[發(fā)明專利]太行雞開產(chǎn)日齡相關(guān)的數(shù)量性狀基因座及其應(yīng)用

有效

• 申請?zhí)枺?/td>: 202210998423.1
• 申請日: 2022-08-19
• 公開（公告）號(hào): CN115323063B
• 公開（公告）日: 2023-10-24
• 發(fā)明（設(shè)計(jì)）人: 褚素喬;謝艷華;桂蘊(yùn);王宇哲;牛旭達(dá);朱迪;周榮艷;倪慧勇;邱偉;姚慧敏
• 申請（專利權(quán)）人: 河北舒雋科技有限公司
• 主分類號(hào): C12Q1/6888
• 分類號(hào): C12Q1/6888;C12N15/11
• 代理公司: 河北冀華知識(shí)產(chǎn)權(quán)代理有限公司 13151
• 代理人: 侯迎新

本發(fā)明公開了一組太行雞開產(chǎn)日齡相關(guān)的數(shù)量性狀基因座，位于基因組的chr19:6 406 070?chr19:6 412 735區(qū)間內(nèi)，包括物理距離如下的顯著SNP位點(diǎn)當(dāng)中的一組或多組：19:6381462、19:6382350、19:6382585、19:6382662、19:6382781、19:6406070、19:6406141、19:6406152、19:6406169、19:6406170、19:6406188、19:6406306、19:6408239、19:6412674、19:6412735。本發(fā)明開發(fā)了一系列與蛋雞開產(chǎn)日齡相關(guān)的SNP位點(diǎn)，能夠用于開發(fā)與太行雞開產(chǎn)日齡相關(guān)的分子標(biāo)記及其引物，并進(jìn)一步用于太行雞的分子標(biāo)記輔助選擇育種，以獲得開產(chǎn)日齡更早的優(yōu)勢太行雞品種。

技術(shù)領(lǐng)域

本發(fā)明涉及分子生物學(xué)技術(shù)領(lǐng)域，尤其涉及與太行雞開產(chǎn)日齡相關(guān)的分子育種技術(shù)。

背景技術(shù)

我國雞肉、雞蛋生產(chǎn)及消費(fèi)水平均位于世界前列。近年來，家禽育種業(yè)進(jìn)入發(fā)展平穩(wěn)階段，需要尋求新的突破。通過傳統(tǒng)育種選擇，商業(yè)化蛋雞品系已達(dá)到很高的生產(chǎn)水平。產(chǎn)蛋性能是雞生產(chǎn)育種的重要經(jīng)濟(jì)性狀，是影響家禽業(yè)經(jīng)濟(jì)效益的重要因素之一。雖然，近幾十年來，通過常規(guī)育種方法針對產(chǎn)蛋性狀的選育卓有成效，然而，相比于其他生產(chǎn)性狀，需要付出更多的選育時(shí)間和代價(jià)，如何實(shí)現(xiàn)新的突破以及提高選育效率變得至關(guān)重要。因此，需要在動(dòng)物育種技術(shù)不斷革新的時(shí)期，完善家禽育種的遺傳改良體系，為家禽育種技術(shù)體系提供高精準(zhǔn)的理論指導(dǎo)和技術(shù)方法，促使我國家禽育種業(yè)的經(jīng)濟(jì)效益持續(xù)提升。

分子標(biāo)記是遺傳學(xué)研究的重要材料。單核苷酸多態(tài)性標(biāo)記因其數(shù)量多、分布廣泛、易于準(zhǔn)確鑒定等特點(diǎn)，被廣泛地應(yīng)用于人類和動(dòng)植物各項(xiàng)遺傳學(xué)研究，包括遺傳圖譜構(gòu)建，連鎖分析，關(guān)聯(lián)分析，基因組預(yù)測等。單核苷酸多態(tài)性(single nucleotide polymorphism，SNP)標(biāo)記是第三代遺傳標(biāo)記，是指在基因組DNA序列上有單個(gè)堿基的突變而產(chǎn)生的一種多態(tài)性，這種突變包括單堿基的顛換、轉(zhuǎn)換、插入和缺失。SNP具有量大、高頻率、低突變率等優(yōu)點(diǎn)，廣泛應(yīng)用于基因組分析、生物信息自動(dòng)化檢測、簡單和復(fù)雜疾病的遺傳研究、畜牧育種標(biāo)記及全球種族遺傳學(xué)等研究。SNP位點(diǎn)輔助選擇育種，是在分子水平上對目標(biāo)性狀進(jìn)行選擇，可以不受環(huán)境影響，通過遺傳背景選擇，減少連鎖累贅，從而加速育種過程及精準(zhǔn)度。

全基因組關(guān)聯(lián)分析(Genome-wide association studies，GWAS)是畜禽經(jīng)濟(jì)性狀遺傳改良和機(jī)理解析的重要方法。隨著二代測序技術(shù)的發(fā)展，全基因組重測序技術(shù)成為高通量SNP分型的有力工具，對于少數(shù)樣本的研究而言，通過高深度全基因組測序便可以充分獲取樣本基因組信息，然而對于群體遺傳學(xué)而言，目前高深度全基因組測序用于大規(guī)模樣本還過于昂貴。在這種背景下，研究人員摸索出了一種大樣本低深度重測序的新型測序策略。該策略首先對群體中所有個(gè)體進(jìn)行全基因組低深度測序和變異查找，之后根據(jù)SNP位點(diǎn)間的連鎖不平衡 (Linkage Disequilibrium, LD) 對缺失基因型進(jìn)行推斷，最終獲取大規(guī)模樣本全基因組水平的高密度遺傳標(biāo)記。

雞開產(chǎn)日齡是一個(gè)與繁殖和生長性能均有密切聯(lián)系的指標(biāo)，一般來說開產(chǎn)日齡和產(chǎn)蛋數(shù)呈現(xiàn)負(fù)相關(guān)，即開產(chǎn)越早，產(chǎn)蛋數(shù)目越多。若能夠篩選一種與母雞開產(chǎn)日齡顯著相關(guān)的SNP位點(diǎn)或SNP分子標(biāo)記，則有助于為蛋雞的標(biāo)記輔助選擇育種提供有利的理論依據(jù)。

發(fā)明內(nèi)容

本發(fā)明要解決的技術(shù)問題是提供太行雞開產(chǎn)日齡相關(guān)的數(shù)量性狀基因座及其應(yīng)用，在數(shù)量性狀基因座QTL區(qū)間內(nèi)包含多個(gè)極其顯著相關(guān)的單核苷酸多態(tài)性SNP位點(diǎn)。

為解決上述技術(shù)問題，本發(fā)明所采取的技術(shù)方案如下。