[發(fā)明專利]與番茄葉夾角大小緊密連鎖的SCAR標(biāo)記及其應(yīng)用

在審

• 申請(qǐng)?zhí)枺?/td>: 202211276633.6
• 申請(qǐng)日: 2022-10-18
• 公開（公告）號(hào): CN115976256A
• 公開（公告）日: 2023-04-18
• 發(fā)明（設(shè)計(jì)）人: 姜景彬;楊歡歡;張一堯;許向陽(yáng);李景富;趙婷婷;張賀;王傲雪;陳秀玲
• 申請(qǐng)（專利權(quán)）人: 東北農(nóng)業(yè)大學(xué)
• 主分類號(hào): C12Q1/6895
• 分類號(hào): C12Q1/6895;C12Q1/686;C12N15/11
• 代理公司: 重慶律知誠(chéng)專利代理事務(wù)所(普通合伙) 50281
• 代理人: 殷興旺;王俊超

本發(fā)明屬于分子標(biāo)記技術(shù)領(lǐng)域，具體涉及與番茄葉夾角大小緊密連鎖的SCAR標(biāo)記及其應(yīng)用。本發(fā)明鑒定得到一個(gè)與番茄葉夾角大小緊密連鎖的SCAR標(biāo)記，其序列如SEQ?ID?No.1和/或SEQ?ID?No.2所示。該標(biāo)記可以在番茄苗期快速鑒定葉片夾角大小的番茄株型情況，不需要等到番茄生長(zhǎng)后期株型穩(wěn)定，可以大大加快番茄夾角小、株型緊湊種質(zhì)資源的選育進(jìn)程。可用于番茄株型分子標(biāo)記輔助選擇育種，也將大大縮短番茄育種進(jìn)程，對(duì)番茄株型改良提供實(shí)踐依據(jù)。

技術(shù)領(lǐng)域

本發(fā)明屬于分子標(biāo)記技術(shù)領(lǐng)域，具體涉及與番茄葉夾角大小緊密連鎖的SCAR標(biāo)記及其應(yīng)用。

背景技術(shù)

20世紀(jì)60年代，Donald(1968)提出了理想株型的概念，即田間競(jìng)爭(zhēng)最小的株型，能最大限度的提升光能利用率，從而達(dá)到增加產(chǎn)量的目的。葉夾角指葉柄與主莖的夾角，是株型的主要構(gòu)成要素。葉夾角對(duì)株型的構(gòu)成主要影響株幅，通常葉夾角越小，株幅也就越小，可以提高植株的光合利用效率和種植密度，以達(dá)到提升單位面積的番茄產(chǎn)量的目的。目前，雖然劉星雨等(2020)已經(jīng)精確定位了兩個(gè)位于番茄10號(hào)染色體的番茄葉夾角主效QTL(LA1-1和LA1-2)，奠定了我國(guó)深入研究番茄葉夾角形成的遺傳機(jī)理的基礎(chǔ)，但我國(guó)關(guān)于株型育種的研究依然集中在玉米、小麥等大田作物上。有關(guān)番茄株型，尤其是葉夾角的研究主要集中于田間管理以及轉(zhuǎn)基因育種領(lǐng)域。傳統(tǒng)育種方法針對(duì)番茄株型的篩選較為困難，效率低，而結(jié)合分子標(biāo)記技術(shù)對(duì)番茄株型葉夾角性狀進(jìn)行的早期鑒定方法尚未見(jiàn)報(bào)道。

分子標(biāo)記輔助育種，是指結(jié)合分子標(biāo)記技術(shù)篩選并明確個(gè)體是否含有目的基因。其特點(diǎn)是利用個(gè)體DNA序列進(jìn)行選擇，從而規(guī)避環(huán)境等因素對(duì)植物生長(zhǎng)過(guò)程的影響，使選育得到的種子更具有遺傳穩(wěn)定性。采用篩選基因性狀的方式可以提高育種效率，加快育種的進(jìn)程。SCAR標(biāo)記是由RAPD，RFLP，SSR等分子標(biāo)記轉(zhuǎn)化得到的一種分子標(biāo)記，由于其無(wú)需酶切、簡(jiǎn)單高效、可重復(fù)性好等特點(diǎn)，已經(jīng)成為分子標(biāo)記輔助育種的首選標(biāo)記。開發(fā)用于番茄植株葉夾角早期鑒定的SCAR標(biāo)記具有重要的實(shí)際應(yīng)用價(jià)值。

發(fā)明內(nèi)容

本發(fā)明要解決的技術(shù)問(wèn)題是為番茄株型的早期篩選提供一種新選擇。

本發(fā)明的技術(shù)方案是與番茄葉夾角大小緊密連鎖的SCAR標(biāo)記，其序列如SEQ?IDNo.1和/或SEQ?ID?No.2所示。

本發(fā)明還提供所述SCAR標(biāo)記的擴(kuò)增引物對(duì)，其序列如SEQ?ID?No.3和SEQ?ID?No.4所示。

本發(fā)明還提供了所述SCAR標(biāo)記或引物對(duì)在番茄育種中的用途。

本發(fā)明還提供了所述SCAR標(biāo)記或引物對(duì)在鑒定番茄葉夾角大小中的用途。

本發(fā)明有益效果：本發(fā)明鑒定得到一個(gè)與番茄葉夾角大小緊密連鎖的SCAR標(biāo)記。該標(biāo)記可以在番茄苗期快速鑒定葉片夾角大小的番茄株型情況，不需要等到番茄生長(zhǎng)后期株型穩(wěn)定，可以大大加快番茄夾角小、株型緊湊種質(zhì)資源的選育進(jìn)程。此外，該SCAR標(biāo)記引物不需要酶切，只需要PCR一步法檢測(cè)，檢測(cè)成本低、準(zhǔn)確率較高等優(yōu)點(diǎn)，可較好的用于番茄節(jié)間株型分子標(biāo)記輔助選擇育種，通過(guò)提取番茄葉片、莖、根等植株中任意可取材的器官或組織的DNA，然后通過(guò)PCR的方法準(zhǔn)確地對(duì)番茄葉片夾角大小進(jìn)行鑒定，該發(fā)明提供的技術(shù)準(zhǔn)確性可以達(dá)到99％。可用于番茄株型分子標(biāo)記輔助選擇育種，也將大大縮短番茄育種進(jìn)程，對(duì)番茄株型改良提供實(shí)踐依據(jù)。

附圖說(shuō)明

圖1、番茄品種P₁(夾角小突變體)和P₂(夾角大野生型)的表型變異比較；A：番茄株型比較；B：夾角比較；C:番茄突變體P1和野生型品種P₂夾角統(tǒng)計(jì)分析，**代表差異極為顯著。