[發明專利]一種致病基因CHD1突變位點的應用及檢測試劑

在審

• 申請號: 202211683413.5
• 申請日: 2022-12-27
• 公開（公告）號: CN116144753A
• 公開（公告）日: 2023-05-23
• 發明（設計）人: 曾橋;李嬋藝;陳涵;安燦榮;伊寧
• 申請（專利權）人: 湖南家輝生物技術有限公司
• 主分類號: C12Q1/6883
• 分類號: C12Q1/6883;C12Q1/6858;A61K45/00;A61P43/00;C12N15/11
• 代理公司: 北京高沃律師事務所 11569
• 代理人: 薛紅凡

本發明提供了一種致病基因CHD1突變位點c.5377TC的應用及診斷試劑，屬于基因診斷技術領域。本發明通過外顯子組測序技術首次發現了CHD1:NM_001364113.3:exon37:c.5377TC:p.W1793R位點突變導致Pilarowski?Bjornsson綜合征。本發明中檢測CHD1基因突變c.5377TC:p.W1793R的試劑用于篩查或診斷Pilarowski?Bjornsson綜合征致病，以指導患者治療和幫助優生優育，為Pilarowski?Bjornsson綜合征的發病機制研究提供了新的基礎和途徑。

技術領域

本發明屬于基因診斷技術領域，具體涉及一種致病基因CHD1突變位點的應用及檢測試劑。

背景技術

Pilarowski-Bjornsson綜合征(MIM617682)是一種常染色體顯性遺傳疾病，Pilarowski-Bjornsson綜合征的主要臨床特征為發育遲緩、智力障礙，常伴有自閉癥特征、言語失用和輕度畸形特征，有些病人可能會有癲癇發作，表型多變。

CHD1基因(MIM602118)基因突變是導致Pilarowski-Bjornsson綜合征(MIM617682)的原因，CHD1基因定位于染色體5q15-q21.1，包括37個外顯子和36個內含子，基因長75.0kb，編1798個氨基酸序列的蛋白色素域解旋酶DNA結合蛋白1chromodomainhelicaseDNAbindingprotein1。人類CHD蛋白家族屬于SWI2/SNF2相關的ATP酶超家族，該家族因蛋白質從氨基酸開始依次含有染色質調節域(Chromdomains)、類SWI2/SNF2ATP酶/解旋酶域(SWI2/SNF2-likeATPase/Helicase)和DNA結合域(DNA-bindingdomain)而得名。DNA結合域最為保守，該域位于CHD蛋白的C末端，可以選擇性地與富含AT的雙鏈DNA結合，參與染色質凝集、染色質修飾和基因的表達調控，包括參與染色質的重塑與凝集，重塑復合物的翻譯后修飾，參與基因的轉錄調控，參與細胞的發育和分化等。到目前為止，已經發現6個人類CHD蛋白家族成員，包括CHD1、CHD2、CHD3、CHD4、CHD5和CHD6。根據編碼蛋白序列的保守性，該家族被劃分為三個亞族：CHD1和CHD2組成了Ⅰ亞族，CHD3、CHD4和CHD5為Ⅱ亞族，CHD6為Ⅲ亞族。其中CHD1基因僅在腦和神經組織中表達，在神經發育過程中發揮重要作用。CHD1基因突變時導致蛋白功能異常，進而導致相應的神經系統表型。

因此，基因突變是導致疾病發生發展的重要遺傳基礎，基因診斷是確診Pilarowski-Bjornsson綜合征的重要遺傳學標準。臨床上需要針對不同突變建立相應的檢測技術并用于明確病因和疾病診斷。現有技術中對基因突變位點的基因型進行檢測，可以采用其他方法限制性酶切片段長度多態性、單鏈構象多態性、等位基因特異的寡聚核苷酸雜交等等，但這些檢測方法均不能同時滿足定性、定量及明確突變基因的序列的目的，所以需要針對特異突變位點的特異性擴增引物。

發明內容

有鑒于此，本發明的目的在于提供一種致病基因CHD1突變位點的應用，不僅能豐富基因診斷Pilarowski-Bjornsson綜合征的突變位點，還能作為靶點為藥物篩選、藥效評價及靶向治療提供基礎。

本發明的目的還在于提供一種檢測導致Pilarowski-Bjornsson綜合征的致病基因CHD1突變位點的試劑，助力Pilarowski-Bjornsson綜合征基因突變的篩查和診斷。

本發明提供了一種基因CHD1突變位點在制備防治Pilarowski-Bjornsson綜合征診斷試劑或制備防治Pilarowski-Bjornsson綜合征的藥物中的應用，所述基因CHD1突變位點為CHD1:NM_001364113.3:exon37:c.5377TC:p.W1793R。

本發明提供了一種用于檢測導致Pilarowski-Bjornsson綜合征的致病基因CHD1突變位點的試劑，包括檢測致病基因CHD1突變位點c.5377TC:p.W1793R的引物；