[發明專利]一種用于鑒別甲狀腺腫瘤良惡性的甲基化分子標志物

在審

• 申請號: 202211580424.0
• 申請日: 2022-12-09
• 公開（公告）號: CN115772571A
• 公開（公告）日: 2023-03-10
• 發明（設計）人: 張箏;張晶
• 申請（專利權）人: 南京騰辰生物科技有限公司
• 主分類號: C12Q1/6886
• 分類號: C12Q1/6886;G16H50/20;G16H50/70;G16H10/60;G16B30/10;G16B20/50;G16B25/20
• 代理公司: 北京紀凱知識產權代理有限公司 11245
• 代理人: 張立娜

1.一種甲基化生物標志物，其特征在于：所述甲基化生物標志物的核苷酸序列為CUX2基因中如下(A1)-(A4)所示片段中的全部或部分CpG位點的甲基化水平：

(A1)SEQ ID No.1所示的DNA片段或與其具有80％以上同一性的DNA片段；

(A2)SEQ ID No.2所示的DNA片段或與其具有80％以上同一性的DNA片段；

(A3)SEQ ID No.3所示的DNA片段或與其具有80％以上同一性的DNA片段；

(A4)SEQ ID No.4所示的DNA片段或與其具有80％以上同一性的DNA片段；

所述甲基化生物標志物包括位于其核苷酸序列上的如下(B1)-(B7)中任一所示CpG位點：

(B1)CUX2基因中SEQ ID No.1、SEQ ID No.2、SEQ ID No.3和SEQ ID No.4所示4個DNA片段中的任意一個或多個CpG位點；

(B2)CUX2基因中SEQ ID No.2所示的DNA片段上的所有CpG位點和SEQ ID No.1所示的DNA片段上的所有CpG位點；

(B3)CUX2基因中SEQ ID No.2所示的DNA片段上的所有CpG位點和SEQ ID No.3所示的DNA片段上的所有CpG位點；

(B4)CUX2基因中SEQ ID No.1所示的DNA片段上的所有CpG位點和SEQ ID No.3所示的DNA片段上的所有CpG位點；

(B5)CUX2基因中SEQ ID No.2所示的DNA片段上的所有CpG位點、SEQ ID No.1所示的DNA片段上的所有CpG位點和SEQ ID No.3所示的DNA片段上的所有CpG位點；

(B6)CUX2基因中SEQ ID No.2所示的DNA片段中的全部CpG位點或任意23個或任意22個或任意21個或任意20個或任意19個或任意18個或任意17個或任意16個或任意15個或任意14個或任意13個或任意12個或任意11個或任意10個或任意9個或任意8個或任意7個或任意6個或任意5個或任意4個或任意3個或任意2個或任意1個CpG位點；

(B7)CUX2基因中SEQ ID No.2所示的DNA片段上如下9項所示CpG位點的全部或任意8項或任意7項或任意6項或任意5項或任意4項或任意3項或任意2項或任意1項：

第1項：SEQ ID No.2所示的DNA片段自5’端第261-262位所示CpG位點；

第2項：SEQ ID No.2所示的DNA片段自5’端第330-331位所示CpG位點；

第3項：SEQ ID No.2所示的DNA片段自5’端第355-356位所示CpG位點；

第4項：SEQ ID No.2所示的DNA片段自5’端第369-370位和第371-372位和第374-375位和第380-381位和第382-383位所示CpG位點；

第5項：SEQ ID No.2所示的DNA片段自5’端第392-393位所示CpG位點；

第6項：SEQ ID No.2所示的DNA片段自5’端第453-454位所示CpG位點；

第7項：SEQ ID No.2所示的DNA片段自5’端第475-476位和第478-479位所示CpG位點；

第8項：SEQ ID No.2所示的DNA片段自5’端第484-485位所示CpG位點；

第9項：SEQ ID No.2所示的DNA片段自5’端第624-625位所示CpG位點；

所述甲基化生物標志物的用途為如下中的至少一種：

(1)區分或輔助區分甲狀腺良性腫瘤和甲狀腺惡性腫瘤；

(2)區分或輔助區分甲狀腺良性腫瘤和不同亞型的甲狀腺惡性腫瘤；

(3)區分或輔助區分甲狀腺良性腫瘤和不同分期的甲狀腺惡性腫瘤；

(4)區分或輔助區分甲狀腺惡性腫瘤不同亞型；

(5)區分或輔助區分甲狀腺惡性腫瘤不同分期。