[發明專利]因果參數的確定方法、裝置、設備以及存儲介質

在審

• 申請號: 202211115933.6
• 申請日: 2022-09-14
• 公開（公告）號: CN115662510A
• 公開（公告）日: 2023-01-31
• 發明（設計）人: 柳一君;孫驥;孫慧妍;常毅
• 申請（專利權）人: 吉林大學
• 主分類號: G16B20/50
• 分類號: G16B20/50;G16B20/30;G16B25/10;G16B40/00
• 代理公司: 北京恒博知識產權代理有限公司 11528
• 代理人: 張曉芳

本申請公開了一種因果參數的確定方法、裝置、設備以及存儲介質，屬于計算機技術領域。通過本申請實施例提供的技術方案，對多個生物組織的基因表達數據進行處理，得到多個生物組織變為目標狀態的參考生物過程活性數據。對多個生物組織的體細胞突變數據、多個生物組織的第一類混雜因子數據以及參考生物過程活性數據進行編碼，得到第二類混雜因子數據，第一類混雜因子數據和第二類混雜因子數據具有不同的可觀測性。對第二類混雜因子數據進行解碼，就能夠得到多個生物組織變為目標狀態的目標生物過程活性數據。通過目標生物過程活性數據，能夠確定目標基因與目標狀態之間的因果參數，確定該因果參數的過程消除了混雜因子的混雜影響，準確性較高。

技術領域

本申請涉及計算機技術領域，特別涉及一種因果參數的確定方法、裝置、設備以及存儲介質。

背景技術

隨著計算機技術的發展，人們對基因的研究越來越深入，利用計算機技術能夠大大提高對基因進行研究的效率。生物組織的狀態發生變化可能是由于基因突變導致的，研究狀態與基因突變之間的關聯有著十分重大的意義。比如，大量的研究表明，癌癥通常是由于基因突變引起的。然而，由于各種技術限制，人們仍然不完全了解哪些基因突變導致癌癥的發生以及發展。

相關技術中，通常利用大量的多組學數據通過計算突變頻率來識別驅動癌癥的基因突變。但是，相關技術往往忽略了由于混雜因子的存在而產生的混雜偏差，導致預測基因突變和癌癥生物過程的狀態變化之間的因果關系的準確性較低。

發明內容

本申請實施例提供了一種因果參數的確定方法、裝置、設備以及存儲介質，可以提升預測基因突變和狀態變化之間的因果關系的準確性，所述技術方案如下：

一方面，提供了一種因果參數的確定方法，所述方法包括：

對多個生物組織的基因表達數據進行處理，得到所述多個生物組織變為目標狀態的參考生物過程活性數據，所述多個生物組織均攜帶目標基因且處于所述目標狀態；

對所述多個生物組織的體細胞突變數據、所述多個生物組織的第一類混雜因子數據以及所述參考生物過程活性數據進行編碼，得到所述多個生物組織的第二類混雜因子數據，所述第一類混雜因子數據和所述第二類混雜因子數據具有不同的可觀測性；

對所述多個生物組織的第二類混雜因子數據進行解碼，得到所述多個生物組織變為所述目標狀態的目標生物過程活性數據；

基于所述目標生物過程活性數據，確定所述目標基因與所述目標狀態之間的因果參數，所述因果參數用于表示所述目標基因發生突變導致生物組織處于所述目標狀態的可能性。

一方面，提供了一種因果參數的確定裝置，所述裝置包括：

參考生物過程數據獲取模塊，用于對多個生物組織的基因表達數據進行處理，得到所述多個生物組織變為目標狀態的參考生物過程活性數據，所述多個生物組織均攜帶目標基因且處于所述目標狀態；

編碼模塊，用于對所述多個生物組織的體細胞突變數據、所述多個生物組織的第一類混雜因子數據以及所述參考生物過程活性數據進行編碼，得到所述多個生物組織的第二類混雜因子數據，所述第一類混雜因子數據和所述第二類混雜因子數據具有不同的可觀測性；

解碼模塊，用于對所述多個生物組織的第二類混雜因子數據進行解碼，得到所述多個生物組織變為所述目標狀態的目標生物過程活性數據；

因果參數確定模塊，用于基于所述目標生物過程活性數據，確定所述目標基因與所述目標狀態之間的因果參數，所述因果參數用于表示所述目標基因發生突變導致生物組織處于所述目標狀態的可能性。