘抗病基因，培育抗條銹病品種是防治條銹病危害的最有效措施。

目前，從小麥及其近緣物種中報道了84個(Yr1-Yr84)正式命名和大批暫命名的抗條銹病基因。由于條銹菌致病性變異頻繁，新毒性生理小種的流行，導致生產上單一抗源為主的品種，在大面積推廣3-5年后便“喪失”對條銹病的抗性。小麥中報道的抗條銹病基因，大多數已喪失了對新毒性小種的抗性。因此，亟需發掘新型條銹病抗源以及開發育種選擇分子標記。

近年來，基于生物個體間基因組序列單堿基多態性(Single?nucleotidepolymorphism，SNP)標記被成功開發。SNP標記位點廣泛存在于基因組中，具有較高的穩定性，可以實現高通量檢測。以SNP為基礎的第三代KASP(Kompetitive?allele?specificPCR)分子標記基于引物末端堿基的特異匹配，對SNP分型以及檢測InDels，可以快速、經濟、高效、靈活地實現SNP分子標記檢測，在基因定位及分子標記輔助選擇育種等方面發揮了重要作用?；诖?，開發與抗條銹病位點緊密連鎖的高通量KASP分子標記，對于實現抗條銹病位點的快速檢測、自動化分子育種，加快抗條銹病小麥新品種的培育具有重要的價值和意義。

發明內容

本發明的目的是提供與小麥抗條銹病基因QYr.sicau.-2BL連鎖的SNP分子標記及應用，以解決上述現有技術存在的問題，該SNP分子標記與抗條銹病基因QYr.sicau.-2BL緊密連鎖，能夠準確鑒別出抗小麥條銹病植株，對于小麥種質資源改良、小麥抗條銹病材料創制或小麥分子輔助育種具有重要意義。

為實現上述目的，本發明提供了如下方案：

本發明提供與小麥抗條銹病基因QYr.sicau.-2BL連鎖的SNP分子標記，所述SNP分子標記利用如SEQ?ID?NO.1～3所示特異性引物組擴增得到。

優選的是，如SEQ?ID?NO：1-2所示的上游引物5’端分別修飾不同的熒光基團。

優選的是，所述SNP分子標記與小麥抗條銹病QTL?QYr.sicau.-2BL共定位于小麥2B染色體長臂上，多態性為T/C。

本發明還提供用于檢測所述的SNP分子標記的特異性引物組，所述特異性引物組的核苷酸序列如SEQ?ID?NO.1～3所示。

本發明還提供用于檢測所述的SNP分子標記的試劑盒，包含所述的特異性引物組。

本發明還提供一種鑒定小麥抗條銹病的方法，包括：

1)提取待測植株的基因組DNA；