[發明專利]基因啟動子區甲基化水平檢測試劑在制備ccRCC預后試劑中的應用及試劑盒

在審

• 申請號: 202211057501.4
• 申請日: 2022-08-30
• 公開（公告）號: CN115725739A
• 公開（公告）日: 2023-03-03
• 發明（設計）人: 鄧瓊;杜野;王鑄;王杰艷;陳業達;張建文;張穎;梁輝
• 申請（專利權）人: 深圳市龍華區人民醫院
• 主分類號: C12Q1/6886
• 分類號: C12Q1/6886
• 代理公司: 武漢大楚知識產權代理事務所(普通合伙) 42257
• 代理人: 楊旭瑞

本發明涉及涉及基因啟動子區甲基化水平檢測試劑在制備ccRCC預后試劑中的應用。在一個具體實施方案中，所述基因啟動子區甲基化水平檢測試劑為檢測以下位點的甲基化水平的檢測試劑：cg13965612、cg00869668、cg03933495、cg23067082、cg06303238、cg21655830、cg03021802、cg06941557、cg25598840、cg01286935、cg23462514、cg17367832、cg06577005、cg18210365、cg17868751、cg14947429、cg24332577、cg26728517。本發明通過構建出一個優于當前所有預后方法的針對ccRCC的預后模型，醫生可根據該預后模型指示的風險評分為患者提供最適的治療手段。

技術領域

本發明涉及ccRCC的診斷與預后領域，更特別的，涉及基因啟動子區甲基化水平檢測試劑在制備ccRCC預后試劑中的應用。

背景技術

腎透明細胞癌(ccRCC)是一種常見的腎細胞癌，占據了腎細胞癌的 80％-90％，具有較高的復發率、轉移率及死亡率。ccRCC是一種高度異質的腫瘤，具有從緩慢生長的局部腫瘤到向遠處轉移的侵襲性腫瘤等復雜多變的臨床表現。

目前，ccRCC的預后分析方法包括TNM分級、UISS評分、SSIGN評分以及Leibovich評分，然而這些分級和評分在很大程度上依賴于病理學家的經驗與主觀判斷。

ccRCC術后患者的預后判斷仍主要基于TNM分期。歐洲泌尿外科協會 (EAU)指南指出，術后預測系統、諾模圖(Nomogram)可能較常規的TNM 分期、Fuhrman分級對預后的預測更加準確。既往有一些ccRCC預后相關的 Nomogram研究，但多數只納入傳統的臨床信息，如腫瘤分期、分級等變量，并且僅關注模型的準確性，較少關注臨床獲益，從而無法全面評估模型的臨床應用價值。

Nomogram作為一種可視化的、具有臨床應用價值的醫學預測模型，可以提供更加準確且個性化的預后評估。Nomogram可以客觀評估新的預測變量。研究認為臨床癥狀與ccRCC患者預后有關，此結論在既往研究中存在爭議，這可能是因為病情較輕的患者往往無明顯的臨床癥狀。

既往有研究建立Nomogram來評估RCC患者預后，其中Karakiewicz PI 等的Nomogram較為經典且廣為引用。研究用于評估RCC患者術后的腫瘤特異性生存，其研究納入2474例患者，經單因素和多因素Cox回歸分析后，最終的Nomogram包括了腫瘤分期、Fuhrman分級、腫瘤大小和臨床癥狀，預測準確性為89％。但該研究納入變量較少，只分析傳統的腫瘤學特征，并未納人其他可能與預后有關的變量。Yaycioglu O等研究非轉移性RCC患者的無復發生存情況，發現年齡、性別、存在放射性淋巴結、臨床癥狀、腫瘤大小和臨床分期是預后相關預測因子，其最終構建的Nomogram的CI為0.747。

隨著分子生物學技術的發展，越來越多的分子標記被用于疾病的診斷和預后。但是，對于ccRCC而言，還缺少了足夠的差異甲基化位點，未能構建出有效的預后模型。因此，需要找到更多與ccRCC預后有關的分子標記，用來構建更可靠的ccRCC的預后模型。

發明內容

我們在研究中開發由18個差異甲基化位點構成的風險評分模型，并找出了高風險與低風險患者之間的風險評分切值，運用該風險評分模型和切值，可對ccRCC患者的治療和進展前景進行有效而準確的預測，優于當前所有關于ccRCC的預后方法。

基于以上工作，本發明提供了基因啟動子區甲基化水平檢測試劑在制備 ccRCC預后試劑中的應用。