[發明專利]一種鑒定或輔助鑒定豬眼肌面積的方法及應用

在審

• 申請號: 202211278725.8
• 申請日: 2022-10-19
• 公開（公告）號: CN116103408A
• 公開（公告）日: 2023-05-12
• 發明（設計）人: 唐中林;盧丹;易國強;楊亞嵐;王斌虎
• 申請（專利權）人: 佛山鯤鵬現代農業研究院;中國農業科學院農業基因組研究所
• 主分類號: C12Q1/6888
• 分類號: C12Q1/6888
• 代理公司: 北京紀凱知識產權代理有限公司 11245
• 代理人: 王灝增

本發明屬于包含核酸的檢測方法領域，涉及一種鑒定或輔助鑒定豬眼肌面積的方法及應用。所述鑒定或輔助鑒定豬眼肌面積的方法，包括：檢測待測豬基因組中SNP標記的基因型，根據基因型鑒定豬眼肌面積；所述SNP標記為位于10.2版豬參考基因組的豬17號染色體第47,077,245位核苷酸，其為T或C；TC基因型豬的眼肌面積高于TT基因型和CC基因型，TT基因型豬的眼肌面積高于CC基因型。本發明提供了與豬眼肌面積相關的SNP位點，并發現該SNP位于豬17號染色體第47,077,245核苷酸位點處，與豬的眼肌面積極顯著相關，通過檢測該SNP標記的不同基因型，可以用于豬眼肌面積的遺傳改良并改善豬肉品質。

技術領域

本發明屬于包含核酸的檢測方法領域，涉及一種鑒定或輔助鑒定豬眼肌面積的方法及應用。

背景技術

豬肉是人類飲食中動物蛋白的主要來源，其消費量占肉類消費的一半以上。對豬肉產量和品質的研究一直是畜牧學者關注的重點。眼肌面積是衡量豬肉用性能的重要指標，科學地開展豬眼肌面積的研究，對于改善豬肉品質具有重要意義。

豬生長發育主要由個體遺傳因素所決定，其中豬眼肌面積是遺傳力較高的性狀，與豬瘦肉率直接相關，同時也是豬遺傳育種工作中最主要的選擇指標之一。隨著一些直接活體掃描測量眼肌面積先進儀器設備的問世，為眼肌面積表型的測定提供了更為準確的方法，也為該性狀的選擇工作提供了關鍵的前期保障。

SNP(single?nucleotide?polymorphism)是由單堿基引起的突變，在基因組中廣泛分布，因此對SNP位點進行篩選和發掘具有非常重要的意義。近年來，越來越多的SNP位點被用于基因功能發掘、疾病控制和生長性能等關聯分析的相關研究中，相關SNP檢測技術也在不斷完善和發展。

發明內容

本發明的目的是提供與豬眼肌面積相關SNP標記的開發和利用方法，進而提供一種鑒定或輔助鑒定豬眼肌面積的方法及應用。

本發明提供一種鑒定或輔助鑒定豬眼肌面積的方法，所述方法包括：檢測待測豬基因組中SNP標記(命名為WU_10.2_17_47077245)的基因型；所述SNP標記為位于10.2版豬參考基因組的豬17號染色體第47,077,245位核苷酸(如序列1所示序列的第101位核苷酸，序列表中用y表示)，其為T或C；TC基因型豬的眼肌面積高于TT基因型和CC基因型，TT基因型豬的眼肌面積高于CC基因型；所述CC基因型為所述SNP為C的純合型；所述TC基因型為所述SNP為C和T的雜合型；所述TT基因型為所述SNP為T的純合型。

所述SNP標記WU_10.2_17_47077245為位于10.2版豬參考基因組的豬17號染色體上如序列1所示序列的第101位核苷酸，其為T或C(序列表中用Y表示)。

檢測所述的SNP標記的多態性或基因型的物質在鑒定或輔助鑒定豬眼肌面積中的應用也應在本發明的保護范圍之內。

其中，所述物質為SNP芯片。

檢測所述的SNP標記的多態性或基因型的物質在豬育種中的應用也應在本發明的保護范圍之內。

其中，所述物質為SNP芯片。

上述SNP芯片為Neogen公司的Neogen_POR80K芯片

其中，所述豬育種為培育豬眼肌面積大的豬品種。

本發明提供一種豬的育種方法，所述方法包括：檢測待測豬基因組中所述的SNP標記的基因型，選擇純合CC基因型與TT基因型的豬進行交配育種。

其中所述豬的育種為培育豬眼肌面積大的豬品種。

上述豬(待測豬)為長白豬、大白豬和杜洛克豬。