[發明專利]一種三重DARQ-LAMP等溫擴增技術同時檢測對蝦病原體的方法在審
| 申請號: | 202211281262.0 | 申請日: | 2022-10-19 |
| 公開(公告)號: | CN115595380A | 公開(公告)日: | 2023-01-13 |
| 發明(設計)人: | 張明洲;付賢樹;王倩;馬骉;孫凱 | 申請(專利權)人: | 中國計量大學 |
| 主分類號: | C12Q1/6895 | 分類號: | C12Q1/6895;C12Q1/70;C12Q1/6844;C12R1/645 |
| 代理公司: | 杭州橙知果專利代理事務所(特殊普通合伙) 33261 | 代理人: | 范琪美 |
| 地址: | 310000 浙江省*** | 國省代碼: | 浙江;33 |
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| 摘要: | |||
| 搜索關鍵詞: | 一種 三重 darq lamp 等溫 擴增 技術 同時 檢測 對蝦 病原體 方法 | ||
1.一種三重DARQ-LAMP等溫擴增技術同時檢測對蝦病原體的方法,其特征在于:包括以下步驟:
S1、用消毒過的鑷子從被感染對蝦中取出肝胰臟組織;然后在研磨器中研磨均勻,操作置于冰上進行,待組織磨成勻漿后,即可放入冰箱中保存;
S2、使用商業試劑盒從50mg受感染的蝦肝胰腺中提取總DNA;通過在紫外分光光度計上測量A260/A280的比例來確定提取的DNA的數量和質量;
S3、qPCR引物探針設計:與LAMP靶標基因相同,使用Primer premier軟件設計引物和Taqman探針,探針標記FAM熒光基團;進行制備;
S4、優化三重DARQ-LAMP,使用三種熒光標記的探針和不同的探針濃度;
S5、通過S2中制備的10倍濃度梯度的對蝦白斑綜合征病毒、傳染性皮下和造血細胞壞死病毒、蝦肝腸孢蟲的基因組DNA進行靈敏度實驗。每個濃度梯度取2.5μL當做模板加入到反應當中進行三重DARQ-LAMP反應;
S6、通過使用基因組DNA試劑盒來提取實驗病毒與菌株的基因組DNA;使用提取的DNA用于上述優化好的三重DARQ-LAMP方法進行特異性實驗;通過特異性分析評估DARQ-LAMP方法學的準確性;
其中,S3中DARQ-LAMP探針合成制備過程如下:
a、首先WSSV-FIP(BHQ1)與WSSV-FD(FAM)干粉放入離心機中,離心。
b、用TE緩沖液將FIP和FD溶解,用微量移液槍混勻;
c、將用微量移液槍混勻后的混合物放入金屬恒溫水浴鍋中98℃,10分鐘;
d、通過風冷裝置(2)將冷卻腔(11)內的冷卻液從進水管(10)吸入換液腔(12)內;在換液腔(12)內對冷卻液進行冷卻;再由出水管(13)進入冷卻腔(1)內;在冷卻的時候使冷卻液開始流動;所述風冷裝置(2)包括設于換液腔(12)內的第一偏心環(20)、設于所述第一偏心環(20)上的多個移動槽(21)、設于所述移動槽(21)上的移動板(22)、設于所述移動板(22)上的偏心板(23)、設于所述第一偏心環(20)上的風冷腔(24)、設于所述移動槽(21)內壁上的第一單向閥(25)、設于所述冷卻腔(24)內壁上的第二單向閥(26);驅動第一偏心環(20)開始在換液腔(12)內偏心旋轉;此時偏心板(23)會沿換液腔(12)內壁旋轉移動;將冷卻液從進水管(10)吸入到換液腔(12)內;同時偏心板(23)會抵壓移動板(22)在移動槽(21)內移動;此時將外界的空氣吸入風冷腔(24)內,對換液腔(12)內的冷卻液進行風冷;經過冷卻的冷卻液由出水管(13)再次進入冷卻腔(11)內;冷卻液驅動冷卻環(14)旋轉,然后冷卻環(14)開始驅動冷卻裝置(4)啟動,將主體(1)內的水吸入冷卻盤(15)內,通過冷卻裝置(4)對水進行冷卻,再排出;所述冷卻裝置(4)包括設于所述冷卻腔(11)內壁上的旋轉輥(40)、設于所述旋轉輥(40)上的偏心塊(41)、設于所述偏心塊(41)上的第二偏心環(42)、設于所述冷卻盤(15)側壁上的兩個開口(43)、設于所述第二偏心環(42)上的進水板(44)、設于所述第二偏心環(41)內的水冷腔(45)、設于所述冷卻盤(15)上的聯通管(46)、設于所述第二偏心環(42)內的水冷腔(47);冷卻環(14)旋轉的時候帶動旋轉輥(40)旋轉,然后偏心塊(41)開始偏心旋轉;帶動第二偏心環(42)在冷卻盤(15)內沿內壁偏心旋轉移動;此時將主體(1)內的水通過其中一個開口(43)吸入冷卻盤(15)內;進一步的第二偏心環(42)的移動會帶動進水板(44)上下移動,將冷卻腔(11)內的冷卻液吸入水冷腔(47)內;此時冷卻液對冷卻盤(15)內的水進行冷卻,然后經過冷卻的水再由另一個開口(43)排到主體(1)內;直到水降溫至室溫,拿出混合物;
e、放置4℃冰箱保存代用。
2.根據權利要求1所述的一種三重DARQ-LAMP等溫擴增技術同時檢測對蝦病原體的方法,其特征在于:所述S4中所使用的熒光標記是FAM,Cy5和VIC,可以在ABI7500PlusTM儀器中同時進行監測;探針的不同濃度為0.2μM,0.4μM,0.8μM,1.2μM。
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