[發明專利]一組結腸癌DNA甲基化分子標志物及其在制備用于結腸癌早期診斷試劑盒中的應用

有效

• 申請號: 202211089666.X
• 申請日: 2022-09-07
• 公開（公告）號: CN116042820B
• 公開（公告）日: 2023-09-29
• 發明（設計）人: 陸燕;劉鵬淵;劉藝;穆罕默德·阿曼努拉;易佳妮;周莉媛
• 申請（專利權）人: 浙江大學
• 主分類號: C12Q1/6886
• 分類號: C12Q1/6886;G16B5/00;G16B30/10;G16B40/00;G16B50/00;G06N20/10
• 代理公司: 杭州求是專利事務所有限公司 33200
• 代理人: 萬尾甜;韓介梅

本發明公開了一組結腸癌的DNA甲基化分子標志物及其在制備用于結腸癌早期診斷試劑盒中的應用。所述的標志物是30個結腸癌甲基化特異性的CpG位點。這30個CpG位點包括cg06668555、cg06392169、cg18596362、cg13265789、cg21782409、cg04555373、cg01893212、cg04904331、cg12584684、cg04454951、cg04804539、cg20078466、cg09493505、cg05470523、cg19202058、cg00333226、cg15701178、cg01194057、cg01610488、cg07039180、cg04279973、cg06716730、cg18500968、cg03462053、cg05000488、cg14898779、cg14018648、cg19981409、cg05407490和cg0533134，分布在16個不同基因上：FAM135B、IRF4、CBLN2、UNC5C、NRG1、VWC2、MAL、IKZF1、TRPA1、PRKCB、DUSP14、TMPRSS3、KRT6A、STK31、ASGR1和NOX4。其中，有9個基因與結腸癌患者的生存率明顯相關，可用于制備結腸癌預后判斷試劑盒。本發明還公開了檢測所述DNA甲基化標志物的方法。本發明的DNA甲基化分子標志物具有良好的診斷指標特性，可以有效用于結腸癌診斷和預后，具有較高的臨床使用和推廣價值。

技術領域

本發明涉及生物檢測技術領域，具體涉及一組結腸癌的DNA甲基化分子標志物及其在制備用于結腸癌診斷試劑盒中的應用。

背景技術

結腸癌疾病的確切原因尚不清楚，然而，一些特定的危險因素與結腸癌高度相關，包括不健康飲食、大量飲酒和吸煙。此外，有結腸癌家族史或有某些遺傳性癌癥綜合征的人患此病的風險很高。細胞中的基因突變是結腸癌最常見的原因之一。由于缺乏有效的診斷方法，結腸癌在早期是不容易被發現的。

盡管已經有一些關于結腸癌的分子探索、生物標志物和治療靶點，這些對治療和診斷這種疾病有很大的貢獻，但由于生物的復雜性和較大的腫瘤個體差異性，目前急需具有更高穩定性和準確性的結腸癌標志物。

DNA甲基化是一種在基因調控中起重要作用的表觀遺傳標志物。異常的DNA甲基化修飾與許多疾病有關。并且，甲基化標志物比蛋白質標志物更穩定，這明確了癌癥特異性甲基化標志物具有巨大的潛力，可用于在臨床上準確診斷癌癥。但是，目前關于甲基化標志物在結腸癌中的應用較少，大多數找到的甲基化標志物均為特定基因中的啟動子或差異甲基化區域，這讓檢測過程復雜、檢測的成本也較高。

發明內容

本發明的目的在于通過甲基化測序數據和RNA-seq測序數據的整合分析，進一步結合機器學習方法，提供一組結腸癌DNA甲基化分子標志物及其在制備用于結腸癌早期診斷試劑盒中的應用。本發明選擇結腸癌DNA甲基化標志物的原則是：盡可能選出最具有標志性的位點，以降低檢測的復雜性和實驗成本。