[發(fā)明專利]免疫組織化學(xué)染色影像的分析方法在審
| 申請?zhí)枺?/td> | 202211568161.1 | 申請日: | 2022-12-07 |
| 公開(公告)號: | CN116503311A | 公開(公告)日: | 2023-07-28 |
| 發(fā)明(設(shè)計(jì))人: | 詹寶珠;蔡弘文;廖紹凱;鄭國順 | 申請(專利權(quán))人: | 詹寶珠 |
| 主分類號: | G06T7/00 | 分類號: | G06T7/00;G06T7/90;G06T7/155;G06N3/0464 |
| 代理公司: | 北京律誠同業(yè)知識產(chǎn)權(quán)代理有限公司 11006 | 代理人: | 徐金國 |
| 地址: | 中國臺灣臺南市大*** | 國省代碼: | 暫無信息 |
| 權(quán)利要求書: | 查看更多 | 說明書: | 查看更多 |
| 摘要: | |||
| 搜索關(guān)鍵詞: | 免疫 組織化學(xué) 染色 影像 分析 方法 | ||
本發(fā)明提出一種免疫組織化學(xué)染色影像的分析方法,包括:根據(jù)機(jī)器學(xué)習(xí)模型切割出免疫組織化學(xué)染色影像的多個(gè)細(xì)胞核;移除免疫組織化學(xué)染色影像中屬于細(xì)胞核的像素以及移除符合一顏色范圍的像素以取得多個(gè)細(xì)胞質(zhì)像素;根據(jù)細(xì)胞質(zhì)像素的位置將細(xì)胞質(zhì)像素分配至細(xì)胞核以形成多個(gè)細(xì)胞;以及計(jì)算細(xì)胞中每個(gè)像素的像素染色分?jǐn)?shù),借此計(jì)算細(xì)胞的細(xì)胞染色分?jǐn)?shù)。如此可以客觀且自動化的計(jì)算出細(xì)胞被染色的分?jǐn)?shù)。
技術(shù)領(lǐng)域
本發(fā)明是有關(guān)于免疫組織化學(xué)染色影像的分析方法,可以利用算法客觀的評估每個(gè)細(xì)胞被染色的程度。
背景技術(shù)
免疫組織化學(xué)染色(immunohistochemistry,IHC)是一種廣泛使用的方法,用以標(biāo)記特定的有機(jī)物質(zhì)。原理在于使用特定比例的抗原及抗體,可以讓特定的抗原物質(zhì)在切片的數(shù)字影像(whole?slide?image,WSI)中顯示出來。免疫組織化學(xué)染色常用于醫(yī)學(xué)研究,用以評估被染色細(xì)胞的病理參數(shù),觀察與癌癥等疾病之間的關(guān)系。然而,傳統(tǒng)的分析方法仰賴醫(yī)生的主觀判斷,如何提出客觀的分析方法為此領(lǐng)域技術(shù)人員所關(guān)心的議題。
發(fā)明內(nèi)容
本發(fā)明提出一種免疫組織化學(xué)染色影像的分析方法,適用于計(jì)算機(jī)系統(tǒng),此分析方法包括:根據(jù)機(jī)器學(xué)習(xí)模型切割出免疫組織化學(xué)染色影像的多個(gè)細(xì)胞核,其中免疫組織化學(xué)染色影像包括多個(gè)像素,像素包括多個(gè)顏色通道;移除免疫組織化學(xué)染色影像中屬于細(xì)胞核的像素以及移除符合一顏色范圍的像素以取得多個(gè)細(xì)胞質(zhì)像素;根據(jù)細(xì)胞質(zhì)像素的位置將細(xì)胞質(zhì)像素分配至細(xì)胞核的其中之一以形成多個(gè)細(xì)胞;以及計(jì)算細(xì)胞中的像素的像素染色分?jǐn)?shù),借此計(jì)算細(xì)胞的細(xì)胞染色分?jǐn)?shù)。
在一些實(shí)施例中,移除符合顏色范圍的像素的步驟包括:將像素轉(zhuǎn)換至色彩空間,色彩空間包含一色相、一飽和度與一明度;以及保留色相在一第一預(yù)設(shè)范圍內(nèi)以及飽和度在一第二預(yù)設(shè)范圍內(nèi)的像素,并且移除明度大于一第一臨界值的像素。
在一些實(shí)施例中,根據(jù)細(xì)胞質(zhì)像素的位置將細(xì)胞質(zhì)像素分配至細(xì)胞核以形成細(xì)胞的步驟包括:將細(xì)胞核當(dāng)作多個(gè)區(qū)域低點(diǎn),將細(xì)胞質(zhì)像素當(dāng)作集水區(qū),借此執(zhí)行分水嶺算法。
在一些實(shí)施例中,在形成細(xì)胞之后,分析方法還包括:計(jì)算細(xì)胞中的像素個(gè)數(shù);以及如果細(xì)胞中的第一細(xì)胞的像素個(gè)數(shù)大于第二臨界值且小于一第三臨界值,刪除第一細(xì)胞中的細(xì)胞質(zhì)像素,并且加入根據(jù)第一細(xì)胞中的細(xì)胞核執(zhí)行形態(tài)學(xué)擴(kuò)張?zhí)幚砗蟮慕Y(jié)果來形成第一細(xì)胞。
在一些實(shí)施例中,計(jì)算細(xì)胞中的像素的像素染色分?jǐn)?shù),借此計(jì)算細(xì)胞的細(xì)胞染色分?jǐn)?shù)的步驟包括:根據(jù)細(xì)胞中的像素的飽和度與明度之間的比值來計(jì)算像素的像素染色分?jǐn)?shù);以及以個(gè)數(shù)作為權(quán)重,計(jì)算細(xì)胞中的像素的像素染色分?jǐn)?shù)的權(quán)重平均以作為細(xì)胞的細(xì)胞染色分?jǐn)?shù)。
為讓本發(fā)明的上述特征和優(yōu)點(diǎn)能更明顯易懂,下文特舉實(shí)施例,并配合附圖作詳細(xì)說明如下。
附圖說明
圖1是根據(jù)一實(shí)施例繪示免疫組織化學(xué)染色影像的分析方法的流程圖。
圖2是根據(jù)一實(shí)施例繪示取得細(xì)胞質(zhì)像素的示意圖。
圖3是根據(jù)一實(shí)施例繪示分水嶺算法的結(jié)果示意圖。
圖4是根據(jù)一實(shí)施例繪示根據(jù)HSV色彩空間來計(jì)算像素染色分?jǐn)?shù)的示意圖。
其中,附圖標(biāo)記:
101、102、201、301:免疫組織化學(xué)染色影像
111~114、211~212:步驟
121~123、202、203、302、303:圖
410:范圍
具體實(shí)施方式
關(guān)于本發(fā)明中所使用的「第一」、「第二」等,并非特別指次序或順位的意思,其僅為了區(qū)別以相同技術(shù)用語描述的元件或操作。
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