[發明專利]細胞分割的圖像處理方法、裝置、計算機設備及存儲介質在審
| 申請號: | 202211201558.7 | 申請日: | 2022-09-29 |
| 公開(公告)號: | CN115760861A | 公開(公告)日: | 2023-03-07 |
| 發明(設計)人: | 張宸源;彭昱榕;魏彩霞;彭德志;曾敬富;王麗媛 | 申請(專利權)人: | 昆明金域醫學檢驗所有限公司 |
| 主分類號: | G06T7/10 | 分類號: | G06T7/10;G06T5/00;G06T3/40 |
| 代理公司: | 深圳市諾正鑫澤知識產權代理有限公司 44689 | 代理人: | 羅秦 |
| 地址: | 650200 云南省昆明市官渡區經開區洛羊街道辦事處新加坡產*** | 國省代碼: | 云南;53 |
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| 摘要: | |||
| 搜索關鍵詞: | 細胞 分割 圖像 處理 方法 裝置 計算機 設備 存儲 介質 | ||
本申請提供了一種細胞分割的圖像處理方法、裝置、計算機設備及存儲介質,通過對待處理的FISH圖像進行超分辨率重構,得到了細胞圖像邊緣分辨率更高的標準FISH圖像,同時基于腐蝕變換,消除標準FISH圖像中的噪點,此外利用分水嶺算法,對消除噪點的FISH圖像進行細胞分割,得到分割的細胞圖像,利用識別算法,對分割的細胞圖像內的信號點進行識別并計數。相較于人工對FISH圖像中細胞進行分割以及對信號點進行計數,本申請能大大提高細胞分割以及信號點計數的效率,也能避免因人工的主觀因素導致的錯誤。
技術領域
本申請涉及醫學圖像處理技術領域,特別涉及為一種細胞分割的圖像處理方法、裝置、計算機設備及存儲介質。
背景技術
熒光原位雜交(Fluorescence in situ hybridization,FISH)是20世紀80年代末在放射性原位雜交技術基礎上發展起來的一種非放射性分子生物學和細胞遺傳學結合的新技術,是以熒光標記取代同位素標記而形成的一種新的原位雜交方法,其利用熒光標記的特異核酸探針與細胞內相應的靶DNA分子或RNA分子雜交,通過在熒光顯微鏡或激光共聚焦掃描儀下觀察熒光信號,來確定與特異探針雜交后被染色的細胞或細胞器的形態和分布,或者是結合了熒光探針的DNA區域或RNA分子在染色體或其他細胞器中的定位。
在FISH檢測時,需要人工對FISH圖像中的粘連細胞進行分割分析,同時也需要人工對細胞內的信號點進行計數。而人工分割計數存在分割、計數效率低,以及人工分割、計數時容易出錯的問題。
發明內容
本發明的目的在于提供一種細胞分割的圖像處理方法,能夠解決上述人工分割計數存在分割、計數效率低,以及人工分割、計數時容易出錯的問題。
為了實現上述發明目的,本發明提供如下技術方案:
第一方面,提供了一種細胞分割的圖像處理方法,所述方法包括:
獲取待處理FISH圖像,所述待處理FISH圖像由圖像采集裝置采集,所述待處理FISH圖像中包括待分割細胞和位于待分割細胞內的信號點;
對待處理FISH圖像進行超分辨率重構,對待分割細胞的細胞圖像邊緣進行重構加強,獲取細胞圖像邊緣分辨率更高的標準FISH圖像;
基于腐蝕變換,消除標準FISH圖像中的噪點,獲取消除噪點的FISH圖像;
基于分水嶺算法,對消除噪點的FISH圖像進行細胞分割,所述細胞分割基于待分割細胞的細胞圖像邊緣進行識別,獲取分割的細胞圖像;
基于識別算法,對分割的細胞圖像內的信號點進行識別并計數。
第二方面,提供了一種致病病原體的預測裝置,包括:
獲取模塊,用于獲取待處理FISH圖像,所述待處理FISH圖像由圖像采集裝置采集,所述待處理FISH圖像中包括待分割細胞和位于待分割細胞內的信號點;
重構模塊,用于對待處理FISH圖像進行超分辨率重構,對待分割細胞的細胞圖像邊緣進行重構加強,獲取細胞圖像邊緣分辨率更高的標準FISH圖像;
消除模塊,用于基于腐蝕變換,消除標準FISH圖像中的噪點,獲取消除噪點的FISH圖像;
分割模塊,用于基于分水嶺算法,對消除噪點的FISH圖像進行細胞分割,所述細胞分割基于待分割細胞的細胞圖像邊緣進行識別,獲取分割的細胞圖像;
識別模塊,用于基于識別算法,對分割的細胞圖像內的信號點進行識別并計數。
第三方面,提供了一種計算機設備,包括存儲器和處理器,所述存儲器存儲有計算機程序,所述計算機程序被所述處理器執行時,使得所述處理器執行以下步驟:
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