[發明專利]一種環境樣本DNA采集保存及非洲豬瘟病毒檢測方法在審
| 申請號: | 202211242422.0 | 申請日: | 2022-10-11 |
| 公開(公告)號: | CN115404267A | 公開(公告)日: | 2022-11-29 |
| 發明(設計)人: | 張紅云;嚴斯剛;陳秋英;陸志翔;羅廷榮;盧軍;覃春敏;韋青藏;王翠;黃鑫慧;梁競臻 | 申請(專利權)人: | 廣西大學;廣西璞締恩葳生物技術有限公司;柳州市動物疫病預防控制中心;柳州市柳江區動物疫病預防控制中心 |
| 主分類號: | C12Q1/6806 | 分類號: | C12Q1/6806;C12Q1/70;C12Q1/6851;C12R1/93 |
| 代理公司: | 廣西知華敏行專利代理事務所(普通合伙) 45139 | 代理人: | 陳引 |
| 地址: | 530000 廣西壯族*** | 國省代碼: | 廣西;45 |
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| 摘要: | |||
| 搜索關鍵詞: | 一種 環境 樣本 dna 采集 保存 非洲 豬瘟 病毒 檢測 方法 | ||
1.一種環境樣本DNA采集保存方法,其特征在于,包括以及步驟:
(1)準備制作DNA保護劑的材料:準備三羥甲基氨基甲烷、乙二胺四乙酸、氯化鈉、十二烷基硫酸鈉、山梨糖醇、葡甘聚糖以及超純水;
(2)制作DNA保護劑:將步驟(1)中所準備好的三羥甲基氨基甲烷、乙二胺四乙酸、氯化鈉、十二烷基硫酸鈉、山梨糖醇、葡甘聚糖全部依次放入超純水中,并通過攪拌使準備的原料全部溶于超純水中,定容之后獲得DNA保護劑;
(3)使用DNA保護劑:將步驟(2)中制作完成的DNA保護劑適量取出,并與收集到的環境樣本進行混合。
2.根據權利要求1所述的一種環境樣本DNA采集保存方法,其特征在于:所述步驟(1)中所準備的三羥甲基氨基甲烷、乙二胺四乙酸、氯化鈉、十二烷基硫酸鈉、山梨糖醇以及葡甘聚糖的含量分別為三羥甲基氨基甲烷80mm--110mm、乙二胺四乙酸90mm--120mm、氯化鈉8mm-12mm、十二烷基硫酸鈉0.2%--0.6%、山梨糖醇0.5%--1.3%以及葡甘聚糖0.5%--1.3%。
3.根據權利要求1所述的一種環境樣本DNA采集保存方法,其特征在于:所述步驟(2)中在將原料與超純水進行溶合之前,將超純水進行滅菌處理。
4.一種非洲豬瘟病毒檢測方法,其特征在于,包括以下步驟:
(1)準備材料:準備豬圓環病毒2型(PCV2)DNA、豬偽狂犬病毒(PRV)DNA和豬細小病毒(PPV)DNA,2×Taq PCR Mastermix(KT201-12)、普通瓊脂糖凝膠DNA回收試劑盒(DP209-02)、pLB零背景快連接試劑盒(VT205-01)、DH5α感受態細胞(CB101-01)和質粒小提試劑盒(DP103-02),DNA marker LD DS2000(LM1101)以及Animal Detection U+Probe MasterMix(QV110-01),LB和LA培養基;
(2)重組質粒標準品的構建與鑒定:用P72、CD2v和MGF的引物通過PCR從陽性DNA模板擴增相應基因片段;
(3)三重熒光定量PCR檢測方法的建立:選取大小差異明顯的P72、CD2v和MGF三個片段,用相應的引物和2×Taq PCR Mastermix配合使用,以步驟(2)中所敘述的三個重組質粒為陽性對照,驗證構建的陽性質粒;
(4)特異性實驗:以豬圓環病毒2型(PCV 2)DNA標準物質、豬偽狂犬病毒(PRV)DNA標準物質和豬細小病毒(PPV)DNA標準物質為模板,安裝步驟(3)的方法進行PCR擴增;
(5)敏感性實驗:將重組質粒質粒標準品10倍梯度(從1012-102copies/μL)稀釋后安裝步驟(3)中的方法以三個重組質粒為陽性對照;
(6)穩定性實驗:以上述不同濃度的質粒標準品混合物為模板,利用本研究建立的方法檢測,每個濃度做3個生物學重復,進行組內重復性分析。將上述試驗重復3次,進行組間重復性分析,計算變異系數,分析該方法的重復性。
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