[發(fā)明專利]一種SSR分子標(biāo)記組合及其在檢測薄殼山核桃品種中的應(yīng)用

在審

• 申請?zhí)枺?/td>: 202211350708.0
• 申請日: 2022-10-31
• 公開（公告）號(hào): CN116287370A
• 公開（公告）日: 2023-06-23
• 發(fā)明（設(shè)計(jì)）人: 常君;張成才;姚小華;王開良;陸鑄疇;解懿妮
• 申請（專利權(quán)）人: 中國林業(yè)科學(xué)研究院亞熱帶林業(yè)研究所
• 主分類號(hào): C12Q1/6895
• 分類號(hào): C12Q1/6895;C12Q1/6858;C12N15/11
• 代理公司: 北京路浩知識(shí)產(chǎn)權(quán)代理有限公司 11002
• 代理人: 李正

本發(fā)明涉及分子標(biāo)記技術(shù)領(lǐng)域，尤其涉及一種SSR分子標(biāo)記組合及其在檢測薄殼山核桃品種中的應(yīng)用。所述SSR分子標(biāo)記組合包括：SSR12?1和SSR6?2；所述SSR12?1位于Chr12:22685469bp?22685482bp，重復(fù)序列為CT，重復(fù)7次；所述SSR6?2位于Chr06:7785735bp?7785761bp，重復(fù)序列為CTT，重復(fù)9次。本發(fā)明提供的分子標(biāo)記可以準(zhǔn)確、快速地鑒別薄殼山核桃品種，結(jié)果穩(wěn)定可靠，對于薄殼山核桃遺傳資源的鑒定有重要意義。

技術(shù)領(lǐng)域

本發(fā)明涉及分子標(biāo)記技術(shù)領(lǐng)域，尤其涉及一種SSR分子標(biāo)記組合及其在檢測薄殼山核桃品種中的應(yīng)用。

背景技術(shù)

薄殼山核桃(學(xué)名：Carya?illinoinensis(Wangenh.)K.Koch)又名美國山核桃，屬胡桃科山核桃屬的一種植物，為多年生高大落葉喬木。作為世界著名的高檔干果、油料樹種和材果兼用優(yōu)良樹種，具有較高的應(yīng)用價(jià)值。薄殼山核桃良種的選育多依賴于種子繁殖，而由于林木世代周期長，后代變異系數(shù)大的特點(diǎn)，因此多以引進(jìn)的品種為主。而由于引種歷史較長，并且早期的引種多為種條，單從形態(tài)上難以區(qū)分，難免造成品種間相互混雜，造成同名異物或者同物異名的現(xiàn)象。這對于薄殼山核桃種質(zhì)評(píng)價(jià)，遺傳改良及面上推廣工作帶來極大的不便。

薄殼山核桃品種卡多(Caddo)為雄先型品種。卡多堅(jiān)果平均重5.4g，具有長勢好，結(jié)實(shí)率高，豐產(chǎn)穩(wěn)產(chǎn)，抗病力強(qiáng)和適應(yīng)性強(qiáng)等特點(diǎn)。薄殼山核桃苗期較長，需要4-6年，且雌雄異花，雌雄花期不遇，往往需要不同品種之間合理搭配來實(shí)現(xiàn)充分授粉和穩(wěn)產(chǎn)，因此早期建園的品種鑒定尤為重要。在生產(chǎn)實(shí)踐中，同一品種在不同發(fā)育時(shí)期，不同地域條件，栽培條件下的表型性狀差異較大，因此依賴經(jīng)驗(yàn)性的品種鑒定往往會(huì)造成偏差。

發(fā)明內(nèi)容

為了解決現(xiàn)有技術(shù)存在的問題，本發(fā)明提供一種SSR分子標(biāo)記組合及其在檢測薄殼山核桃品種中的應(yīng)用。

第一方面，本發(fā)明提供一種SSR分子標(biāo)記組合，包括：SSR12-1和SSR6-2；所述SSR12-1位于Chr12:22685469bp-22685482bp，重復(fù)序列為CT，重復(fù)7次；所述SSR6-2位于Chr06:7785735bp-7785761bp，重復(fù)序列為CTT，重復(fù)9次。

進(jìn)一步地，所述SSR分子標(biāo)記組合的基因組版本為Cillinoinensis_573_v1.1。

第二方面，本發(fā)明提供一種用于檢測所述SSR分子標(biāo)記組合的引物對，包括：Chr12-SSR1，Chr6-SSR2；

所述Chr12-SSR1包括：

上游引物：5′-CCCCACTCCCCCAGATTTTC-3′，

下游引物：5′-AGGAGCTCAACATGAGTGCC-3′；

所述Chr6-SSR2包括：

上游引物：5′-CAACAAGCAACACCCTCAGC-3′，

下游引物：5′-AAGGAAAGCGGCATCGAGAA-3′。

本發(fā)明進(jìn)一步提供包括所述引物對的試劑盒。

第三方面，本發(fā)明提供一種檢測薄殼山核桃品種的方法，包括：

提取待測薄殼山核桃的基因組DNA；采用所述引物對對所述基因組DNA進(jìn)行PCR擴(kuò)增；根據(jù)PCR擴(kuò)增結(jié)果判斷所述待測薄殼山核桃的品種。

進(jìn)一步地，所述根據(jù)PCR擴(kuò)增結(jié)果判斷所述待測薄殼山核桃的品種包括：

若兩對引物對均擴(kuò)增出兩條帶，則可以判斷所述測薄殼山核桃為Caddo品種。

進(jìn)一步地，所述若兩對引物對均擴(kuò)增出兩條帶包括：