[發(fā)明專利]計(jì)算機(jī)可讀記錄介質(zhì)、特征量計(jì)算方法和特征量計(jì)算裝置

在審

• 申請(qǐng)?zhí)枺?/td>: 202211260719.X
• 申請(qǐng)日: 2022-10-14
• 公開(kāi)（公告）號(hào): CN116504332A
• 公開(kāi)（公告）日: 2023-07-28
• 發(fā)明（設(shè)計(jì)）人: 寺島千繪子
• 申請(qǐng)（專利權(quán)）人: 富士通株式會(huì)社
• 主分類號(hào): G16C20/70
• 分類號(hào): G16C20/70;G06F18/22;G06N20/00
• 代理公司: 北京集佳知識(shí)產(chǎn)權(quán)代理有限公司 11227
• 代理人: 王萍;崔俊紅

涉及計(jì)算機(jī)可讀記錄介質(zhì)、特征量計(jì)算方法和特征量計(jì)算裝置。一種存儲(chǔ)特征量計(jì)算程序的計(jì)算機(jī)可讀記錄介質(zhì)，特征量計(jì)算程序使計(jì)算機(jī)執(zhí)行處理，包括：接收結(jié)構(gòu)指定信息，結(jié)構(gòu)指定信息指示關(guān)于環(huán)狀分子的原子團(tuán)中的每個(gè)原子團(tuán)的類型和原子團(tuán)的序列，在環(huán)狀分子中被分類成多個(gè)類型的原子團(tuán)被循環(huán)按序排列；在多個(gè)類型中指定可選的第一類型和可選的第二類型；基于結(jié)構(gòu)指定信息，從原子團(tuán)中指定被分類為第一類型的第一原子團(tuán)中的一個(gè)或更多個(gè)第一原子團(tuán)和被分類為第二類型的第二原子團(tuán)中的一個(gè)或更多個(gè)第二原子團(tuán)；以及基于結(jié)構(gòu)指定信息，計(jì)算第一原子團(tuán)和第二原子團(tuán)的對(duì)的數(shù)目，在所述對(duì)中第一原子團(tuán)與第二原子團(tuán)之間在序列中的相互距離是某距離。

技術(shù)領(lǐng)域

實(shí)施方式涉及存儲(chǔ)特征量計(jì)算程序的非暫態(tài)計(jì)算機(jī)可讀存儲(chǔ)介質(zhì)、特征量計(jì)算方法和特征量計(jì)算裝置。

背景技術(shù)

近來(lái)，在藥物發(fā)現(xiàn)領(lǐng)域，機(jī)器學(xué)習(xí)作為用于搜索候選分子的方法已經(jīng)引起了關(guān)注，并且正在考慮基于分子結(jié)構(gòu)指定可以由機(jī)器學(xué)習(xí)處理的特征量的技術(shù)。

作為示例，例如，已知使用指紋作為特征量的方法、通過(guò)將分子序列視為具有起點(diǎn)和終點(diǎn)的結(jié)構(gòu)來(lái)表示特征量的方法等。

國(guó)際專利申請(qǐng)的日本國(guó)家公布第2012-509848號(hào)和國(guó)際專利申請(qǐng)的日本國(guó)家公布第2020-517290號(hào)作為相關(guān)技術(shù)公開(kāi)。

Tajimi等人的BMC?Bioinformatics?2018，19(增刊19)：527、X.Yang等人的Computational?and?Structural?Biotechnology?Journal?18(2020)153-161、以及Carhart等人的J.Chem.Inf.，1985也作為相關(guān)技術(shù)公開(kāi)。

發(fā)明內(nèi)容

技術(shù)問(wèn)題

在分子的部分結(jié)構(gòu)具有特定序列的情況下、在分子包括環(huán)狀結(jié)構(gòu)等的情況下，上面所描述的常規(guī)技術(shù)不足以高精度地將分子結(jié)構(gòu)反映到特征量。

在一個(gè)方面，本實(shí)施方式的目的是高精度地將分子結(jié)構(gòu)反映到特征量。

問(wèn)題的解決方案

根據(jù)實(shí)施方式的一個(gè)方面，存在一種存儲(chǔ)特征量計(jì)算程序的非暫態(tài)計(jì)算機(jī)可讀記錄介質(zhì)，該特征量計(jì)算程序用于使計(jì)算機(jī)執(zhí)行處理。在示例中，所述處理包括：接收結(jié)構(gòu)指定信息，該結(jié)構(gòu)指定信息指定關(guān)于環(huán)狀分子(cyclic?molecule)的多個(gè)原子團(tuán)中的每個(gè)原子團(tuán)的類型和多個(gè)原子團(tuán)的序列，其中在該環(huán)狀分子中，被分類成多個(gè)類型的多個(gè)原子團(tuán)被循環(huán)按序排列；在多個(gè)類型中指定可選的第一類型和可選的第二類型；基于結(jié)構(gòu)指定信息，從多個(gè)原子團(tuán)中指定被分類為第一類型的一個(gè)或多個(gè)第一原子團(tuán)和被分類為第二類型的一個(gè)或多個(gè)第二原子團(tuán)；以及基于結(jié)構(gòu)指定信息，計(jì)算第一原子團(tuán)和第二原子團(tuán)的對(duì)(pairs)的數(shù)目，在所述對(duì)中，第一原子團(tuán)與第二原子團(tuán)之間在序列中的相互距離是預(yù)定距離。

發(fā)明的有益效果

高精度地將分子結(jié)構(gòu)的特征反映到特征量。

附圖說(shuō)明

圖1是示出特征量計(jì)算裝置的示例的圖；

圖2(即，圖2A和圖2B)是用于示出第一實(shí)施方式的特征量的圖；

圖3是示出特征量計(jì)算裝置的硬件配置的示例的圖；

圖4是用于示出第一實(shí)施方式的特征量計(jì)算單元的功能的圖；

圖5(即，圖5A和圖5B)是用于示出結(jié)構(gòu)指定信息的圖；

圖6是用于示出第一實(shí)施方式的特征量計(jì)算裝置的處理的流程圖；

圖7A是用于示出使用特征量的處理的第一圖；

圖7B是用于示出使用特征量的處理的第二圖；

圖7C是用于示出使用特征量的處理的第三圖；