[發明專利]一種未分化脊柱關節病的腸型評分模型及構建方法和應用

在審

• 申請號: 202211111708.5
• 申請日: 2022-09-13
• 公開（公告）號: CN115662505A
• 公開（公告）日: 2023-01-31
• 發明（設計）人: 王琪;賀培鳳;張升校;喬軍;程婷;王燦;常敏靜;張一凡;宋珊;趙蓉
• 申請（專利權）人: 山西醫科大學
• 主分類號: G16B20/20
• 分類號: G16B20/20;G16B40/00;G16B40/30;G06F18/2135
• 代理公司: 太原申立德知識產權代理事務所(特殊普通合伙) 14115
• 代理人: 王芳

1.一種未分化脊柱關節病的腸型評分模型，其特征在于：通過挖掘uSpA樣本腸道菌群的特征，采用Dirichlet多項式混合無監督聚類描述微生物組數據的變異性，對uSpA腸道菌群分型為E1型和E2型；以LDA SCORE log10＞2為界，通過LEfSe篩選出不同腸型間基于屬水平的腸道微生物分類標志物；通過主成分分析PCA，分別提取兩個腸型各優勢菌的主成分PC1作為分類標志物的特征評分PC1i和PC1j，構建腸型的評分，具體計算公式如下：

腸型評分＝∑PC1i-∑PC1_j；

所述E1型的特征性菌為：土桿菌、GCA_900066575菌、毛螺菌科\FCS020\菌、瘤胃球菌、毛螺菌科\UCG\001菌、真桿菌科\腹菌、糞球菌、真桿菌\木霉菌、顫螺菌、嗜膽汁菌、毛螺菌科\UCG\003菌、CAG\56菌、毛螺菌科\UCG\010菌、科林塞拉、單球狀體、副甾體、多莉婭、真桿菌群、脫硫弧菌、UCG\003菌、毛螺菌科\ND3007\菌、丁基橡膠、真桿菌科\錫雷烏姆菌、臭細菌、RF39菌、倫布西亞、NK4A214\組、丹毒菌科UCG\003菌、阿克曼西亞、副卡特尼菌、巴內西拉、真桿菌反芻動物菌、UCG\005菌、CAG\352菌、桿菌\埃希菌、糞球菌、無桿菌、菊科\R\7\菌、毛螺菌科\NK4A136\菌、UCG\010、薔薇屬、UCG\002菌、撥號器菌、瘤胃球菌、下穹窿、真桿菌\共前列烷烯菌、梭狀芽孢桿菌UCG\014、阿利斯蒂普斯、普雷沃菌屬、糞桿菌；

E2型的特征性菌為：類桿菌、大腸桿菌志賀氏菌、腔隙桿菌、瘤胃球菌\gnavus菌、韋榮氏球菌屬、梭桿菌、腸球菌、相位弧菌、梭菌群、哈夫尼亞菌、拉赫諾斯皮拉、黃酮萃取菌、丹毒桿菌、梭狀芽孢桿菌、共右旋桿菌、薩特氏菌、艱難梭菌、亨加泰拉。

2.根據權利要求1所示的一種未分化脊柱關節病的腸型評分模型用于腸道微生物判別。