[發明專利]一種與豬背膘厚相關的SNP標記引物對及其應用

在審

• 申請號: 202211516019.2
• 申請日: 2022-11-29
• 公開（公告）號: CN116042608A
• 公開（公告）日: 2023-05-02
• 發明（設計）人: 黃瑞華;許會英;李平華;侯黎明;周五朵;謝文周;路發明
• 申請（專利權）人: 南京農業大學
• 主分類號: C12N15/11
• 分類號: C12N15/11;C12Q1/6888
• 代理公司: 南京天華專利代理有限責任公司 32218
• 代理人: 傅婷婷;徐冬濤

本發明涉及一種與豬背膘厚性狀相關的SNP標記引物對及其應用。所述SNP標記的位點為國際豬基因組11.1版本參考序列豬4號染色體rs80880668核苷酸位點的分子標記，且具有A/G多態性，所述SNP標記與蘇淮豬背膘厚極顯著相關(P0.001)。一種用于檢測所述的SNP標記的引物對，上游引物為：SEQ?ID?NO：2，下游引物為：SEQ?ID?NO：3。本發明提供的SNP標記與蘇淮豬背膘厚極顯著相關，通過鑒定該SNP標記的基因型來篩選具有較薄背膘的蘇淮豬品系，該品系的建立能夠降低蘇淮豬的背膘厚度，并且產生更多的社會和經濟效益。

技術領域

本發明屬于分子生物學技術領域，涉及一種與豬背膘厚相關的SNP標記引物對及其應用。

背景技術

背膘厚是具有重要經濟價值的數量性狀。同時，豬背膘厚與諸多性狀(如胴體性狀、肉質性狀、繁殖性狀)存在相關，與瘦肉率之間呈很強的負相關。由于瘦肉率的測定非常繁瑣，在豬的生產和選育中，用容易測量的背膘厚作為瘦肉率的評定指標具有重要意義。當前，瘦肉型商業豬種在豬肉消費市場上占有很大的市場份額，但如今人們對豬肉品質的要求也越來越高，現在的商業品種不能完全滿足消費者對肉質的需求，部分高端消費者更傾向于購買地方豬肉、含有地方豬血緣的雜交豬肉等優質豬肉作為食材，但這類豬肉往往具有較厚的背膘，難以被廣大消費者接受，如何降低地方豬背膘也是育種者關心的主題。

本發明是基于蘇淮豬胴體性狀研究所獲得的技術，蘇淮豬是由淮安市淮陰種豬場、南京農業大學、江蘇省畜牧總站和淮安市農業委員會等單位于1998年開始培育，2011年3月25日通過國家畜禽遺傳資源委員會品種審定的新品種。蘇淮豬是在新淮豬基礎上再導入大白豬血統，通過橫交、多世代選育而成，含新淮豬血統50％，大白豬血統50％。蘇淮豬被毛黑色(極少數有白蹄)，頭中等大，額寬，耳大，略向前傾，面微凹，背腰平直而長，腹部下垂，后軀發育良好，四肢結實，蘇淮豬肉質鮮美可口，深受廣大消費者的青睞，但是豬群背膘厚度總體還是偏高，需要進一步選育降低。

背膘厚是一種典型的數量性狀，具有中等到高等的遺傳力(0.12～0.74)，利用全基因組關聯分析(Genome-Wide?Association?Study,GWAS)的方法能定位與背膘厚相關的數量性狀基因座(Quantitative?Trait?Locus,QTL)和候選基因，目前已經利用該方法在國內外眾多豬種上鑒別到與背膘厚相關的QTL，但是大部分QTL的研究主要集中在西方商業豬種，如杜洛克、長白、大白及其雜交的資源群體中，對于中國培育品種如蘇淮豬的研究還很少。因此，以蘇淮豬為試驗動物，鑒定與豬背膘厚度相關的SNPs標記，利用標記輔助選擇技術對豬背膘厚性狀進行遺傳改良具有重要意義。

發明內容

本發明的目的在于針對傳統豬背膘厚選育耗時費力，選育效果慢的問題，提供與豬背膘厚相關的SNP標記開發而成的選育分子標記。

本發明的另一個目的在于提供用于檢測上述SNP標記的引物對和檢測方法。

本發明的另一個目的在于提供上述SNP標記、分子標記、引物的用途。

本發明的目的可通過以下技術方案實現：

一種與豬背膘厚相關的分子標記，所述的分子標記序列如SEQ?ID?NO：1所示，其中含有一個與豬背膘厚相關的SNP標記位點，該位點為國際豬基因組11.1版本參考序列豬4號染色體rs80880668核苷酸位點，在SEQ?ID?NO：1中所述的SNP標記位點位于第94位，存在A/G多態性。

一種用于檢測與豬背膘厚相關的SNP標記的引物對，上游引物為：SEQ?ID?NO：2，下游引物為：SEQ?ID?NO：3；所述SNP標記的位點為國際豬基因組11.1版本參考序列豬4號染色體rs80880668核苷酸位點的分子標記，且具有A/G多態性，所述SNP標記與蘇淮豬背膘厚極顯著相關(P0.001)。