[發(fā)明專利]患有實(shí)體癌癥的患者的分類方法

在審

• 申請?zhí)枺?/td>: 202210976807.3
• 申請日: 2017-05-09
• 公開（公告）號: CN115198018A
• 公開（公告）日: 2022-10-18
• 發(fā)明（設(shè)計(jì)）人: 熱羅姆·加隆;貝恩哈德·米雷克尼克;弗蘭克·帕格斯
• 申請（專利權(quán)）人: 法國國家衛(wèi)生及研究醫(yī)學(xué)協(xié)會;索邦大學(xué);巴黎西岱大學(xué);公共事業(yè)救濟(jì)局-巴黎醫(yī)院
• 主分類號: C12Q1/6886
• 分類號: C12Q1/6886;G01N33/574;G16H50/20;G16H50/30
• 代理公司: 中原信達(dá)知識產(chǎn)權(quán)代理有限責(zé)任公司 11219
• 代理人: 楊青;郭翠霞

1.兩種或更多種生物標(biāo)志物在制備用于通過包括以下步驟的方法對患有實(shí)體癌癥的患者的存活時間進(jìn)行預(yù)后的試劑盒或裝置中的用途：

a)對所述兩種或更多種生物標(biāo)志物進(jìn)行定量，其中所述兩種或更多種生物標(biāo)志物指示所述患者針對所述癌癥的免疫應(yīng)答的狀態(tài)，并且在從所述患者獲得的腫瘤樣品中對每一種生物標(biāo)志物進(jìn)行定量；

b)將在步驟a)中對于所述兩種或更多種生物標(biāo)志物所獲得的每一個值與從患有所述癌癥的患者的參比組對于所述兩種或更多種生物標(biāo)志物中的每一種所獲得的值的分布進(jìn)行比較；

c)對于在步驟a)中對于所述兩種或更多種生物標(biāo)志物所獲得的每一個值確定與在步驟a)中獲得的值相對應(yīng)的分布的百分位數(shù)；

d)計(jì)算所述百分位數(shù)的算術(shù)平均值或中值；以及

e)將在步驟d)中獲得的所述百分位數(shù)的算術(shù)平均值或中值與百分位數(shù)的預(yù)定的參比算術(shù)平均值或預(yù)定的中值進(jìn)行比較，預(yù)定的參比值與存活時間有關(guān)；

其中所述兩種或更多種生物標(biāo)志物包括與免疫應(yīng)答相關(guān)的基因的表達(dá)。

2.兩種或更多種生物標(biāo)志物在制備用于通過包括以下步驟的方法評估患有實(shí)體癌癥的患者對抗腫瘤治療的響應(yīng)性的試劑盒或裝置中的用途：

a)對所述兩種或更多種生物標(biāo)志物進(jìn)行定量，其中所述兩種或更多種生物標(biāo)志物指示所述患者針對所述癌癥的免疫應(yīng)答的狀態(tài)，并且在從所述患者獲得的腫瘤樣品中對每一種生物標(biāo)志物進(jìn)行定量；

b)將在步驟a)中對于所述兩種或更多種生物標(biāo)志物所獲得的每一個值與從患有所述癌癥的患者的參比組對于所述兩種或更多種生物標(biāo)志物中的每一種所獲得的值的分布進(jìn)行比較；

c)對于在步驟a)中對于所述兩種或更多種生物標(biāo)志物所獲得的每一個值確定與在步驟a)中獲得的值相對應(yīng)的分布的百分位數(shù)；

d)計(jì)算所述百分位數(shù)的算術(shù)平均值或中值；以及

e)將在步驟d)中獲得的所述百分位數(shù)的算術(shù)平均值或中值與百分位數(shù)的預(yù)定的參比算術(shù)平均值或預(yù)定的中值進(jìn)行比較，預(yù)定的參比值與對所述抗腫瘤治療的響應(yīng)有關(guān)；

其中所述兩種或更多種生物標(biāo)志物包括與免疫應(yīng)答相關(guān)的基因的表達(dá)。

3.權(quán)利要求1或2的用途，其中所述實(shí)體癌癥是結(jié)腸直腸癌、乳腺癌、肺癌、頭頸部癌、膀胱癌、卵巢癌或前列腺癌。

4.權(quán)利要求3的用途，其中所述實(shí)體癌癥是結(jié)腸直腸癌。

5.權(quán)利要求1至4任一項(xiàng)的用途，其中所述兩種或更多種生物標(biāo)志物包括以下一種或多種基因的表達(dá)水平：CCR2、CD3D、CD3E、CD3G、CD8A、CXCL10、CXCL11、GZMA、GZMB、GZMK、GZMM、IL15、IRF1、PRF1、STAT1、CD69、ICOS、CXCR3、STAT4、CCL2和TBX21。

6.權(quán)利要求1至4任一項(xiàng)的用途，其中所述兩種或更多種生物標(biāo)志物包括以下一種或多種基因的表達(dá)水平：GZMH、IFNG、CXCL13、GNLY、LAG3、ITGAE、CCL5、CXCL9、PF4、IL17A、TSLP、REN、IHH、PROM1和VEGFA。

7.權(quán)利要求1至4任一項(xiàng)的用途，其中所述兩種或更多種生物標(biāo)志物包括代表人類適應(yīng)性免疫應(yīng)答的至少一種基因的表達(dá)水平和代表人類免疫抑制應(yīng)答的至少一種基因的表達(dá)水平。

8.權(quán)利要求7的用途，其中所述代表人類適應(yīng)性免疫應(yīng)答的至少一種基因選自：

CCL5
CCR2
CD247
CD3E
CD3G
CD8A
CX3CL1
CXCL11
GZMA
GZMB
GZMH
GZMK
IFNG
IL15
IRF1
ITGAE
PRF1
STAT1
TBX21

并且所述代表人類免疫抑制應(yīng)答的至少一種基因選自：

CD274
CTLA4
IHH
IL17A
PDCD1
PF4
PROM1
REN
TIM-3
TSLP
VEGF

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