[發(fā)明專利]淡水水體細菌膦酸酯代謝關鍵基因(phnJ)的檢測引物、試劑盒及定量方法在審
| 申請?zhí)枺?/td> | 202310037611.2 | 申請日: | 2023-01-09 |
| 公開(公告)號: | CN115927574A | 公開(公告)日: | 2023-04-07 |
| 發(fā)明(設計)人: | 趙亮;李春連;曾瑩;朱家輝;賈璞;束文圣 | 申請(專利權)人: | 華南師范大學 |
| 主分類號: | C12Q1/6876 | 分類號: | C12Q1/6876;C12Q1/6851;C12N15/11 |
| 代理公司: | 保定運維知識產(chǎn)權代理事務所(普通合伙) 13133 | 代理人: | 侯喬瀚 |
| 地址: | 510631 廣東*** | 國省代碼: | 廣東;44 |
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| 摘要: | |||
| 搜索關鍵詞: | 淡水 水體 細菌 膦酸酯 代謝 關鍵 基因 phnj 檢測 引物 試劑盒 定量 方法 | ||
1.一種淡水水體細菌膦酸酯代謝關鍵基因(phnJ)的檢測引物,其特征在于,所述的檢測引物如下所示:
上游引物1:5’-GACGAACAGACCAARCGCATGAT-3’;
上游引物2:5’-ATGCCSATGCCYTATGGSTGGGG-3’;
上游引物3:5’-CCCTATGGYTGGGGCAC-3’;
下游引物1:5’-GGTGACGGGTCTGGATCAC-3’;
下游引物2:5’-CGACCTTSACCGGRTAGGC-3’;
下游引物3:5’-GGATCGGCACCTGRTAGAC-3’。
2.一種淡水水體細菌膦酸酯代謝關鍵基因(phnJ)的檢測試劑盒,包括GreenProTaq?HS?Premix、陽性標準品和檢測引物,其特征在于,所述的陽性標準表為含有如SEQID?NO.7、SEQ?ID?NO.8與SEQ?ID?NO.9所示序列的重組質粒DNA序列,所述的檢測引物為權利要求1所述的檢測引物。
3.一種淡水水體細菌膦酸酯代謝關鍵基因(phnJ)的檢測方法,其特征在于,包括以下步驟:提取待測樣品的基因組DNA作為模板,根據(jù)實驗需求加入權利要求1所述的檢測引物,與Green?ProTaq?HS?Premix混合形成擴增反應體系,進行熒光定量PCR反應,反應結束后,根據(jù)擴增曲線判斷待測樣品中酸酯代謝關鍵基因(phnJ)的豐度。
4.根據(jù)權利要求3所述的檢測方法,其特征在于,所述的根據(jù)擴增曲線判斷待測樣品中酸酯代謝關鍵基因(phnJ)的豐度為:如果擴增曲線有典型熒光擴增曲線,且CT值小于30,則說明待測樣品中膦酸酯代謝關鍵基因(phnJ)的豐度不低于103,膦酸酯代謝關鍵基因(phnJ)的豐度低于103。
5.根據(jù)權利要求3所述的檢測方法,其特征在于,所述的擴增反應體系為:每20μL包括以下組分:權利要求1所述的5μM對應引物對各1μL、Green?ProTaq?HS?Premix?10μL、模板DNA?1μL、ROX染料0.08μM,并用超純水補至20μL;所述的熒光定量PCR反應,其反應條件為:95℃預變性60s;95℃變性15s,63℃退火30s,72℃延伸30s,收集熒光信號強度,重復40個循環(huán)。
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