[發明專利]一種與小麥苗期側根數目基因座緊密連鎖的分子標記及其應用

在審

• 申請號: 202210963002.5
• 申請日: 2022-08-11
• 公開（公告）號: CN116121431A
• 公開（公告）日: 2023-05-16
• 發明（設計）人: 王會芳;付曉鳳;張玉梅;齊彤
• 申請（專利權）人: 青島農業大學
• 主分類號: C12Q1/6895
• 分類號: C12Q1/6895;C12N15/11
• 代理公司: 石家莊輕拓知識產權代理事務所(普通合伙) 13128
• 代理人: 張培元

本發明公開了一種與小麥苗期側根數目基因座緊密連鎖的分子標記及其應用。所述分子標記的核苷酸為序列表中SEQ?ID?NO：1所示的序列；所述檢測引物的核苷酸為SEQ?ID?NO：2和SEQ?ID?NO：3所示的序列。本發明還包括一種輔助鑒定小麥苗期側根數目性狀的方法，根據所述分子標記的核苷酸序列設計引物，以被檢測小麥基因組DNA為模板進行擴增，并判斷擴增產物中是否存在該分子標記。本發明能夠用來檢測小麥品種/系中是否含有增加側根數目的QTL位點，能夠用于小麥優良根系構型的育種選育。

技術領域

本發明涉及生物技術領域，尤其是一種與小麥苗期側根數目主效QTL緊密連鎖的分子標記、其檢測引物及其在作物選種培育中的應用。

背景技術

小麥（Triticum?aestivum?L.）是我國第二大口糧作物，其產量和品質直接關系到國家糧食安全和人民生活水平。小麥根系是植株生長發育的基礎，也是吸收礦質元素和水分的重要器官，其形態數量性狀、活力與地上部生長發育及產量和品質具有密切關系。小麥能否獲得高產優質很大程度取決于根系生長發育情況。而側根作為決定小麥整體根系結構構成的主要因素之一，是小麥根系吸收網絡的重要組成部分，在固定植株、擴大根系吸收面積及增強根系生理功能等方面具有重要意義。

側根是一個受多基因控制的復雜數量性狀，而QTL定位是側根性狀育種中常用的研究方法，可以將不同的等位基因導入優良品種，通過分子育種產生所需要的根系表型。因此，研究小麥主效QTL定位及開發其緊密連鎖的分子標記，發掘側根數目的優異等位基因并將其利用于育種中，將有助于培育出根系活力較強的高產優質小麥新品種，保障我國糧食安全。

迄今，利用多個不同遺傳背景以及多個作圖群體在小麥不同染色體上已檢測到一些側根相關性狀QTL位點。但是研究所用遺傳群體和分子標記的差異，定位的側根相關性狀QTL置信區間較大，其連鎖標記距離目標基因較遠，加上遺傳背景等因素的影響，導致與側根性狀QTL連鎖的分子標記不能有效用于小麥根系育種。

發明內容

本發明要解決的技術問題是提供一種與小麥苗期側根數目基因座緊密連鎖的分子標記及其應用。

為解決上述技術問題，本發明所采取的技術方案如下。

一種分子標記，以苗期的小麥基因組?DNA?為模板，以SEQ?ID?NO：2和SEQ?ID?NO：3所示的人工核苷酸序列為引物對經?PCR?擴增得到。

一種分子標記，與小麥苗期側根數目的數量性狀基因座緊密連鎖，所述分子標記包含SEQ?ID?NO：1所示的序列。

一種分子標記，其核苷酸如SEQ?ID?NO：1所示。

上述的分子標記，所述數量性狀基因座為小麥苗期側根數目主效QTL? QLrn-5D。

包含上述分子標記的載體同樣在本發明的保護范圍之內。

包含上述分子標記的重組細胞同樣在本發明的保護范圍之內。

包含上述載體的重組細胞同樣在本發明的保護范圍之內。

一種引物對，用于擴增與小麥苗期側根數目主效QTL緊密連鎖的分子標記。

所述引物對的引物1的核苷酸為SEQ?ID?NO：2所示序列，引物2的核苷酸為SEQ?IDNO：3所示序列。

一種檢測試劑盒，包含上述引物對當中的一條或兩條。

一種輔助鑒定小麥苗期側根數目性狀的方法，包括以下步驟：根據上述分子標記的核苷酸序列設計引物，以被檢測小麥基因組?DNA?為模板進行擴增，并判斷擴增產物中是否存在該分子標記。

制備上述引物對的方法，包括將上述的兩條單鏈DNA分別單獨包裝的步驟。