[發(fā)明專利]基于肺部支氣管樹的分段方法及定位病灶的方法在審
| 申請?zhí)枺?/td> | 202211190905.0 | 申請日: | 2022-09-28 |
| 公開(公告)號: | CN115631141A | 公開(公告)日: | 2023-01-20 |
| 發(fā)明(設(shè)計(jì))人: | 唐武斌;王曉娜;肖建偉;易少平;薛利成;陳定苗 | 申請(專利權(quán))人: | 寧波市科技園區(qū)明天醫(yī)網(wǎng)科技有限公司 |
| 主分類號: | G06T7/00 | 分類號: | G06T7/00;G06V10/774;G06V10/82 |
| 代理公司: | 杭州斯可睿專利事務(wù)所有限公司 33241 | 代理人: | 周豪靖 |
| 地址: | 315040 浙江省寧*** | 國省代碼: | 浙江;33 |
| 權(quán)利要求書: | 查看更多 | 說明書: | 查看更多 |
| 摘要: | |||
| 搜索關(guān)鍵詞: | 基于 肺部 支氣管 分段 方法 定位 病灶 | ||
1.一種基于肺部支氣管樹的分段方法,其特征在于:在獲取肺部CT圖像后,通過計(jì)算實(shí)現(xiàn)對支氣管分叉點(diǎn)的標(biāo)記,根據(jù)樹的原理將標(biāo)記好的支氣管構(gòu)建多叉樹;然后通過以下步驟對多叉樹進(jìn)行肺段定位:
a)首先確定肺部氣管,即多叉樹的根節(jié)點(diǎn)是氣管,部分圖像由于氣管形狀彎曲,導(dǎo)致氣管被分為多段的情況,此時(shí)通過分叉點(diǎn)判定合并為一段;
b)由氣管的子節(jié)點(diǎn)找一級支氣管,即左、右主支氣管,確定左、右肺;
c)由左、右主支氣管的子節(jié)點(diǎn)確定出左肺上葉、左肺下葉、右肺上葉及對應(yīng)右肺向下分支,由右肺向下分支的子節(jié)點(diǎn)可以確定右肺中葉、右肺下葉;
d)由左肺上葉的子節(jié)點(diǎn)確定上支、舌段支氣管,進(jìn)而通過條件判斷確定左肺上葉尖后段支氣管、左肺上葉前段支氣管、左肺上葉上舌段支氣管、左肺上葉下舌段支氣管;
e)由左肺下葉的子節(jié)點(diǎn)先確定左肺下葉背段支氣管,進(jìn)而通過條件判斷確定左肺下葉前內(nèi)基底段支氣管、左肺下葉外基底段支氣管、左肺下葉后基底段支氣管;
f)由右肺上葉的子節(jié)點(diǎn)及條件判斷確定右肺上葉尖段支氣管、右肺上葉后段支氣管、右肺上葉前段支氣管;
g)由右肺中葉的子節(jié)點(diǎn)及條件判斷確定右肺中葉外側(cè)段支氣管、右肺中葉內(nèi)側(cè)段支氣管;
h)由右肺下葉的子節(jié)點(diǎn)先確定右肺下葉背段支氣管,再通過條件判斷確定出右肺下葉內(nèi)基底段支氣管、右肺下葉前基底段支氣管、右肺下葉外基底段支氣管、右肺下葉后基底段支氣管;
i)定位掩碼標(biāo)記,將右肺上葉尖段支氣管、右肺上葉后段支氣管、右肺上葉前段支氣管分別標(biāo)記為1、2、3,右肺中葉外側(cè)段支氣管、右肺中葉內(nèi)側(cè)段支氣管分別標(biāo)記為4、5,右肺下葉背段支氣管、右肺下葉內(nèi)基底段支氣管、右肺下葉前基底段支氣管、右肺下葉外基底段支氣管、右肺下葉后基底段支氣管分別標(biāo)記為6、7、8、9、10;將左肺上葉尖后段支氣管、左肺上葉前段支氣管、左肺上葉上舌段支氣管、左肺上葉下舌段支氣管分別標(biāo)記為11、12、13、14,左肺下葉背段支氣管、左肺下葉前內(nèi)基底段支氣管、左肺下葉外基底段支氣管、左肺下葉后基底段支氣管分別標(biāo)記為15、16、17、18;其余支氣管分支標(biāo)記為19。
2.根據(jù)權(quán)利要求1所述的基于肺部支氣管樹的分段方法,其特征在于:所述的構(gòu)建多叉樹是通過計(jì)算支氣管樹掩碼數(shù)組的連通區(qū)域排除模型生成除支氣管樹之外的其他小區(qū)域;然后,應(yīng)用卷積核為3×3的多維卷積找到支氣管樹分叉點(diǎn),形態(tài)學(xué)運(yùn)算提取肺部支氣管樹結(jié)構(gòu);再通過距離轉(zhuǎn)換,計(jì)算出圖像中非零點(diǎn)到最近背景點(diǎn)的距離,實(shí)現(xiàn)對支氣管分叉點(diǎn)的標(biāo)記。
3.一種利用如權(quán)利要求1或2所述的分段方法定位病灶的方法,其特征是,包括以下步驟:
A)通過分段方法得到分段數(shù)據(jù)后,準(zhǔn)備50例及以上肺部CT數(shù)據(jù)進(jìn)行反復(fù)執(zhí)行獲取支氣管樹分段訓(xùn)練數(shù)據(jù)集,生成支氣管樹分段模型;
B)將帶有病灶的肺部數(shù)據(jù)利用分段模型推理生成包含肺部18段支氣管的支氣管樹分段數(shù)據(jù);
C)應(yīng)用3d歐式距離計(jì)算病灶掩碼到18段支氣管的最短距離,輸出病灶所在的左右肺、肺葉、肺段的標(biāo)記,確定出病灶在肺部的具體位置。
4.根據(jù)權(quán)利要求3所述的定位病灶的方法,其特征在于所述的步驟A)分段訓(xùn)練方式是:首先對支氣管樹分段數(shù)據(jù)預(yù)處理,經(jīng)過裁剪、重采樣和正則化處理后的數(shù)據(jù)利用nnUnet框架訓(xùn)練1000次,為了輸入輸出尺寸相同,使用填充卷積來實(shí)現(xiàn),nnUnet根據(jù)需要自動(dòng)設(shè)置超參數(shù),初始通道數(shù)依據(jù)實(shí)驗(yàn)的需求設(shè)置為2n;上采樣使用反卷積操作,激活函數(shù)使用LeakyReLU;上下采樣每個(gè)卷積層分別執(zhí)行兩次卷積塊,除最底下的兩層外使用深監(jiān)督;所述的50例及以上肺部CT數(shù)據(jù)其中訓(xùn)練集、驗(yàn)證集比例為4:1,生成支氣管樹分段模型。
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