[發明專利]一種基于糞便菌群檢測在評估素食孕婦營養代謝水平中的應用在審
| 申請號: | 202211314462.1 | 申請日: | 2022-10-21 |
| 公開(公告)號: | CN115537458A | 公開(公告)日: | 2022-12-30 |
| 發明(設計)人: | 王科;黃偉斌 | 申請(專利權)人: | 廣州保量醫療科技有限公司 |
| 主分類號: | C12Q1/6869 | 分類號: | C12Q1/6869;C12Q1/689;G16H20/60;C12R1/01;C12R1/145 |
| 代理公司: | 廣州三環專利商標代理有限公司 44202 | 代理人: | 余璟儀 |
| 地址: | 510030 廣東省廣*** | 國省代碼: | 廣東;44 |
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| 摘要: | |||
| 搜索關鍵詞: | 一種 基于 糞便 檢測 評估 素食 孕婦 營養 代謝 水平 中的 應用 | ||
1.一種基于糞便菌群檢測在評估素食孕婦營養代謝水平中的應用,其特征在于,所述糞便菌群檢測包括檢測與素食孕婦營養狀態相關糞便菌群的相對豐度;所述糞便菌群包括:Collinsella、Holdemania、Unclassified S247、Eubacterium、Roseburia、Unclassified Lachnospiraceae、Clostridium和Acidaminococcus。
2.一種基于糞便菌群豐度評估素食飲食孕婦營養代謝水平的模型,其特征在于,所述模型由與素食孕婦營養狀態相關的糞便菌群的相對豐度構建得到,所述糞便菌群包括:Collinsella、Holdemania、Unclassified S247、Eubacterium、Roseburia、UnclassifiedLachnospiraceae、Clostridium和Acidaminococcus。
3.如權利要求2所述基于糞便菌群豐度評估素食飲食孕婦營養代謝水平的模型,其特征在于,所述模型得分公式如下:
模型得分=3.3082-17.0407×Collinsella相對豐度值-47.7252×Holdemania相對豐度值-64042.2145×Unclassified S247相對豐度值-294.1574×Eubacterium相對豐度值-35.7225×Roseburia相對豐度值-4042.2451×Unclassified Lachnospiraceae相對豐度值-82.1704×Clostridium相對豐度值-94.5717×Acidaminococcus相對豐度值。
4.如權利要求3所述基于糞便菌群豐度評估素食飲食孕婦營養代謝水平的模型,其特征在于,模型得分高于0.759或者低于0.532,則提示素食孕婦營養水平有待調節。
5.如權利要求2~4任一項所述基于糞便菌群豐度評估素食飲食孕婦營養代謝水平的模型的構建方法,其特征在于,包括如下步驟:
采集素食孕婦和雜食孕婦的糞便樣本,并對其營養代謝水平進行綜合評分;
構建孕婦糞便菌群的基因文庫,并經測序獲取糞便菌群OTU聚類和物種注釋,得到糞便菌群的相對豐度;
通過對比雜食孕婦與素食孕婦糞便菌群的相對豐度以及營養代謝水平的綜合評分,篩選出與素食孕婦營養代謝水平相關聯的糞便菌群;
基于篩選出的與素食孕婦營養代謝水平相關聯的糞便菌群,構建用于評估素食飲食孕婦營養代謝水平的模型。
6.如權利要求5所述構建方法,其特征在于,通過對比雜食孕婦與素食孕婦糞便菌群豐度以及營養代謝水平綜合評分,篩選出與素食孕婦營養代謝水平相關聯的糞便菌群的步驟如下:
通過隨機森林算法分別將雜食孕婦和素食孕婦兩組人群的糞便菌群的相對豐度與相應的營養代謝水平綜合評分進行回歸,并根據各個菌屬對模型預測準確性的相對貢獻進行重要性排名,利用十折交叉驗證法評估模型中菌屬數量與模型誤差的關系,并按重要性排名對菌屬進行選擇,從而篩選出與素食孕婦營養代謝水平相關聯的糞便菌群。
7.如權利要求6所述構建方法,其特征在于,所述篩選出的與素食孕婦營養代謝水平相關聯的腸道菌群包括Collinsella、Holdemania、Unclassified S247、Eubacterium、Roseburia、Unclassified Lachnospiraceae、Clostridium和Acidaminococcus。
8.如權利要求2~4任一項所述基于糞便菌群豐度評估素食飲食孕婦營養代謝水平的模型在制備素食孕婦營養狀態評估試劑盒中的應用。
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